Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Uhrf1Q8VDF2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Uhrf1Q8VDF2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Uhrf1Q8VDF2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Uhrf1Q8VDF2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Uhrf1Q8VDF2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Uhrf1Q8VDF2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Uhrf1Q8VDF2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Uhrf1Q8VDF2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Uhrf1Q8VDF2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Uhrf1Q8VDF2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Uhrf1Q8VDF2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Uhrf1Q8VDF2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Uhrf1Q8VDF2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Uhrf1Q8VDF2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Uhrf1Q8VDF2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Uhrf1Q8VDF2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Uhrf1Q8VDF2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Uhrf1Q8VDF2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Uhrf1Q8VDF2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Uhrf1Q8VDF2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Uhrf1Q8VDF2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Uhrf1Q8VDF2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Uhrf1Q8VDF2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Uhrf1Q8VDF2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Uhrf1Q8VDF2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Uhrf1Q8VDF2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Uhrf1Q8VDF2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Uhrf1Q8VDF2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Uhrf1Q8VDF2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Uhrf1Q8VDF2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Uhrf1Q8VDF2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Uhrf1Q8VDF2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Uhrf1Q8VDF2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Uhrf1Q8VDF2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Uhrf1Q8VDF2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Uhrf1Q8VDF2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Uhrf1Q8VDF2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Uhrf1Q8VDF2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Uhrf1Q8VDF2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Uhrf1Q8VDF2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Uhrf1Q8VDF2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Uhrf1Q8VDF2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Uhrf1Q8VDF2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Uhrf1Q8VDF2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Uhrf1Q8VDF2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Uhrf1Q8VDF2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Uhrf1Q8VDF2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Uhrf1Q8VDF2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Uhrf1Q8VDF2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Uhrf1Q8VDF2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Uhrf1Q8VDF2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Uhrf1Q8VDF2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Uhrf1Q8VDF2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Uhrf1Q8VDF2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Uhrf1Q8VDF2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Uhrf1Q8VDF2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Uhrf1Q8VDF2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Uhrf1Q8VDF2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Uhrf1Q8VDF2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Uhrf1Q8VDF2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Uhrf1Q8VDF2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Uhrf1Q8VDF2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Uhrf1Q8VDF2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Uhrf1Q8VDF2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Uhrf1Q8VDF2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Uhrf1Q8VDF2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Uhrf1Q8VDF2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Uhrf1Q8VDF2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Uhrf1Q8VDF2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Uhrf1Q8VDF2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Uhrf1Q8VDF2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Uhrf1Q8VDF2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Uhrf1Q8VDF2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Uhrf1Q8VDF2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Uhrf1Q8VDF2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Uhrf1Q8VDF2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Uhrf1Q8VDF2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Uhrf1Q8VDF2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Uhrf1Q8VDF2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Uhrf1Q8VDF2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Uhrf1Q8VDF2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Uhrf1Q8VDF2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Uhrf1Q8VDF2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Uhrf1Q8VDF2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Uhrf1Q8VDF2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Uhrf1Q8VDF2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Uhrf1Q8VDF2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Uhrf1Q8VDF2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Uhrf1Q8VDF2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Uhrf1Q8VDF2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Uhrf1Q8VDF2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Uhrf1Q8VDF2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Uhrf1Q8VDF2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Uhrf1Q8VDF2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Uhrf1Q8VDF2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Uhrf1Q8VDF2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Uhrf1Q8VDF2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Uhrf1Q8VDF2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Uhrf1Q8VDF2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
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