Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0D0

Cdk17, Cyclin-dependent kinase 17, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk17Q8K0D0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cdk17Q8K0D0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cdk17Q8K0D0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Cdk17Q8K0D0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cdk17Q8K0D0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cdk17Q8K0D0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cdk17Q8K0D0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cdk17Q8K0D0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cdk17Q8K0D0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cdk17Q8K0D0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cdk17Q8K0D0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cdk17Q8K0D0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Cdk17Q8K0D0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cdk17Q8K0D0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cdk17Q8K0D0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cdk17Q8K0D0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cdk17Q8K0D0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Cdk17Q8K0D0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cdk17Q8K0D0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cdk17Q8K0D0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cdk17Q8K0D0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cdk17Q8K0D0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cdk17Q8K0D0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cdk17Q8K0D0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cdk17Q8K0D0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cdk17Q8K0D0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cdk17Q8K0D0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cdk17Q8K0D0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cdk17Q8K0D0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cdk17Q8K0D0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cdk17Q8K0D0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cdk17Q8K0D0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cdk17Q8K0D0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Cdk17Q8K0D0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cdk17Q8K0D0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cdk17Q8K0D0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cdk17Q8K0D0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cdk17Q8K0D0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cdk17Q8K0D0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cdk17Q8K0D0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cdk17Q8K0D0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cdk17Q8K0D0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cdk17Q8K0D0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Cdk17Q8K0D0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cdk17Q8K0D0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cdk17Q8K0D0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cdk17Q8K0D0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cdk17Q8K0D0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cdk17Q8K0D0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cdk17Q8K0D0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cdk17Q8K0D0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cdk17Q8K0D0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cdk17Q8K0D0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Cdk17Q8K0D0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cdk17Q8K0D0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cdk17Q8K0D0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cdk17Q8K0D0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cdk17Q8K0D0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cdk17Q8K0D0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Cdk17Q8K0D0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cdk17Q8K0D0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cdk17Q8K0D0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cdk17Q8K0D0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cdk17Q8K0D0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cdk17Q8K0D0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cdk17Q8K0D0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cdk17Q8K0D0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cdk17Q8K0D0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cdk17Q8K0D0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cdk17Q8K0D0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cdk17Q8K0D0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cdk17Q8K0D0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Cdk17Q8K0D0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cdk17Q8K0D0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cdk17Q8K0D0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cdk17Q8K0D0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cdk17Q8K0D0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cdk17Q8K0D0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cdk17Q8K0D0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cdk17Q8K0D0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cdk17Q8K0D0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cdk17Q8K0D0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cdk17Q8K0D0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cdk17Q8K0D0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cdk17Q8K0D0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cdk17Q8K0D0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cdk17Q8K0D0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cdk17Q8K0D0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Cdk17Q8K0D0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cdk17Q8K0D0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cdk17Q8K0D0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Cdk17Q8K0D0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cdk17Q8K0D0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cdk17Q8K0D0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cdk17Q8K0D0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Cdk17Q8K0D0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cdk17Q8K0D0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cdk17Q8K0D0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cdk17Q8K0D0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cdk17Q8K0D0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms