Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDU4

Fbxl13, F-box/LRR-repeat protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxl13Q8CDU4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29,56■■■□□ 2,32
Fbxl13Q8CDU4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29,55■■■□□ 2,32
Fbxl13Q8CDU4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Fbxl13Q8CDU4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29,54■■■□□ 2,32
Fbxl13Q8CDU4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29,54■■■□□ 2,32
Fbxl13Q8CDU4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Fbxl13Q8CDU4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Fbxl13Q8CDU4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Fbxl13Q8CDU4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,43■■■□□ 2,3
Fbxl13Q8CDU4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29,43■■■□□ 2,3
Fbxl13Q8CDU4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29,37■■■□□ 2,29
Fbxl13Q8CDU4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Fbxl13Q8CDU4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Fbxl13Q8CDU4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Fbxl13Q8CDU4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Fbxl13Q8CDU4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Fbxl13Q8CDU4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29,23■■■□□ 2,27
Fbxl13Q8CDU4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,27
Fbxl13Q8CDU4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Fbxl13Q8CDU4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Fbxl13Q8CDU4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Fbxl13Q8CDU4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Fbxl13Q8CDU4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,09■■■□□ 2,25
Fbxl13Q8CDU4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29,09■■■□□ 2,25
Fbxl13Q8CDU4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29,08■■■□□ 2,25
Fbxl13Q8CDU4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Fbxl13Q8CDU4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Fbxl13Q8CDU4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2,23
Fbxl13Q8CDU4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Fbxl13Q8CDU4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Fbxl13Q8CDU4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28,96■■■□□ 2,23
Fbxl13Q8CDU4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,23
Fbxl13Q8CDU4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,92■■■□□ 2,22
Fbxl13Q8CDU4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Fbxl13Q8CDU4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Fbxl13Q8CDU4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Fbxl13Q8CDU4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Fbxl13Q8CDU4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Fbxl13Q8CDU4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Fbxl13Q8CDU4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28,77■■■□□ 2,2
Fbxl13Q8CDU4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28,75■■■□□ 2,19
Fbxl13Q8CDU4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Fbxl13Q8CDU4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,71■■■□□ 2,19
Fbxl13Q8CDU4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,19
Fbxl13Q8CDU4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,67■■■□□ 2,18
Fbxl13Q8CDU4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28,64■■■□□ 2,18
Fbxl13Q8CDU4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28,63■■■□□ 2,17
Fbxl13Q8CDU4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Fbxl13Q8CDU4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28,59■■■□□ 2,17
Fbxl13Q8CDU4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Fbxl13Q8CDU4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Fbxl13Q8CDU4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28,55■■■□□ 2,16
Fbxl13Q8CDU4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28,55■■■□□ 2,16
Fbxl13Q8CDU4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Fbxl13Q8CDU4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Fbxl13Q8CDU4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28,51■■■□□ 2,15
Fbxl13Q8CDU4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Fbxl13Q8CDU4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Fbxl13Q8CDU4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Fbxl13Q8CDU4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Fbxl13Q8CDU4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28,46■■■□□ 2,15
Fbxl13Q8CDU4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Fbxl13Q8CDU4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Fbxl13Q8CDU4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Fbxl13Q8CDU4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Fbxl13Q8CDU4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28,35■■■□□ 2,13
Fbxl13Q8CDU4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Fbxl13Q8CDU4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Fbxl13Q8CDU4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Fbxl13Q8CDU4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Fbxl13Q8CDU4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Fbxl13Q8CDU4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Fbxl13Q8CDU4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Fbxl13Q8CDU4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Fbxl13Q8CDU4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Fbxl13Q8CDU4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Fbxl13Q8CDU4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Fbxl13Q8CDU4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,17■■■□□ 2,1
Fbxl13Q8CDU4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28,15■■■□□ 2,1
Fbxl13Q8CDU4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Fbxl13Q8CDU4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Fbxl13Q8CDU4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Fbxl13Q8CDU4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28,1■■■□□ 2,09
Fbxl13Q8CDU4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Fbxl13Q8CDU4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Fbxl13Q8CDU4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Fbxl13Q8CDU4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Fbxl13Q8CDU4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Fbxl13Q8CDU4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27,98■■■□□ 2,07
Fbxl13Q8CDU4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Fbxl13Q8CDU4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27,95■■■□□ 2,06
Fbxl13Q8CDU4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Fbxl13Q8CDU4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Fbxl13Q8CDU4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27,93■■■□□ 2,06
Fbxl13Q8CDU4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27,92■■■□□ 2,06
Fbxl13Q8CDU4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,92■■■□□ 2,06
Fbxl13Q8CDU4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27,92■■■□□ 2,06
Fbxl13Q8CDU4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Fbxl13Q8CDU4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Fbxl13Q8CDU4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61,5 ms