Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHT1

Ngef, Ephexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgefQ8CHT1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,71■■■■□ 3,79
NgefQ8CHT1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,64■■■■□ 3,78
NgefQ8CHT1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,63■■■■□ 3,77
NgefQ8CHT1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,62■■■■□ 3,77
NgefQ8CHT1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC38,51■■■■□ 3,76
NgefQ8CHT1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,51■■■■□ 3,76
NgefQ8CHT1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,46■■■■□ 3,75
NgefQ8CHT1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,43■■■■□ 3,74
NgefQ8CHT1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,36■■■■□ 3,73
NgefQ8CHT1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,35■■■■□ 3,73
NgefQ8CHT1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,35■■■■□ 3,73
NgefQ8CHT1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,34■■■■□ 3,73
NgefQ8CHT1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC38,32■■■■□ 3,73
NgefQ8CHT1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC38,32■■■■□ 3,72
NgefQ8CHT1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,31■■■■□ 3,72
NgefQ8CHT1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC38,3■■■■□ 3,72
NgefQ8CHT1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,23■■■■□ 3,71
NgefQ8CHT1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC38,2■■■■□ 3,71
NgefQ8CHT1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,2■■■■□ 3,71
NgefQ8CHT1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,16■■■■□ 3,7
NgefQ8CHT1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,11■■■■□ 3,69
NgefQ8CHT1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,1■■■■□ 3,69
NgefQ8CHT1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC38,1■■■■□ 3,69
NgefQ8CHT1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,06■■■■□ 3,68
NgefQ8CHT1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,98■■■■□ 3,67
NgefQ8CHT1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC37,98■■■■□ 3,67
NgefQ8CHT1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,94■■■■□ 3,66
NgefQ8CHT1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC37,92■■■■□ 3,66
NgefQ8CHT1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC37,9■■■■□ 3,66
NgefQ8CHT1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC37,89■■■■□ 3,66
NgefQ8CHT1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC37,89■■■■□ 3,66
NgefQ8CHT1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC37,88■■■■□ 3,65
NgefQ8CHT1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,81■■■■□ 3,64
NgefQ8CHT1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,8■■■■□ 3,64
NgefQ8CHT1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC37,79■■■■□ 3,64
NgefQ8CHT1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,79■■■■□ 3,64
NgefQ8CHT1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37,77■■■■□ 3,64
NgefQ8CHT1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC37,77■■■■□ 3,64
NgefQ8CHT1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC37,74■■■■□ 3,63
NgefQ8CHT1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC37,73■■■■□ 3,63
NgefQ8CHT1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37,7■■■■□ 3,63
NgefQ8CHT1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC37,7■■■■□ 3,63
NgefQ8CHT1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC37,69■■■■□ 3,62
NgefQ8CHT1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37,65■■■■□ 3,62
NgefQ8CHT1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC37,6■■■■□ 3,61
NgefQ8CHT1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,58■■■■□ 3,61
NgefQ8CHT1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,56■■■■□ 3,6
NgefQ8CHT1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC37,51■■■■□ 3,6
NgefQ8CHT1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37,51■■■■□ 3,59
NgefQ8CHT1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,49■■■■□ 3,59
NgefQ8CHT1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC37,49■■■■□ 3,59
NgefQ8CHT1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,45■■■■□ 3,59
NgefQ8CHT1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC37,45■■■■□ 3,59
NgefQ8CHT1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC37,41■■■■□ 3,58
NgefQ8CHT1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC37,37■■■■□ 3,57
NgefQ8CHT1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,36■■■■□ 3,57
NgefQ8CHT1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,34■■■■□ 3,57
NgefQ8CHT1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,3■■■■□ 3,56
NgefQ8CHT1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,29■■■■□ 3,56
NgefQ8CHT1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,29■■■■□ 3,56
NgefQ8CHT1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,28■■■■□ 3,56
NgefQ8CHT1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC37,24■■■■□ 3,55
NgefQ8CHT1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,24■■■■□ 3,55
NgefQ8CHT1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,23■■■■□ 3,55
NgefQ8CHT1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,21■■■■□ 3,55
NgefQ8CHT1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37,17■■■■□ 3,54
NgefQ8CHT1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,14■■■■□ 3,54
NgefQ8CHT1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC37,13■■■■□ 3,53
NgefQ8CHT1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,09■■■■□ 3,53
NgefQ8CHT1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,07■■■■□ 3,52
NgefQ8CHT1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37,05■■■■□ 3,52
NgefQ8CHT1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC37,04■■■■□ 3,52
NgefQ8CHT1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC37,03■■■■□ 3,52
NgefQ8CHT1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,01■■■■□ 3,51
NgefQ8CHT1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36,94■■■■□ 3,5
NgefQ8CHT1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,9■■■■□ 3,5
NgefQ8CHT1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC36,89■■■■□ 3,5
NgefQ8CHT1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC36,89■■■■□ 3,5
NgefQ8CHT1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36,86■■■■□ 3,49
NgefQ8CHT1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC36,83■■■■□ 3,49
NgefQ8CHT1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC36,8■■■■□ 3,48
NgefQ8CHT1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC36,79■■■■□ 3,48
NgefQ8CHT1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36,79■■■■□ 3,48
NgefQ8CHT1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC36,78■■■■□ 3,48
NgefQ8CHT1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,78■■■■□ 3,48
NgefQ8CHT1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC36,78■■■■□ 3,48
NgefQ8CHT1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC36,78■■■■□ 3,48
NgefQ8CHT1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,77■■■■□ 3,48
NgefQ8CHT1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC36,77■■■■□ 3,48
NgefQ8CHT1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC36,77■■■■□ 3,48
NgefQ8CHT1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC36,74■■■■□ 3,47
NgefQ8CHT1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,72■■■■□ 3,47
NgefQ8CHT1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC36,72■■■■□ 3,47
NgefQ8CHT1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,72■■■■□ 3,47
NgefQ8CHT1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,71■■■■□ 3,47
NgefQ8CHT1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,69■■■■□ 3,46
NgefQ8CHT1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC36,67■■■■□ 3,46
NgefQ8CHT1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,65■■■■□ 3,46
NgefQ8CHT1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC36,64■■■■□ 3,46
NgefQ8CHT1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC36,62■■■■□ 3,45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,8 ms