Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SrrdQ8K2M3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SrrdQ8K2M3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SrrdQ8K2M3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SrrdQ8K2M3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SrrdQ8K2M3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SrrdQ8K2M3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SrrdQ8K2M3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SrrdQ8K2M3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SrrdQ8K2M3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SrrdQ8K2M3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SrrdQ8K2M3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SrrdQ8K2M3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SrrdQ8K2M3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SrrdQ8K2M3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SrrdQ8K2M3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SrrdQ8K2M3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SrrdQ8K2M3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SrrdQ8K2M3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SrrdQ8K2M3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SrrdQ8K2M3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SrrdQ8K2M3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SrrdQ8K2M3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SrrdQ8K2M3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SrrdQ8K2M3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SrrdQ8K2M3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SrrdQ8K2M3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SrrdQ8K2M3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SrrdQ8K2M3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SrrdQ8K2M3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SrrdQ8K2M3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SrrdQ8K2M3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SrrdQ8K2M3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SrrdQ8K2M3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SrrdQ8K2M3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SrrdQ8K2M3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SrrdQ8K2M3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SrrdQ8K2M3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SrrdQ8K2M3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SrrdQ8K2M3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SrrdQ8K2M3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SrrdQ8K2M3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SrrdQ8K2M3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SrrdQ8K2M3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SrrdQ8K2M3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SrrdQ8K2M3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SrrdQ8K2M3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SrrdQ8K2M3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SrrdQ8K2M3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SrrdQ8K2M3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SrrdQ8K2M3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SrrdQ8K2M3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SrrdQ8K2M3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SrrdQ8K2M3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SrrdQ8K2M3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SrrdQ8K2M3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SrrdQ8K2M3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SrrdQ8K2M3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SrrdQ8K2M3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SrrdQ8K2M3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SrrdQ8K2M3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SrrdQ8K2M3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SrrdQ8K2M3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SrrdQ8K2M3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SrrdQ8K2M3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SrrdQ8K2M3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SrrdQ8K2M3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SrrdQ8K2M3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SrrdQ8K2M3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SrrdQ8K2M3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SrrdQ8K2M3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SrrdQ8K2M3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SrrdQ8K2M3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SrrdQ8K2M3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SrrdQ8K2M3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SrrdQ8K2M3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SrrdQ8K2M3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SrrdQ8K2M3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SrrdQ8K2M3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SrrdQ8K2M3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SrrdQ8K2M3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SrrdQ8K2M3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SrrdQ8K2M3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SrrdQ8K2M3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SrrdQ8K2M3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SrrdQ8K2M3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SrrdQ8K2M3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SrrdQ8K2M3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SrrdQ8K2M3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SrrdQ8K2M3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SrrdQ8K2M3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SrrdQ8K2M3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SrrdQ8K2M3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SrrdQ8K2M3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SrrdQ8K2M3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SrrdQ8K2M3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SrrdQ8K2M3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SrrdQ8K2M3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SrrdQ8K2M3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SrrdQ8K2M3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms