Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Nek9Q8K1R7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Nek9Q8K1R7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Nek9Q8K1R7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Nek9Q8K1R7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Nek9Q8K1R7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Nek9Q8K1R7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Nek9Q8K1R7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Nek9Q8K1R7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Nek9Q8K1R7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Nek9Q8K1R7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Nek9Q8K1R7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Nek9Q8K1R7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Nek9Q8K1R7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
Nek9Q8K1R7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Nek9Q8K1R7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Nek9Q8K1R7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Nek9Q8K1R7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Nek9Q8K1R7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Nek9Q8K1R7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Nek9Q8K1R7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Nek9Q8K1R7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Nek9Q8K1R7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Nek9Q8K1R7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Nek9Q8K1R7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Nek9Q8K1R7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Nek9Q8K1R7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Nek9Q8K1R7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Nek9Q8K1R7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Nek9Q8K1R7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Nek9Q8K1R7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Nek9Q8K1R7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Nek9Q8K1R7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Nek9Q8K1R7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
Nek9Q8K1R7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Nek9Q8K1R7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Nek9Q8K1R7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
Nek9Q8K1R7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
Nek9Q8K1R7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Nek9Q8K1R7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Nek9Q8K1R7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
Nek9Q8K1R7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Nek9Q8K1R7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Nek9Q8K1R7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Nek9Q8K1R7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Nek9Q8K1R7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Nek9Q8K1R7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Nek9Q8K1R7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Nek9Q8K1R7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Nek9Q8K1R7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Nek9Q8K1R7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Nek9Q8K1R7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Nek9Q8K1R7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Nek9Q8K1R7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Nek9Q8K1R7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Nek9Q8K1R7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Nek9Q8K1R7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Nek9Q8K1R7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Nek9Q8K1R7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Nek9Q8K1R7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Nek9Q8K1R7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
Nek9Q8K1R7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Nek9Q8K1R7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Nek9Q8K1R7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Nek9Q8K1R7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Nek9Q8K1R7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Nek9Q8K1R7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Nek9Q8K1R7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Nek9Q8K1R7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Nek9Q8K1R7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Nek9Q8K1R7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
Nek9Q8K1R7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Nek9Q8K1R7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Nek9Q8K1R7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Nek9Q8K1R7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Nek9Q8K1R7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Nek9Q8K1R7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Nek9Q8K1R7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Nek9Q8K1R7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Nek9Q8K1R7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Nek9Q8K1R7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Nek9Q8K1R7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Nek9Q8K1R7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Nek9Q8K1R7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Nek9Q8K1R7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Nek9Q8K1R7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Nek9Q8K1R7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Nek9Q8K1R7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Nek9Q8K1R7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Nek9Q8K1R7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Nek9Q8K1R7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Nek9Q8K1R7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Nek9Q8K1R7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Nek9Q8K1R7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Nek9Q8K1R7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Nek9Q8K1R7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Nek9Q8K1R7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Nek9Q8K1R7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Nek9Q8K1R7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Nek9Q8K1R7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
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