Protein–RNA interactions for Protein: Q8R395

Commd5, COMM domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd5Q8R395 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,04■■□□□ 1,12
Commd5Q8R395 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
Commd5Q8R395 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
Commd5Q8R395 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
Commd5Q8R395 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC21,96■■□□□ 1,11
Commd5Q8R395 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
Commd5Q8R395 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,89■■□□□ 1,09
Commd5Q8R395 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
Commd5Q8R395 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,87■■□□□ 1,09
Commd5Q8R395 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21,86■■□□□ 1,09
Commd5Q8R395 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
Commd5Q8R395 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,84■■□□□ 1,09
Commd5Q8R395 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
Commd5Q8R395 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
Commd5Q8R395 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,07
Commd5Q8R395 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,73■■□□□ 1,07
Commd5Q8R395 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
Commd5Q8R395 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
Commd5Q8R395 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC21,71■■□□□ 1,07
Commd5Q8R395 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
Commd5Q8R395 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
Commd5Q8R395 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
Commd5Q8R395 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21,63■■□□□ 1,05
Commd5Q8R395 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
Commd5Q8R395 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,58■■□□□ 1,04
Commd5Q8R395 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
Commd5Q8R395 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
Commd5Q8R395 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Commd5Q8R395 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Commd5Q8R395 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21,55■■□□□ 1,04
Commd5Q8R395 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
Commd5Q8R395 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,04
Commd5Q8R395 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
Commd5Q8R395 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
Commd5Q8R395 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
Commd5Q8R395 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
Commd5Q8R395 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21,49■■□□□ 1,03
Commd5Q8R395 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
Commd5Q8R395 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,44■■□□□ 1,02
Commd5Q8R395 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,42■■□□□ 1,02
Commd5Q8R395 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,42■■□□□ 1,02
Commd5Q8R395 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,38■■□□□ 1,01
Commd5Q8R395 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21,37■■□□□ 1,01
Commd5Q8R395 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
Commd5Q8R395 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
Commd5Q8R395 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21,36■■□□□ 1,01
Commd5Q8R395 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21,36■■□□□ 1,01
Commd5Q8R395 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
Commd5Q8R395 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
Commd5Q8R395 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
Commd5Q8R395 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
Commd5Q8R395 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
Commd5Q8R395 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
Commd5Q8R395 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
Commd5Q8R395 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,28■■□□□ 1
Commd5Q8R395 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,28■■□□□ 1
Commd5Q8R395 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,28■■□□□ 1
Commd5Q8R395 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,27■■□□□ 1
Commd5Q8R395 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,27■□□□□ 0,99
Commd5Q8R395 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,26■□□□□ 0,99
Commd5Q8R395 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21,26■□□□□ 0,99
Commd5Q8R395 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,25■□□□□ 0,99
Commd5Q8R395 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
Commd5Q8R395 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,24■□□□□ 0,99
Commd5Q8R395 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21,24■□□□□ 0,99
Commd5Q8R395 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
Commd5Q8R395 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
Commd5Q8R395 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
Commd5Q8R395 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21,2■□□□□ 0,98
Commd5Q8R395 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,19■□□□□ 0,98
Commd5Q8R395 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
Commd5Q8R395 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
Commd5Q8R395 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
Commd5Q8R395 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
Commd5Q8R395 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,97
Commd5Q8R395 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Commd5Q8R395 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
Commd5Q8R395 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21,12■□□□□ 0,97
Commd5Q8R395 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
Commd5Q8R395 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
Commd5Q8R395 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
Commd5Q8R395 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,1■□□□□ 0,97
Commd5Q8R395 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21,1■□□□□ 0,97
Commd5Q8R395 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,96
Commd5Q8R395 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,08■□□□□ 0,96
Commd5Q8R395 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Commd5Q8R395 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Commd5Q8R395 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21,05■□□□□ 0,96
Commd5Q8R395 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,05■□□□□ 0,96
Commd5Q8R395 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Commd5Q8R395 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21,04■□□□□ 0,96
Commd5Q8R395 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Commd5Q8R395 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21,04■□□□□ 0,96
Commd5Q8R395 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Commd5Q8R395 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Commd5Q8R395 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
Commd5Q8R395 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Commd5Q8R395 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Commd5Q8R395 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Commd5Q8R395 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
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