Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZP4

Slc5a4b, MCG3105, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4bQ91ZP4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Slc5a4bQ91ZP4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
Slc5a4bQ91ZP4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
Slc5a4bQ91ZP4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
Slc5a4bQ91ZP4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC38.91■■■■□ 3.82
Slc5a4bQ91ZP4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Slc5a4bQ91ZP4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
Slc5a4bQ91ZP4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Slc5a4bQ91ZP4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
Slc5a4bQ91ZP4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Slc5a4bQ91ZP4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Slc5a4bQ91ZP4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
Slc5a4bQ91ZP4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Slc5a4bQ91ZP4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
Slc5a4bQ91ZP4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Slc5a4bQ91ZP4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
Slc5a4bQ91ZP4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Slc5a4bQ91ZP4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Slc5a4bQ91ZP4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC38.4■■■■□ 3.74
Slc5a4bQ91ZP4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
Slc5a4bQ91ZP4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
Slc5a4bQ91ZP4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Slc5a4bQ91ZP4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Slc5a4bQ91ZP4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC38.2■■■■□ 3.71
Slc5a4bQ91ZP4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
Slc5a4bQ91ZP4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Slc5a4bQ91ZP4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
Slc5a4bQ91ZP4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Slc5a4bQ91ZP4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
Slc5a4bQ91ZP4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Slc5a4bQ91ZP4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
Slc5a4bQ91ZP4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Slc5a4bQ91ZP4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Slc5a4bQ91ZP4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Slc5a4bQ91ZP4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
Slc5a4bQ91ZP4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Slc5a4bQ91ZP4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
Slc5a4bQ91ZP4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
Slc5a4bQ91ZP4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Slc5a4bQ91ZP4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Slc5a4bQ91ZP4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
Slc5a4bQ91ZP4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
Slc5a4bQ91ZP4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Slc5a4bQ91ZP4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Slc5a4bQ91ZP4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Slc5a4bQ91ZP4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Slc5a4bQ91ZP4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Slc5a4bQ91ZP4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Slc5a4bQ91ZP4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Slc5a4bQ91ZP4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Slc5a4bQ91ZP4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
Slc5a4bQ91ZP4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
Slc5a4bQ91ZP4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.66■■■■□ 3.62
Slc5a4bQ91ZP4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
Slc5a4bQ91ZP4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
Slc5a4bQ91ZP4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Slc5a4bQ91ZP4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Slc5a4bQ91ZP4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
Slc5a4bQ91ZP4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Slc5a4bQ91ZP4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Slc5a4bQ91ZP4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Slc5a4bQ91ZP4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Slc5a4bQ91ZP4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.6
Slc5a4bQ91ZP4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
Slc5a4bQ91ZP4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Slc5a4bQ91ZP4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Slc5a4bQ91ZP4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
Slc5a4bQ91ZP4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Slc5a4bQ91ZP4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Slc5a4bQ91ZP4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Slc5a4bQ91ZP4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Slc5a4bQ91ZP4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
Slc5a4bQ91ZP4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Slc5a4bQ91ZP4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Slc5a4bQ91ZP4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Slc5a4bQ91ZP4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Slc5a4bQ91ZP4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Slc5a4bQ91ZP4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Slc5a4bQ91ZP4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Slc5a4bQ91ZP4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Slc5a4bQ91ZP4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Slc5a4bQ91ZP4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Slc5a4bQ91ZP4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Slc5a4bQ91ZP4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Slc5a4bQ91ZP4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Slc5a4bQ91ZP4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Slc5a4bQ91ZP4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
Slc5a4bQ91ZP4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Slc5a4bQ91ZP4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Slc5a4bQ91ZP4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Slc5a4bQ91ZP4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Slc5a4bQ91ZP4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Slc5a4bQ91ZP4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Slc5a4bQ91ZP4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Slc5a4bQ91ZP4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Slc5a4bQ91ZP4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Slc5a4bQ91ZP4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Slc5a4bQ91ZP4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Slc5a4bQ91ZP4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms