Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2S1

Rps6kl1, Ribosomal protein S6 kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6kl1Q8R2S1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rps6kl1Q8R2S1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rps6kl1Q8R2S1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rps6kl1Q8R2S1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Rps6kl1Q8R2S1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rps6kl1Q8R2S1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rps6kl1Q8R2S1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Rps6kl1Q8R2S1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rps6kl1Q8R2S1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rps6kl1Q8R2S1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rps6kl1Q8R2S1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rps6kl1Q8R2S1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rps6kl1Q8R2S1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rps6kl1Q8R2S1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rps6kl1Q8R2S1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rps6kl1Q8R2S1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rps6kl1Q8R2S1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rps6kl1Q8R2S1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Rps6kl1Q8R2S1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Rps6kl1Q8R2S1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rps6kl1Q8R2S1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rps6kl1Q8R2S1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rps6kl1Q8R2S1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rps6kl1Q8R2S1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rps6kl1Q8R2S1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rps6kl1Q8R2S1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Rps6kl1Q8R2S1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rps6kl1Q8R2S1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rps6kl1Q8R2S1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rps6kl1Q8R2S1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rps6kl1Q8R2S1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rps6kl1Q8R2S1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Rps6kl1Q8R2S1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rps6kl1Q8R2S1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rps6kl1Q8R2S1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rps6kl1Q8R2S1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rps6kl1Q8R2S1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rps6kl1Q8R2S1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rps6kl1Q8R2S1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rps6kl1Q8R2S1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rps6kl1Q8R2S1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rps6kl1Q8R2S1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rps6kl1Q8R2S1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rps6kl1Q8R2S1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rps6kl1Q8R2S1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rps6kl1Q8R2S1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rps6kl1Q8R2S1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rps6kl1Q8R2S1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rps6kl1Q8R2S1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rps6kl1Q8R2S1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rps6kl1Q8R2S1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rps6kl1Q8R2S1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Rps6kl1Q8R2S1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rps6kl1Q8R2S1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rps6kl1Q8R2S1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rps6kl1Q8R2S1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rps6kl1Q8R2S1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rps6kl1Q8R2S1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rps6kl1Q8R2S1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rps6kl1Q8R2S1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rps6kl1Q8R2S1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rps6kl1Q8R2S1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rps6kl1Q8R2S1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rps6kl1Q8R2S1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rps6kl1Q8R2S1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rps6kl1Q8R2S1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rps6kl1Q8R2S1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rps6kl1Q8R2S1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Rps6kl1Q8R2S1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rps6kl1Q8R2S1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rps6kl1Q8R2S1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rps6kl1Q8R2S1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rps6kl1Q8R2S1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rps6kl1Q8R2S1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rps6kl1Q8R2S1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rps6kl1Q8R2S1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rps6kl1Q8R2S1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rps6kl1Q8R2S1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Rps6kl1Q8R2S1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Rps6kl1Q8R2S1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rps6kl1Q8R2S1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rps6kl1Q8R2S1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rps6kl1Q8R2S1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Rps6kl1Q8R2S1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rps6kl1Q8R2S1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rps6kl1Q8R2S1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rps6kl1Q8R2S1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rps6kl1Q8R2S1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rps6kl1Q8R2S1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rps6kl1Q8R2S1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rps6kl1Q8R2S1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Rps6kl1Q8R2S1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rps6kl1Q8R2S1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rps6kl1Q8R2S1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rps6kl1Q8R2S1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rps6kl1Q8R2S1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Rps6kl1Q8R2S1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rps6kl1Q8R2S1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rps6kl1Q8R2S1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rps6kl1Q8R2S1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms