Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,6■■■■□ 3,45
ApobrQ8VBT6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC36,59■■■■□ 3,45
ApobrQ8VBT6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,51■■■■□ 3,44
ApobrQ8VBT6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,43■■■■□ 3,42
ApobrQ8VBT6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,42■■■■□ 3,42
ApobrQ8VBT6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,39■■■■□ 3,42
ApobrQ8VBT6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,38■■■■□ 3,41
ApobrQ8VBT6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC36,37■■■■□ 3,41
ApobrQ8VBT6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,34■■■■□ 3,41
ApobrQ8VBT6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,29■■■■□ 3,4
ApobrQ8VBT6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,26■■■■□ 3,4
ApobrQ8VBT6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC36,25■■■■□ 3,39
ApobrQ8VBT6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,24■■■■□ 3,39
ApobrQ8VBT6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,22■■■■□ 3,39
ApobrQ8VBT6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC36,2■■■■□ 3,39
ApobrQ8VBT6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,19■■■■□ 3,38
ApobrQ8VBT6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC36,19■■■■□ 3,38
ApobrQ8VBT6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,08■■■■□ 3,37
ApobrQ8VBT6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC36,04■■■■□ 3,36
ApobrQ8VBT6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC36,03■■■■□ 3,36
ApobrQ8VBT6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,97■■■■□ 3,35
ApobrQ8VBT6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,96■■■■□ 3,35
ApobrQ8VBT6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,96■■■■□ 3,35
ApobrQ8VBT6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,95■■■■□ 3,35
ApobrQ8VBT6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,88■■■■□ 3,33
ApobrQ8VBT6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,87■■■■□ 3,33
ApobrQ8VBT6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC35,84■■■■□ 3,33
ApobrQ8VBT6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC35,82■■■■□ 3,32
ApobrQ8VBT6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC35,8■■■■□ 3,32
ApobrQ8VBT6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC35,79■■■■□ 3,32
ApobrQ8VBT6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC35,78■■■■□ 3,32
ApobrQ8VBT6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC35,78■■■■□ 3,32
ApobrQ8VBT6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC35,76■■■■□ 3,32
ApobrQ8VBT6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,75■■■■□ 3,31
ApobrQ8VBT6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,72■■■■□ 3,31
ApobrQ8VBT6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35,72■■■■□ 3,31
ApobrQ8VBT6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,71■■■■□ 3,31
ApobrQ8VBT6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC35,68■■■■□ 3,3
ApobrQ8VBT6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC35,67■■■■□ 3,3
ApobrQ8VBT6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC35,64■■■■□ 3,3
ApobrQ8VBT6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35,63■■■■□ 3,29
ApobrQ8VBT6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,61■■■■□ 3,29
ApobrQ8VBT6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC35,6■■■■□ 3,29
ApobrQ8VBT6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC35,57■■■■□ 3,28
ApobrQ8VBT6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35,56■■■■□ 3,28
ApobrQ8VBT6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,55■■■■□ 3,28
ApobrQ8VBT6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC35,54■■■■□ 3,28
ApobrQ8VBT6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,46■■■■□ 3,27
ApobrQ8VBT6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC35,45■■■■□ 3,27
ApobrQ8VBT6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35,45■■■■□ 3,27
ApobrQ8VBT6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC35,38■■■■□ 3,25
ApobrQ8VBT6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC35,38■■■■□ 3,25
ApobrQ8VBT6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC35,29■■■■□ 3,24
ApobrQ8VBT6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,29■■■■□ 3,24
ApobrQ8VBT6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,29■■■■□ 3,24
ApobrQ8VBT6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC35,28■■■■□ 3,24
ApobrQ8VBT6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC35,26■■■■□ 3,24
ApobrQ8VBT6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,22■■■■□ 3,23
ApobrQ8VBT6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,21■■■■□ 3,23
ApobrQ8VBT6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,2■■■■□ 3,23
ApobrQ8VBT6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,2■■■■□ 3,23
ApobrQ8VBT6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,2■■■■□ 3,22
ApobrQ8VBT6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,15■■■■□ 3,22
ApobrQ8VBT6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35,15■■■■□ 3,22
ApobrQ8VBT6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,12■■■■□ 3,21
ApobrQ8VBT6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC35,09■■■■□ 3,21
ApobrQ8VBT6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,09■■■■□ 3,21
ApobrQ8VBT6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC35,08■■■■□ 3,21
ApobrQ8VBT6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,08■■■■□ 3,21
ApobrQ8VBT6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC35,04■■■■□ 3,2
ApobrQ8VBT6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,03■■■■□ 3,2
ApobrQ8VBT6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,03■■■■□ 3,2
ApobrQ8VBT6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,02■■■■□ 3,2
ApobrQ8VBT6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,92■■■■□ 3,18
ApobrQ8VBT6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC34,89■■■■□ 3,18
ApobrQ8VBT6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34,89■■■■□ 3,18
ApobrQ8VBT6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC34,85■■■■□ 3,17
ApobrQ8VBT6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC34,83■■■■□ 3,17
ApobrQ8VBT6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34,83■■■■□ 3,17
ApobrQ8VBT6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC34,82■■■■□ 3,16
ApobrQ8VBT6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34,81■■■■□ 3,16
ApobrQ8VBT6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC34,81■■■■□ 3,16
ApobrQ8VBT6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34,78■■■■□ 3,16
ApobrQ8VBT6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC34,78■■■■□ 3,16
ApobrQ8VBT6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,77■■■■□ 3,16
ApobrQ8VBT6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC34,74■■■■□ 3,15
ApobrQ8VBT6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34,73■■■■□ 3,15
ApobrQ8VBT6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC34,73■■■■□ 3,15
ApobrQ8VBT6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,72■■■■□ 3,15
ApobrQ8VBT6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC34,72■■■■□ 3,15
ApobrQ8VBT6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC34,69■■■■□ 3,14
ApobrQ8VBT6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,67■■■■□ 3,14
ApobrQ8VBT6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,67■■■■□ 3,14
ApobrQ8VBT6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC34,66■■■■□ 3,14
ApobrQ8VBT6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC34,66■■■■□ 3,14
ApobrQ8VBT6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,66■■■■□ 3,14
ApobrQ8VBT6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,65■■■■□ 3,14
ApobrQ8VBT6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC34,59■■■■□ 3,13
ApobrQ8VBT6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,59■■■■□ 3,13
ApobrQ8VBT6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC34,58■■■■□ 3,13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,4 ms