Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,92■■■■■ 4,62
Cul7Q8VE73 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,91■■■■■ 4,62
Cul7Q8VE73 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC43,9■■■■■ 4,62
Cul7Q8VE73 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43,81■■■■■ 4,6
Cul7Q8VE73 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC43,81■■■■■ 4,6
Cul7Q8VE73 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC43,79■■■■■ 4,6
Cul7Q8VE73 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC43,76■■■■■ 4,6
Cul7Q8VE73 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC43,72■■■■■ 4,59
Cul7Q8VE73 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43,69■■■■■ 4,58
Cul7Q8VE73 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,68■■■■■ 4,58
Cul7Q8VE73 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43,66■■■■■ 4,58
Cul7Q8VE73 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,64■■■■■ 4,58
Cul7Q8VE73 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,59■■■■■ 4,57
Cul7Q8VE73 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,57■■■■■ 4,57
Cul7Q8VE73 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,52■■■■■ 4,56
Cul7Q8VE73 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,4■■■■■ 4,54
Cul7Q8VE73 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,39■■■■■ 4,54
Cul7Q8VE73 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,37■■■■■ 4,53
Cul7Q8VE73 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC43,34■■■■■ 4,53
Cul7Q8VE73 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,26■■■■■ 4,52
Cul7Q8VE73 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC43,26■■■■■ 4,52
Cul7Q8VE73 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC43,24■■■■■ 4,51
Cul7Q8VE73 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,21■■■■■ 4,51
Cul7Q8VE73 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC43,15■■■■■ 4,5
Cul7Q8VE73 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC43,14■■■■■ 4,5
Cul7Q8VE73 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC43,12■■■■■ 4,49
Cul7Q8VE73 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,11■■■■■ 4,49
Cul7Q8VE73 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC43,1■■■■■ 4,49
Cul7Q8VE73 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC43,08■■■■■ 4,49
Cul7Q8VE73 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,04■■■■■ 4,48
Cul7Q8VE73 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,03■■■■■ 4,48
Cul7Q8VE73 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,02■■■■■ 4,48
Cul7Q8VE73 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC43,02■■■■■ 4,48
Cul7Q8VE73 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,01■■■■■ 4,48
Cul7Q8VE73 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,99■■■■■ 4,47
Cul7Q8VE73 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,96■■■■■ 4,47
Cul7Q8VE73 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC42,94■■■■■ 4,46
Cul7Q8VE73 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC42,92■■■■■ 4,46
Cul7Q8VE73 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC42,9■■■■■ 4,46
Cul7Q8VE73 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,89■■■■■ 4,46
Cul7Q8VE73 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42,86■■■■■ 4,45
Cul7Q8VE73 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC42,81■■■■■ 4,44
Cul7Q8VE73 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC42,81■■■■■ 4,44
Cul7Q8VE73 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC42,79■■■■■ 4,44
Cul7Q8VE73 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC42,79■■■■■ 4,44
Cul7Q8VE73 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC42,75■■■■■ 4,43
Cul7Q8VE73 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC42,72■■■■■ 4,43
Cul7Q8VE73 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42,72■■■■■ 4,43
Cul7Q8VE73 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC42,69■■■■■ 4,42
Cul7Q8VE73 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC42,67■■■■■ 4,42
Cul7Q8VE73 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,62■■■■■ 4,41
Cul7Q8VE73 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,59■■■■■ 4,41
Cul7Q8VE73 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC42,59■■■■■ 4,41
Cul7Q8VE73 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,56■■■■■ 4,4
Cul7Q8VE73 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42,55■■■■■ 4,4
Cul7Q8VE73 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,53■■■■■ 4,4
Cul7Q8VE73 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC42,52■■■■■ 4,4
Cul7Q8VE73 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC42,48■■■■■ 4,39
Cul7Q8VE73 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC42,44■■■■■ 4,38
Cul7Q8VE73 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,43■■■■■ 4,38
Cul7Q8VE73 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,4■■■■■ 4,38
Cul7Q8VE73 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42,39■■■■■ 4,38
Cul7Q8VE73 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC42,37■■■■■ 4,37
Cul7Q8VE73 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,36■■■■■ 4,37
Cul7Q8VE73 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,36■■■■■ 4,37
Cul7Q8VE73 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC42,31■■■■■ 4,36
Cul7Q8VE73 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42,31■■■■■ 4,36
Cul7Q8VE73 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,27■■■■■ 4,36
Cul7Q8VE73 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC42,26■■■■■ 4,36
Cul7Q8VE73 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC42,22■■■■■ 4,35
Cul7Q8VE73 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42,22■■■■■ 4,35
Cul7Q8VE73 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC42,22■■■■■ 4,35
Cul7Q8VE73 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC42,17■■■■■ 4,34
Cul7Q8VE73 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42,15■■■■■ 4,34
Cul7Q8VE73 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,11■■■■■ 4,33
Cul7Q8VE73 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC42,07■■■■■ 4,32
Cul7Q8VE73 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42,01■■■■■ 4,32
Cul7Q8VE73 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42,01■■■■■ 4,32
Cul7Q8VE73 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC42■■■■■ 4,31
Cul7Q8VE73 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC41,97■■■■■ 4,31
Cul7Q8VE73 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC41,96■■■■■ 4,31
Cul7Q8VE73 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,96■■■■■ 4,31
Cul7Q8VE73 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41,96■■■■■ 4,31
Cul7Q8VE73 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41,95■■■■■ 4,31
Cul7Q8VE73 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC41,89■■■■■ 4,3
Cul7Q8VE73 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC41,88■■■■■ 4,3
Cul7Q8VE73 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC41,88■■■■■ 4,3
Cul7Q8VE73 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC41,85■■■■■ 4,29
Cul7Q8VE73 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC41,85■■■■■ 4,29
Cul7Q8VE73 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC41,84■■■■■ 4,29
Cul7Q8VE73 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41,83■■■■■ 4,29
Cul7Q8VE73 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,82■■■■■ 4,28
Cul7Q8VE73 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC41,79■■■■■ 4,28
Cul7Q8VE73 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,79■■■■■ 4,28
Cul7Q8VE73 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,76■■■■■ 4,28
Cul7Q8VE73 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC41,75■■■■■ 4,27
Cul7Q8VE73 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,72■■■■■ 4,27
Cul7Q8VE73 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC41,72■■■■■ 4,27
Cul7Q8VE73 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41,71■■■■■ 4,27
Cul7Q8VE73 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC41,69■■■■■ 4,26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9,9 ms