Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sf3b4Q8QZY9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sf3b4Q8QZY9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sf3b4Q8QZY9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sf3b4Q8QZY9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sf3b4Q8QZY9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sf3b4Q8QZY9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Sf3b4Q8QZY9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sf3b4Q8QZY9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sf3b4Q8QZY9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sf3b4Q8QZY9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sf3b4Q8QZY9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sf3b4Q8QZY9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Sf3b4Q8QZY9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sf3b4Q8QZY9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sf3b4Q8QZY9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sf3b4Q8QZY9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sf3b4Q8QZY9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sf3b4Q8QZY9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sf3b4Q8QZY9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sf3b4Q8QZY9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sf3b4Q8QZY9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sf3b4Q8QZY9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sf3b4Q8QZY9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sf3b4Q8QZY9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sf3b4Q8QZY9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sf3b4Q8QZY9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sf3b4Q8QZY9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sf3b4Q8QZY9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sf3b4Q8QZY9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sf3b4Q8QZY9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Sf3b4Q8QZY9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Sf3b4Q8QZY9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sf3b4Q8QZY9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Sf3b4Q8QZY9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sf3b4Q8QZY9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sf3b4Q8QZY9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sf3b4Q8QZY9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sf3b4Q8QZY9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sf3b4Q8QZY9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sf3b4Q8QZY9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sf3b4Q8QZY9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sf3b4Q8QZY9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sf3b4Q8QZY9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Sf3b4Q8QZY9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sf3b4Q8QZY9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sf3b4Q8QZY9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sf3b4Q8QZY9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Sf3b4Q8QZY9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sf3b4Q8QZY9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sf3b4Q8QZY9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sf3b4Q8QZY9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sf3b4Q8QZY9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sf3b4Q8QZY9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sf3b4Q8QZY9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sf3b4Q8QZY9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sf3b4Q8QZY9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sf3b4Q8QZY9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sf3b4Q8QZY9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sf3b4Q8QZY9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sf3b4Q8QZY9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sf3b4Q8QZY9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sf3b4Q8QZY9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sf3b4Q8QZY9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sf3b4Q8QZY9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sf3b4Q8QZY9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sf3b4Q8QZY9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sf3b4Q8QZY9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sf3b4Q8QZY9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sf3b4Q8QZY9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sf3b4Q8QZY9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sf3b4Q8QZY9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sf3b4Q8QZY9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sf3b4Q8QZY9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sf3b4Q8QZY9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sf3b4Q8QZY9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sf3b4Q8QZY9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sf3b4Q8QZY9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sf3b4Q8QZY9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sf3b4Q8QZY9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sf3b4Q8QZY9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sf3b4Q8QZY9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sf3b4Q8QZY9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sf3b4Q8QZY9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sf3b4Q8QZY9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sf3b4Q8QZY9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sf3b4Q8QZY9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sf3b4Q8QZY9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sf3b4Q8QZY9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sf3b4Q8QZY9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sf3b4Q8QZY9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Sf3b4Q8QZY9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Sf3b4Q8QZY9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Sf3b4Q8QZY9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sf3b4Q8QZY9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sf3b4Q8QZY9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sf3b4Q8QZY9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sf3b4Q8QZY9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sf3b4Q8QZY9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sf3b4Q8QZY9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms