Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Atl3Q91YH5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Atl3Q91YH5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Atl3Q91YH5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Atl3Q91YH5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Atl3Q91YH5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Atl3Q91YH5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Atl3Q91YH5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Atl3Q91YH5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Atl3Q91YH5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Atl3Q91YH5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Atl3Q91YH5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Atl3Q91YH5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Atl3Q91YH5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Atl3Q91YH5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Atl3Q91YH5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Atl3Q91YH5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Atl3Q91YH5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Atl3Q91YH5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Atl3Q91YH5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Atl3Q91YH5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Atl3Q91YH5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Atl3Q91YH5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Atl3Q91YH5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Atl3Q91YH5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Atl3Q91YH5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Atl3Q91YH5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Atl3Q91YH5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Atl3Q91YH5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Atl3Q91YH5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Atl3Q91YH5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Atl3Q91YH5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Atl3Q91YH5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Atl3Q91YH5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Atl3Q91YH5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Atl3Q91YH5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Atl3Q91YH5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Atl3Q91YH5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Atl3Q91YH5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Atl3Q91YH5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Atl3Q91YH5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Atl3Q91YH5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Atl3Q91YH5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Atl3Q91YH5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Atl3Q91YH5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Atl3Q91YH5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Atl3Q91YH5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Atl3Q91YH5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Atl3Q91YH5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Atl3Q91YH5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Atl3Q91YH5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Atl3Q91YH5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Atl3Q91YH5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Atl3Q91YH5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Atl3Q91YH5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Atl3Q91YH5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Atl3Q91YH5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Atl3Q91YH5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Atl3Q91YH5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
Atl3Q91YH5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Atl3Q91YH5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Atl3Q91YH5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Atl3Q91YH5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Atl3Q91YH5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Atl3Q91YH5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Atl3Q91YH5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Atl3Q91YH5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Atl3Q91YH5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Atl3Q91YH5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Atl3Q91YH5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Atl3Q91YH5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
Atl3Q91YH5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Atl3Q91YH5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Atl3Q91YH5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Atl3Q91YH5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Atl3Q91YH5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Atl3Q91YH5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Atl3Q91YH5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Atl3Q91YH5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Atl3Q91YH5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Atl3Q91YH5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Atl3Q91YH5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Atl3Q91YH5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Atl3Q91YH5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Atl3Q91YH5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Atl3Q91YH5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Atl3Q91YH5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Atl3Q91YH5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
Atl3Q91YH5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Atl3Q91YH5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Atl3Q91YH5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Atl3Q91YH5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Atl3Q91YH5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Atl3Q91YH5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Atl3Q91YH5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Atl3Q91YH5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Atl3Q91YH5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Atl3Q91YH5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Atl3Q91YH5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Atl3Q91YH5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms