Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHT1

Ngef, Ephexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgefQ8CHT1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
NgefQ8CHT1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
NgefQ8CHT1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
NgefQ8CHT1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
NgefQ8CHT1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
NgefQ8CHT1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
NgefQ8CHT1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
NgefQ8CHT1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
NgefQ8CHT1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
NgefQ8CHT1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
NgefQ8CHT1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
NgefQ8CHT1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
NgefQ8CHT1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC38.32■■■■□ 3.73
NgefQ8CHT1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC38.32■■■■□ 3.72
NgefQ8CHT1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
NgefQ8CHT1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
NgefQ8CHT1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
NgefQ8CHT1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC38.2■■■■□ 3.71
NgefQ8CHT1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
NgefQ8CHT1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
NgefQ8CHT1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
NgefQ8CHT1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
NgefQ8CHT1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
NgefQ8CHT1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
NgefQ8CHT1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
NgefQ8CHT1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
NgefQ8CHT1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
NgefQ8CHT1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC37.92■■■■□ 3.66
NgefQ8CHT1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
NgefQ8CHT1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
NgefQ8CHT1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
NgefQ8CHT1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
NgefQ8CHT1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
NgefQ8CHT1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
NgefQ8CHT1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
NgefQ8CHT1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
NgefQ8CHT1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
NgefQ8CHT1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
NgefQ8CHT1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
NgefQ8CHT1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC37.73■■■■□ 3.63
NgefQ8CHT1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
NgefQ8CHT1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
NgefQ8CHT1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
NgefQ8CHT1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
NgefQ8CHT1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
NgefQ8CHT1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
NgefQ8CHT1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
NgefQ8CHT1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
NgefQ8CHT1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
NgefQ8CHT1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
NgefQ8CHT1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
NgefQ8CHT1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
NgefQ8CHT1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
NgefQ8CHT1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
NgefQ8CHT1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
NgefQ8CHT1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
NgefQ8CHT1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
NgefQ8CHT1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
NgefQ8CHT1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
NgefQ8CHT1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
NgefQ8CHT1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
NgefQ8CHT1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
NgefQ8CHT1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
NgefQ8CHT1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
NgefQ8CHT1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
NgefQ8CHT1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
NgefQ8CHT1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
NgefQ8CHT1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
NgefQ8CHT1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
NgefQ8CHT1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
NgefQ8CHT1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
NgefQ8CHT1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC37.04■■■■□ 3.52
NgefQ8CHT1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
NgefQ8CHT1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
NgefQ8CHT1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
NgefQ8CHT1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
NgefQ8CHT1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
NgefQ8CHT1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
NgefQ8CHT1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
NgefQ8CHT1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
NgefQ8CHT1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
NgefQ8CHT1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
NgefQ8CHT1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
NgefQ8CHT1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
NgefQ8CHT1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
NgefQ8CHT1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC36.78■■■■□ 3.48
NgefQ8CHT1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC36.78■■■■□ 3.48
NgefQ8CHT1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
NgefQ8CHT1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC36.77■■■■□ 3.48
NgefQ8CHT1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
NgefQ8CHT1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
NgefQ8CHT1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
NgefQ8CHT1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
NgefQ8CHT1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
NgefQ8CHT1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
NgefQ8CHT1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
NgefQ8CHT1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
NgefQ8CHT1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
NgefQ8CHT1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
NgefQ8CHT1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms