Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4J6

Mkl1, MKL/myocardin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkl1Q8K4J6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Mkl1Q8K4J6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Mkl1Q8K4J6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Mkl1Q8K4J6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Mkl1Q8K4J6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Mkl1Q8K4J6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Mkl1Q8K4J6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Mkl1Q8K4J6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Mkl1Q8K4J6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Mkl1Q8K4J6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Mkl1Q8K4J6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Mkl1Q8K4J6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Mkl1Q8K4J6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Mkl1Q8K4J6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Mkl1Q8K4J6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Mkl1Q8K4J6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Mkl1Q8K4J6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Mkl1Q8K4J6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Mkl1Q8K4J6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Mkl1Q8K4J6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Mkl1Q8K4J6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Mkl1Q8K4J6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Mkl1Q8K4J6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Mkl1Q8K4J6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Mkl1Q8K4J6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Mkl1Q8K4J6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Mkl1Q8K4J6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Mkl1Q8K4J6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Mkl1Q8K4J6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Mkl1Q8K4J6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Mkl1Q8K4J6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Mkl1Q8K4J6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Mkl1Q8K4J6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Mkl1Q8K4J6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Mkl1Q8K4J6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Mkl1Q8K4J6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Mkl1Q8K4J6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Mkl1Q8K4J6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Mkl1Q8K4J6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Mkl1Q8K4J6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Mkl1Q8K4J6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Mkl1Q8K4J6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Mkl1Q8K4J6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Mkl1Q8K4J6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Mkl1Q8K4J6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Mkl1Q8K4J6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Mkl1Q8K4J6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Mkl1Q8K4J6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Mkl1Q8K4J6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Mkl1Q8K4J6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Mkl1Q8K4J6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Mkl1Q8K4J6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Mkl1Q8K4J6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Mkl1Q8K4J6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Mkl1Q8K4J6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Mkl1Q8K4J6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Mkl1Q8K4J6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Mkl1Q8K4J6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Mkl1Q8K4J6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Mkl1Q8K4J6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Mkl1Q8K4J6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Mkl1Q8K4J6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Mkl1Q8K4J6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Mkl1Q8K4J6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Mkl1Q8K4J6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Mkl1Q8K4J6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Mkl1Q8K4J6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Mkl1Q8K4J6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Mkl1Q8K4J6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Mkl1Q8K4J6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Mkl1Q8K4J6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Mkl1Q8K4J6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Mkl1Q8K4J6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Mkl1Q8K4J6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Mkl1Q8K4J6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Mkl1Q8K4J6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Mkl1Q8K4J6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Mkl1Q8K4J6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Mkl1Q8K4J6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Mkl1Q8K4J6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Mkl1Q8K4J6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Mkl1Q8K4J6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Mkl1Q8K4J6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Mkl1Q8K4J6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Mkl1Q8K4J6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Mkl1Q8K4J6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Mkl1Q8K4J6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Mkl1Q8K4J6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mkl1Q8K4J6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Mkl1Q8K4J6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Mkl1Q8K4J6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Mkl1Q8K4J6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Mkl1Q8K4J6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Mkl1Q8K4J6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mkl1Q8K4J6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mkl1Q8K4J6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Mkl1Q8K4J6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Mkl1Q8K4J6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Mkl1Q8K4J6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mkl1Q8K4J6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms