Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIN6

Celf3, CUGBP Elav-like family member 3, mousemouse

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Celf3Q8CIN6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Celf3Q8CIN6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Celf3Q8CIN6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Celf3Q8CIN6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Celf3Q8CIN6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
Celf3Q8CIN6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Celf3Q8CIN6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Celf3Q8CIN6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Celf3Q8CIN6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Celf3Q8CIN6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Celf3Q8CIN6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Celf3Q8CIN6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Celf3Q8CIN6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
Celf3Q8CIN6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Celf3Q8CIN6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Celf3Q8CIN6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Celf3Q8CIN6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Celf3Q8CIN6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Celf3Q8CIN6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Celf3Q8CIN6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Celf3Q8CIN6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Celf3Q8CIN6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Celf3Q8CIN6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
Celf3Q8CIN6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Celf3Q8CIN6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Celf3Q8CIN6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Celf3Q8CIN6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Celf3Q8CIN6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Celf3Q8CIN6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Celf3Q8CIN6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Celf3Q8CIN6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Celf3Q8CIN6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Celf3Q8CIN6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Celf3Q8CIN6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Celf3Q8CIN6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Celf3Q8CIN6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Celf3Q8CIN6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Celf3Q8CIN6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Celf3Q8CIN6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Celf3Q8CIN6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Celf3Q8CIN6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Celf3Q8CIN6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Celf3Q8CIN6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Celf3Q8CIN6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Celf3Q8CIN6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Celf3Q8CIN6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Celf3Q8CIN6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Celf3Q8CIN6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Celf3Q8CIN6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Celf3Q8CIN6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Celf3Q8CIN6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Celf3Q8CIN6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Celf3Q8CIN6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Celf3Q8CIN6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Celf3Q8CIN6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Celf3Q8CIN6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Celf3Q8CIN6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Celf3Q8CIN6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Celf3Q8CIN6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Celf3Q8CIN6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Celf3Q8CIN6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Celf3Q8CIN6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Celf3Q8CIN6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Celf3Q8CIN6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Celf3Q8CIN6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Celf3Q8CIN6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.37
Celf3Q8CIN6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Celf3Q8CIN6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Celf3Q8CIN6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Celf3Q8CIN6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Celf3Q8CIN6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Celf3Q8CIN6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Celf3Q8CIN6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Celf3Q8CIN6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Celf3Q8CIN6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Celf3Q8CIN6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Celf3Q8CIN6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Celf3Q8CIN6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Celf3Q8CIN6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Celf3Q8CIN6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Celf3Q8CIN6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Celf3Q8CIN6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Celf3Q8CIN6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Celf3Q8CIN6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Celf3Q8CIN6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Celf3Q8CIN6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Celf3Q8CIN6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Celf3Q8CIN6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Celf3Q8CIN6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Celf3Q8CIN6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Celf3Q8CIN6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Celf3Q8CIN6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Celf3Q8CIN6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Celf3Q8CIN6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Celf3Q8CIN6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Celf3Q8CIN6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Celf3Q8CIN6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Celf3Q8CIN6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Celf3Q8CIN6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Celf3Q8CIN6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
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