Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC33

Nxnl1, Nucleoredoxin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxnl1Q8VC33 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,15■■■□□ 2,26
Nxnl1Q8VC33 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Nxnl1Q8VC33 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29,14■■■□□ 2,26
Nxnl1Q8VC33 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Nxnl1Q8VC33 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29,1■■■□□ 2,25
Nxnl1Q8VC33 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Nxnl1Q8VC33 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Nxnl1Q8VC33 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29,05■■■□□ 2,24
Nxnl1Q8VC33 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Nxnl1Q8VC33 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,04■■■□□ 2,24
Nxnl1Q8VC33 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29,02■■■□□ 2,24
Nxnl1Q8VC33 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28,97■■■□□ 2,23
Nxnl1Q8VC33 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Nxnl1Q8VC33 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Nxnl1Q8VC33 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Nxnl1Q8VC33 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28,86■■■□□ 2,21
Nxnl1Q8VC33 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Nxnl1Q8VC33 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28,74■■■□□ 2,19
Nxnl1Q8VC33 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28,71■■■□□ 2,19
Nxnl1Q8VC33 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Nxnl1Q8VC33 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Nxnl1Q8VC33 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Nxnl1Q8VC33 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Nxnl1Q8VC33 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Nxnl1Q8VC33 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Nxnl1Q8VC33 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Nxnl1Q8VC33 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28,55■■■□□ 2,16
Nxnl1Q8VC33 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28,53■■■□□ 2,16
Nxnl1Q8VC33 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28,52■■■□□ 2,16
Nxnl1Q8VC33 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Nxnl1Q8VC33 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Nxnl1Q8VC33 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28,42■■■□□ 2,14
Nxnl1Q8VC33 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28,42■■■□□ 2,14
Nxnl1Q8VC33 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Nxnl1Q8VC33 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Nxnl1Q8VC33 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Nxnl1Q8VC33 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Nxnl1Q8VC33 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Nxnl1Q8VC33 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Nxnl1Q8VC33 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28,36■■■□□ 2,13
Nxnl1Q8VC33 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Nxnl1Q8VC33 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Nxnl1Q8VC33 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Nxnl1Q8VC33 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Nxnl1Q8VC33 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,12
Nxnl1Q8VC33 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Nxnl1Q8VC33 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Nxnl1Q8VC33 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Nxnl1Q8VC33 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28,24■■■□□ 2,11
Nxnl1Q8VC33 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28,23■■■□□ 2,11
Nxnl1Q8VC33 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,22■■■□□ 2,11
Nxnl1Q8VC33 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,19■■■□□ 2,1
Nxnl1Q8VC33 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Nxnl1Q8VC33 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Nxnl1Q8VC33 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Nxnl1Q8VC33 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Nxnl1Q8VC33 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Nxnl1Q8VC33 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Nxnl1Q8VC33 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28,05■■■□□ 2,08
Nxnl1Q8VC33 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Nxnl1Q8VC33 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Nxnl1Q8VC33 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,99■■■□□ 2,07
Nxnl1Q8VC33 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Nxnl1Q8VC33 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Nxnl1Q8VC33 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27,95■■■□□ 2,06
Nxnl1Q8VC33 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27,94■■■□□ 2,06
Nxnl1Q8VC33 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27,91■■■□□ 2,06
Nxnl1Q8VC33 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27,91■■■□□ 2,06
Nxnl1Q8VC33 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Nxnl1Q8VC33 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Nxnl1Q8VC33 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Nxnl1Q8VC33 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Nxnl1Q8VC33 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Nxnl1Q8VC33 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Nxnl1Q8VC33 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,8■■■□□ 2,04
Nxnl1Q8VC33 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Nxnl1Q8VC33 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Nxnl1Q8VC33 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Nxnl1Q8VC33 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Nxnl1Q8VC33 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Nxnl1Q8VC33 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Nxnl1Q8VC33 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27,7■■■□□ 2,03
Nxnl1Q8VC33 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Nxnl1Q8VC33 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27,68■■■□□ 2,02
Nxnl1Q8VC33 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Nxnl1Q8VC33 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Nxnl1Q8VC33 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Nxnl1Q8VC33 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Nxnl1Q8VC33 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27,66■■■□□ 2,02
Nxnl1Q8VC33 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27,63■■■□□ 2,01
Nxnl1Q8VC33 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Nxnl1Q8VC33 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27,62■■■□□ 2,01
Nxnl1Q8VC33 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27,62■■■□□ 2,01
Nxnl1Q8VC33 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27,6■■■□□ 2,01
Nxnl1Q8VC33 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Nxnl1Q8VC33 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27,58■■■□□ 2,01
Nxnl1Q8VC33 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Nxnl1Q8VC33 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,55■■■□□ 2
Nxnl1Q8VC33 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27,53■■■□□ 2
Nxnl1Q8VC33 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27,52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76,5 ms