Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW9

Zkscan3, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan3Q91VW9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Zkscan3Q91VW9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Zkscan3Q91VW9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Zkscan3Q91VW9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Zkscan3Q91VW9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Zkscan3Q91VW9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Zkscan3Q91VW9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Zkscan3Q91VW9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Zkscan3Q91VW9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Zkscan3Q91VW9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Zkscan3Q91VW9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Zkscan3Q91VW9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Zkscan3Q91VW9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Zkscan3Q91VW9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Zkscan3Q91VW9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Zkscan3Q91VW9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Zkscan3Q91VW9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Zkscan3Q91VW9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Zkscan3Q91VW9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Zkscan3Q91VW9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Zkscan3Q91VW9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Zkscan3Q91VW9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Zkscan3Q91VW9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Zkscan3Q91VW9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Zkscan3Q91VW9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Zkscan3Q91VW9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Zkscan3Q91VW9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zkscan3Q91VW9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zkscan3Q91VW9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zkscan3Q91VW9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Zkscan3Q91VW9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zkscan3Q91VW9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zkscan3Q91VW9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zkscan3Q91VW9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Zkscan3Q91VW9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Zkscan3Q91VW9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Zkscan3Q91VW9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Zkscan3Q91VW9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Zkscan3Q91VW9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Zkscan3Q91VW9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Zkscan3Q91VW9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Zkscan3Q91VW9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Zkscan3Q91VW9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zkscan3Q91VW9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Zkscan3Q91VW9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zkscan3Q91VW9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zkscan3Q91VW9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Zkscan3Q91VW9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zkscan3Q91VW9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Zkscan3Q91VW9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Zkscan3Q91VW9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Zkscan3Q91VW9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Zkscan3Q91VW9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Zkscan3Q91VW9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Zkscan3Q91VW9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Zkscan3Q91VW9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Zkscan3Q91VW9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Zkscan3Q91VW9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Zkscan3Q91VW9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Zkscan3Q91VW9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zkscan3Q91VW9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Zkscan3Q91VW9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Zkscan3Q91VW9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Zkscan3Q91VW9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Zkscan3Q91VW9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Zkscan3Q91VW9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Zkscan3Q91VW9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Zkscan3Q91VW9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Zkscan3Q91VW9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Zkscan3Q91VW9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Zkscan3Q91VW9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Zkscan3Q91VW9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Zkscan3Q91VW9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Zkscan3Q91VW9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Zkscan3Q91VW9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Zkscan3Q91VW9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Zkscan3Q91VW9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Zkscan3Q91VW9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Zkscan3Q91VW9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Zkscan3Q91VW9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Zkscan3Q91VW9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Zkscan3Q91VW9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Zkscan3Q91VW9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Zkscan3Q91VW9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Zkscan3Q91VW9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Zkscan3Q91VW9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Zkscan3Q91VW9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Zkscan3Q91VW9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Zkscan3Q91VW9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Zkscan3Q91VW9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Zkscan3Q91VW9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Zkscan3Q91VW9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Zkscan3Q91VW9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Zkscan3Q91VW9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Zkscan3Q91VW9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Zkscan3Q91VW9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Zkscan3Q91VW9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Zkscan3Q91VW9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Zkscan3Q91VW9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Zkscan3Q91VW9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
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