Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22,12■■□□□ 1,13
Ercc8Q8CFD5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
Ercc8Q8CFD5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22,1■■□□□ 1,13
Ercc8Q8CFD5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,09■■□□□ 1,13
Ercc8Q8CFD5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22,06■■□□□ 1,12
Ercc8Q8CFD5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
Ercc8Q8CFD5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1,11
Ercc8Q8CFD5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
Ercc8Q8CFD5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
Ercc8Q8CFD5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
Ercc8Q8CFD5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,95■■□□□ 1,1
Ercc8Q8CFD5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21,94■■□□□ 1,1
Ercc8Q8CFD5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21,93■■□□□ 1,1
Ercc8Q8CFD5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
Ercc8Q8CFD5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,87■■□□□ 1,09
Ercc8Q8CFD5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
Ercc8Q8CFD5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21,8■■□□□ 1,08
Ercc8Q8CFD5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
Ercc8Q8CFD5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
Ercc8Q8CFD5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
Ercc8Q8CFD5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
Ercc8Q8CFD5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,76■■□□□ 1,07
Ercc8Q8CFD5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21,73■■□□□ 1,07
Ercc8Q8CFD5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
Ercc8Q8CFD5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
Ercc8Q8CFD5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
Ercc8Q8CFD5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21,69■■□□□ 1,06
Ercc8Q8CFD5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
Ercc8Q8CFD5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21,66■■□□□ 1,06
Ercc8Q8CFD5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21,65■■□□□ 1,06
Ercc8Q8CFD5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
Ercc8Q8CFD5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
Ercc8Q8CFD5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21,61■■□□□ 1,05
Ercc8Q8CFD5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Ercc8Q8CFD5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,6■■□□□ 1,05
Ercc8Q8CFD5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
Ercc8Q8CFD5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
Ercc8Q8CFD5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21,56■■□□□ 1,04
Ercc8Q8CFD5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Ercc8Q8CFD5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,56■■□□□ 1,04
Ercc8Q8CFD5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Ercc8Q8CFD5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21,54■■□□□ 1,04
Ercc8Q8CFD5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
Ercc8Q8CFD5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Ercc8Q8CFD5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Ercc8Q8CFD5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
Ercc8Q8CFD5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
Ercc8Q8CFD5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
Ercc8Q8CFD5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
Ercc8Q8CFD5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
Ercc8Q8CFD5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
Ercc8Q8CFD5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21,46■■□□□ 1,03
Ercc8Q8CFD5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21,45■■□□□ 1,02
Ercc8Q8CFD5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21,44■■□□□ 1,02
Ercc8Q8CFD5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
Ercc8Q8CFD5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21,39■■□□□ 1,02
Ercc8Q8CFD5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,01
Ercc8Q8CFD5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21,39■■□□□ 1,01
Ercc8Q8CFD5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
Ercc8Q8CFD5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1,01
Ercc8Q8CFD5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1
Ercc8Q8CFD5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
Ercc8Q8CFD5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21,23■□□□□ 0,99
Ercc8Q8CFD5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
Ercc8Q8CFD5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21,21■□□□□ 0,99
Ercc8Q8CFD5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
Ercc8Q8CFD5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
Ercc8Q8CFD5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
Ercc8Q8CFD5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21,19■□□□□ 0,98
Ercc8Q8CFD5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Ercc8Q8CFD5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Ercc8Q8CFD5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
Ercc8Q8CFD5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
Ercc8Q8CFD5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
Ercc8Q8CFD5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
Ercc8Q8CFD5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Ercc8Q8CFD5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21,11■□□□□ 0,97
Ercc8Q8CFD5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,1■□□□□ 0,97
Ercc8Q8CFD5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21,1■□□□□ 0,97
Ercc8Q8CFD5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Ercc8Q8CFD5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,97
Ercc8Q8CFD5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Ercc8Q8CFD5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Ercc8Q8CFD5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Ercc8Q8CFD5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21,04■□□□□ 0,96
Ercc8Q8CFD5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Ercc8Q8CFD5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Ercc8Q8CFD5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Ercc8Q8CFD5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21,04■□□□□ 0,96
Ercc8Q8CFD5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21,03■□□□□ 0,96
Ercc8Q8CFD5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,02■□□□□ 0,96
Ercc8Q8CFD5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,01■□□□□ 0,95
Ercc8Q8CFD5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0,95
Ercc8Q8CFD5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Ercc8Q8CFD5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20,99■□□□□ 0,95
Ercc8Q8CFD5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20,97■□□□□ 0,95
Ercc8Q8CFD5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,97■□□□□ 0,95
Ercc8Q8CFD5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
Ercc8Q8CFD5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
Ercc8Q8CFD5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,95■□□□□ 0,94
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