Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X8

Gtf2h5, General transcription factor IIH subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2h5Q8K2X8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,56■□□□□ 0,72
Gtf2h5Q8K2X8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,56■□□□□ 0,72
Gtf2h5Q8K2X8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,55■□□□□ 0,72
Gtf2h5Q8K2X8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19,55■□□□□ 0,72
Gtf2h5Q8K2X8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19,53■□□□□ 0,72
Gtf2h5Q8K2X8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,5■□□□□ 0,71
Gtf2h5Q8K2X8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,49■□□□□ 0,71
Gtf2h5Q8K2X8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19,49■□□□□ 0,71
Gtf2h5Q8K2X8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,49■□□□□ 0,71
Gtf2h5Q8K2X8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,46■□□□□ 0,71
Gtf2h5Q8K2X8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,45■□□□□ 0,7
Gtf2h5Q8K2X8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,45■□□□□ 0,7
Gtf2h5Q8K2X8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19,45■□□□□ 0,7
Gtf2h5Q8K2X8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,45■□□□□ 0,7
Gtf2h5Q8K2X8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,44■□□□□ 0,7
Gtf2h5Q8K2X8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19,44■□□□□ 0,7
Gtf2h5Q8K2X8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,43■□□□□ 0,7
Gtf2h5Q8K2X8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,43■□□□□ 0,7
Gtf2h5Q8K2X8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,42■□□□□ 0,7
Gtf2h5Q8K2X8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC19,42■□□□□ 0,7
Gtf2h5Q8K2X8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,41■□□□□ 0,7
Gtf2h5Q8K2X8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,4■□□□□ 0,7
Gtf2h5Q8K2X8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,37■□□□□ 0,69
Gtf2h5Q8K2X8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19,35■□□□□ 0,69
Gtf2h5Q8K2X8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,34■□□□□ 0,69
Gtf2h5Q8K2X8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19,34■□□□□ 0,69
Gtf2h5Q8K2X8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19,34■□□□□ 0,69
Gtf2h5Q8K2X8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,33■□□□□ 0,68
Gtf2h5Q8K2X8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,3■□□□□ 0,68
Gtf2h5Q8K2X8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,3■□□□□ 0,68
Gtf2h5Q8K2X8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,28■□□□□ 0,68
Gtf2h5Q8K2X8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19,27■□□□□ 0,68
Gtf2h5Q8K2X8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,25■□□□□ 0,67
Gtf2h5Q8K2X8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,24■□□□□ 0,67
Gtf2h5Q8K2X8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,24■□□□□ 0,67
Gtf2h5Q8K2X8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19,24■□□□□ 0,67
Gtf2h5Q8K2X8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,23■□□□□ 0,67
Gtf2h5Q8K2X8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,23■□□□□ 0,67
Gtf2h5Q8K2X8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,2■□□□□ 0,66
Gtf2h5Q8K2X8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,19■□□□□ 0,66
Gtf2h5Q8K2X8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,18■□□□□ 0,66
Gtf2h5Q8K2X8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19,17■□□□□ 0,66
Gtf2h5Q8K2X8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,15■□□□□ 0,66
Gtf2h5Q8K2X8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,15■□□□□ 0,66
Gtf2h5Q8K2X8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19,15■□□□□ 0,66
Gtf2h5Q8K2X8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,14■□□□□ 0,65
Gtf2h5Q8K2X8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19,14■□□□□ 0,65
Gtf2h5Q8K2X8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC19,13■□□□□ 0,65
Gtf2h5Q8K2X8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19,12■□□□□ 0,65
Gtf2h5Q8K2X8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19,12■□□□□ 0,65
Gtf2h5Q8K2X8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,12■□□□□ 0,65
Gtf2h5Q8K2X8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,12■□□□□ 0,65
Gtf2h5Q8K2X8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19,12■□□□□ 0,65
Gtf2h5Q8K2X8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,11■□□□□ 0,65
Gtf2h5Q8K2X8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,1■□□□□ 0,65
Gtf2h5Q8K2X8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,09■□□□□ 0,65
Gtf2h5Q8K2X8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,09■□□□□ 0,65
Gtf2h5Q8K2X8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,08■□□□□ 0,65
Gtf2h5Q8K2X8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,08■□□□□ 0,65
Gtf2h5Q8K2X8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC19,07■□□□□ 0,64
Gtf2h5Q8K2X8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,07■□□□□ 0,64
Gtf2h5Q8K2X8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,03■□□□□ 0,64
Gtf2h5Q8K2X8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,03■□□□□ 0,64
Gtf2h5Q8K2X8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,03■□□□□ 0,64
Gtf2h5Q8K2X8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,01■□□□□ 0,63
Gtf2h5Q8K2X8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,01■□□□□ 0,63
Gtf2h5Q8K2X8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0,63
Gtf2h5Q8K2X8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0,63
Gtf2h5Q8K2X8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18,98■□□□□ 0,63
Gtf2h5Q8K2X8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,95■□□□□ 0,62
Gtf2h5Q8K2X8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,93■□□□□ 0,62
Gtf2h5Q8K2X8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18,93■□□□□ 0,62
Gtf2h5Q8K2X8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,92■□□□□ 0,62
Gtf2h5Q8K2X8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18,92■□□□□ 0,62
Gtf2h5Q8K2X8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,92■□□□□ 0,62
Gtf2h5Q8K2X8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,92■□□□□ 0,62
Gtf2h5Q8K2X8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC18,91■□□□□ 0,62
Gtf2h5Q8K2X8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,91■□□□□ 0,62
Gtf2h5Q8K2X8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,9■□□□□ 0,62
Gtf2h5Q8K2X8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,9■□□□□ 0,62
Gtf2h5Q8K2X8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,89■□□□□ 0,61
Gtf2h5Q8K2X8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18,88■□□□□ 0,61
Gtf2h5Q8K2X8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,88■□□□□ 0,61
Gtf2h5Q8K2X8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,87■□□□□ 0,61
Gtf2h5Q8K2X8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18,86■□□□□ 0,61
Gtf2h5Q8K2X8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,85■□□□□ 0,61
Gtf2h5Q8K2X8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,85■□□□□ 0,61
Gtf2h5Q8K2X8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,84■□□□□ 0,61
Gtf2h5Q8K2X8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18,83■□□□□ 0,6
Gtf2h5Q8K2X8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,83■□□□□ 0,6
Gtf2h5Q8K2X8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18,83■□□□□ 0,6
Gtf2h5Q8K2X8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,81■□□□□ 0,6
Gtf2h5Q8K2X8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18,81■□□□□ 0,6
Gtf2h5Q8K2X8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,81■□□□□ 0,6
Gtf2h5Q8K2X8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC18,8■□□□□ 0,6
Gtf2h5Q8K2X8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC18,79■□□□□ 0,6
Gtf2h5Q8K2X8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,78■□□□□ 0,6
Gtf2h5Q8K2X8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,77■□□□□ 0,6
Gtf2h5Q8K2X8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18,77■□□□□ 0,59
Gtf2h5Q8K2X8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,76■□□□□ 0,59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms