Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Cabp4Q8VHC5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
Cabp4Q8VHC5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Cabp4Q8VHC5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
Cabp4Q8VHC5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
Cabp4Q8VHC5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Cabp4Q8VHC5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Cabp4Q8VHC5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Cabp4Q8VHC5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Cabp4Q8VHC5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
Cabp4Q8VHC5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
Cabp4Q8VHC5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Cabp4Q8VHC5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
Cabp4Q8VHC5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Cabp4Q8VHC5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Cabp4Q8VHC5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
Cabp4Q8VHC5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Cabp4Q8VHC5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
Cabp4Q8VHC5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Cabp4Q8VHC5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Cabp4Q8VHC5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Cabp4Q8VHC5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Cabp4Q8VHC5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Cabp4Q8VHC5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Cabp4Q8VHC5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Cabp4Q8VHC5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Cabp4Q8VHC5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Cabp4Q8VHC5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Cabp4Q8VHC5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Cabp4Q8VHC5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Cabp4Q8VHC5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Cabp4Q8VHC5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Cabp4Q8VHC5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Cabp4Q8VHC5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Cabp4Q8VHC5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Cabp4Q8VHC5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Cabp4Q8VHC5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Cabp4Q8VHC5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Cabp4Q8VHC5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Cabp4Q8VHC5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
Cabp4Q8VHC5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Cabp4Q8VHC5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
Cabp4Q8VHC5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Cabp4Q8VHC5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Cabp4Q8VHC5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Cabp4Q8VHC5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Cabp4Q8VHC5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Cabp4Q8VHC5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Cabp4Q8VHC5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Cabp4Q8VHC5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Cabp4Q8VHC5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
Cabp4Q8VHC5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Cabp4Q8VHC5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Cabp4Q8VHC5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Cabp4Q8VHC5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Cabp4Q8VHC5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Cabp4Q8VHC5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Cabp4Q8VHC5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Cabp4Q8VHC5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Cabp4Q8VHC5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Cabp4Q8VHC5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Cabp4Q8VHC5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
Cabp4Q8VHC5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Cabp4Q8VHC5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Cabp4Q8VHC5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Cabp4Q8VHC5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Cabp4Q8VHC5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Cabp4Q8VHC5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Cabp4Q8VHC5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Cabp4Q8VHC5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Cabp4Q8VHC5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Cabp4Q8VHC5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Cabp4Q8VHC5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Cabp4Q8VHC5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Cabp4Q8VHC5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
Cabp4Q8VHC5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Cabp4Q8VHC5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Cabp4Q8VHC5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Cabp4Q8VHC5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Cabp4Q8VHC5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Cabp4Q8VHC5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Cabp4Q8VHC5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Cabp4Q8VHC5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
Cabp4Q8VHC5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
Cabp4Q8VHC5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Cabp4Q8VHC5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Cabp4Q8VHC5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
Cabp4Q8VHC5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Cabp4Q8VHC5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Cabp4Q8VHC5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Cabp4Q8VHC5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Cabp4Q8VHC5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
Cabp4Q8VHC5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Cabp4Q8VHC5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Cabp4Q8VHC5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Cabp4Q8VHC5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Cabp4Q8VHC5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Cabp4Q8VHC5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Cabp4Q8VHC5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Cabp4Q8VHC5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms