Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHC4

Synj1, Synaptojanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Synj1Q8CHC4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,77■■■■■ 5,56
Synj1Q8CHC4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49,72■■■■■ 5,55
Synj1Q8CHC4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,68■■■■■ 5,54
Synj1Q8CHC4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC49,67■■■■■ 5,54
Synj1Q8CHC4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,62■■■■■ 5,53
Synj1Q8CHC4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC49,6■■■■■ 5,53
Synj1Q8CHC4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,56■■■■■ 5,52
Synj1Q8CHC4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,49■■■■■ 5,51
Synj1Q8CHC4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,49■■■■■ 5,51
Synj1Q8CHC4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,48■■■■■ 5,51
Synj1Q8CHC4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,47■■■■■ 5,51
Synj1Q8CHC4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,45■■■■■ 5,51
Synj1Q8CHC4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,44■■■■■ 5,5
Synj1Q8CHC4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,42■■■■■ 5,5
Synj1Q8CHC4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC49,39■■■■■ 5,5
Synj1Q8CHC4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC49,2■■■■■ 5,47
Synj1Q8CHC4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,12■■■■■ 5,45
Synj1Q8CHC4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC49,08■■■■■ 5,45
Synj1Q8CHC4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49,03■■■■■ 5,44
Synj1Q8CHC4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC49,02■■■■■ 5,44
Synj1Q8CHC4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC49,02■■■■■ 5,44
Synj1Q8CHC4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49■■■■■ 5,44
Synj1Q8CHC4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,98■■■■■ 5,43
Synj1Q8CHC4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48,91■■■■■ 5,42
Synj1Q8CHC4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC48,9■■■■■ 5,42
Synj1Q8CHC4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC48,88■■■■■ 5,42
Synj1Q8CHC4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,86■■■■■ 5,41
Synj1Q8CHC4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,77■■■■■ 5,4
Synj1Q8CHC4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC48,77■■■■■ 5,4
Synj1Q8CHC4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,76■■■■■ 5,4
Synj1Q8CHC4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC48,73■■■■■ 5,39
Synj1Q8CHC4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,71■■■■■ 5,39
Synj1Q8CHC4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC48,69■■■■■ 5,38
Synj1Q8CHC4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC48,65■■■■■ 5,38
Synj1Q8CHC4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC48,64■■■■■ 5,38
Synj1Q8CHC4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC48,64■■■■■ 5,38
Synj1Q8CHC4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48,64■■■■■ 5,38
Synj1Q8CHC4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC48,64■■■■■ 5,38
Synj1Q8CHC4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,61■■■■■ 5,37
Synj1Q8CHC4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC48,61■■■■■ 5,37
Synj1Q8CHC4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,56■■■■■ 5,36
Synj1Q8CHC4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC48,52■■■■■ 5,36
Synj1Q8CHC4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC48,51■■■■■ 5,36
Synj1Q8CHC4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC48,49■■■■■ 5,35
Synj1Q8CHC4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC48,45■■■■■ 5,35
Synj1Q8CHC4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC48,38■■■■■ 5,33
Synj1Q8CHC4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC48,37■■■■■ 5,33
Synj1Q8CHC4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48,28■■■■■ 5,32
Synj1Q8CHC4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC48,25■■■■■ 5,31
Synj1Q8CHC4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,17■■■■■ 5,3
Synj1Q8CHC4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC48,15■■■■■ 5,3
Synj1Q8CHC4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC48,15■■■■■ 5,3
Synj1Q8CHC4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC48,13■■■■■ 5,29
Synj1Q8CHC4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC48,08■■■■■ 5,29
Synj1Q8CHC4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC48,07■■■■■ 5,29
Synj1Q8CHC4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,04■■■■■ 5,28
Synj1Q8CHC4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC48,04■■■■■ 5,28
Synj1Q8CHC4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC48,02■■■■■ 5,28
Synj1Q8CHC4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48■■■■■ 5,27
Synj1Q8CHC4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,96■■■■■ 5,27
Synj1Q8CHC4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47,93■■■■■ 5,26
Synj1Q8CHC4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC47,91■■■■■ 5,26
Synj1Q8CHC4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,86■■■■■ 5,25
Synj1Q8CHC4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,85■■■■■ 5,25
Synj1Q8CHC4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,81■■■■■ 5,24
Synj1Q8CHC4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,81■■■■■ 5,24
Synj1Q8CHC4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47,8■■■■■ 5,24
Synj1Q8CHC4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,79■■■■■ 5,24
Synj1Q8CHC4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,75■■■■■ 5,23
Synj1Q8CHC4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC47,74■■■■■ 5,23
Synj1Q8CHC4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,69■■■■■ 5,23
Synj1Q8CHC4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC47,65■■■■■ 5,22
Synj1Q8CHC4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47,62■■■■■ 5,21
Synj1Q8CHC4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC47,58■■■■■ 5,21
Synj1Q8CHC4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47,52■■■■■ 5,2
Synj1Q8CHC4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47,52■■■■■ 5,2
Synj1Q8CHC4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,51■■■■■ 5,2
Synj1Q8CHC4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC47,46■■■■■ 5,19
Synj1Q8CHC4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC47,45■■■■■ 5,19
Synj1Q8CHC4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,44■■■■■ 5,19
Synj1Q8CHC4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC47,44■■■■■ 5,19
Synj1Q8CHC4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC47,43■■■■■ 5,18
Synj1Q8CHC4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC47,42■■■■■ 5,18
Synj1Q8CHC4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC47,38■■■■■ 5,17
Synj1Q8CHC4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC47,36■■■■■ 5,17
Synj1Q8CHC4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC47,34■■■■■ 5,17
Synj1Q8CHC4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC47,32■■■■■ 5,17
Synj1Q8CHC4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC47,28■■■■■ 5,16
Synj1Q8CHC4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,27■■■■■ 5,16
Synj1Q8CHC4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC47,24■■■■■ 5,15
Synj1Q8CHC4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,23■■■■■ 5,15
Synj1Q8CHC4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC47,21■■■■■ 5,15
Synj1Q8CHC4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC47,19■■■■■ 5,14
Synj1Q8CHC4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC47,18■■■■■ 5,14
Synj1Q8CHC4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,17■■■■■ 5,14
Synj1Q8CHC4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC47,15■■■■■ 5,14
Synj1Q8CHC4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC47,14■■■■■ 5,14
Synj1Q8CHC4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC47,11■■■■■ 5,13
Synj1Q8CHC4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47,1■■■■■ 5,13
Synj1Q8CHC4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47,07■■■■■ 5,13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78,6 ms