Protein–RNA interactions for Protein: Q8K221

Arfip2, Arfaptin-2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip2Q8K221 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Arfip2Q8K221 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Arfip2Q8K221 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Arfip2Q8K221 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Arfip2Q8K221 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Arfip2Q8K221 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Arfip2Q8K221 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Arfip2Q8K221 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Arfip2Q8K221 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Arfip2Q8K221 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Arfip2Q8K221 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Arfip2Q8K221 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Arfip2Q8K221 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Arfip2Q8K221 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Arfip2Q8K221 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Arfip2Q8K221 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Arfip2Q8K221 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Arfip2Q8K221 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Arfip2Q8K221 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Arfip2Q8K221 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Arfip2Q8K221 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Arfip2Q8K221 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Arfip2Q8K221 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Arfip2Q8K221 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Arfip2Q8K221 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Arfip2Q8K221 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Arfip2Q8K221 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Arfip2Q8K221 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Arfip2Q8K221 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Arfip2Q8K221 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Arfip2Q8K221 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Arfip2Q8K221 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Arfip2Q8K221 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Arfip2Q8K221 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Arfip2Q8K221 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Arfip2Q8K221 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Arfip2Q8K221 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Arfip2Q8K221 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Arfip2Q8K221 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Arfip2Q8K221 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Arfip2Q8K221 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Arfip2Q8K221 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Arfip2Q8K221 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Arfip2Q8K221 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Arfip2Q8K221 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Arfip2Q8K221 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Arfip2Q8K221 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Arfip2Q8K221 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Arfip2Q8K221 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Arfip2Q8K221 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Arfip2Q8K221 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Arfip2Q8K221 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Arfip2Q8K221 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Arfip2Q8K221 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Arfip2Q8K221 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Arfip2Q8K221 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Arfip2Q8K221 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Arfip2Q8K221 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Arfip2Q8K221 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Arfip2Q8K221 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Arfip2Q8K221 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Arfip2Q8K221 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Arfip2Q8K221 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Arfip2Q8K221 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Arfip2Q8K221 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Arfip2Q8K221 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Arfip2Q8K221 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Arfip2Q8K221 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Arfip2Q8K221 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Arfip2Q8K221 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Arfip2Q8K221 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Arfip2Q8K221 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Arfip2Q8K221 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Arfip2Q8K221 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Arfip2Q8K221 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Arfip2Q8K221 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Arfip2Q8K221 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Arfip2Q8K221 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Arfip2Q8K221 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Arfip2Q8K221 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Arfip2Q8K221 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Arfip2Q8K221 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Arfip2Q8K221 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Arfip2Q8K221 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Arfip2Q8K221 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Arfip2Q8K221 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Arfip2Q8K221 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Arfip2Q8K221 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Arfip2Q8K221 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Arfip2Q8K221 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Arfip2Q8K221 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Arfip2Q8K221 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Arfip2Q8K221 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Arfip2Q8K221 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Arfip2Q8K221 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Arfip2Q8K221 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Arfip2Q8K221 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Arfip2Q8K221 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Arfip2Q8K221 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Arfip2Q8K221 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms