Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC62

Teddm1b, MCG53738, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Teddm1bQ8CC62 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Teddm1bQ8CC62 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Teddm1bQ8CC62 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Teddm1bQ8CC62 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Teddm1bQ8CC62 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Teddm1bQ8CC62 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Teddm1bQ8CC62 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Teddm1bQ8CC62 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Teddm1bQ8CC62 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Teddm1bQ8CC62 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Teddm1bQ8CC62 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Teddm1bQ8CC62 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Teddm1bQ8CC62 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Teddm1bQ8CC62 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Teddm1bQ8CC62 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Teddm1bQ8CC62 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Teddm1bQ8CC62 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Teddm1bQ8CC62 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Teddm1bQ8CC62 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Teddm1bQ8CC62 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Teddm1bQ8CC62 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Teddm1bQ8CC62 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Teddm1bQ8CC62 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Teddm1bQ8CC62 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Teddm1bQ8CC62 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Teddm1bQ8CC62 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Teddm1bQ8CC62 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Teddm1bQ8CC62 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Teddm1bQ8CC62 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Teddm1bQ8CC62 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Teddm1bQ8CC62 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Teddm1bQ8CC62 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Teddm1bQ8CC62 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Teddm1bQ8CC62 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Teddm1bQ8CC62 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Teddm1bQ8CC62 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Teddm1bQ8CC62 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Teddm1bQ8CC62 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Teddm1bQ8CC62 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Teddm1bQ8CC62 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Teddm1bQ8CC62 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Teddm1bQ8CC62 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Teddm1bQ8CC62 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Teddm1bQ8CC62 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Teddm1bQ8CC62 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Teddm1bQ8CC62 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Teddm1bQ8CC62 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Teddm1bQ8CC62 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Teddm1bQ8CC62 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Teddm1bQ8CC62 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Teddm1bQ8CC62 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Teddm1bQ8CC62 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Teddm1bQ8CC62 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Teddm1bQ8CC62 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Teddm1bQ8CC62 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Teddm1bQ8CC62 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Teddm1bQ8CC62 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Teddm1bQ8CC62 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Teddm1bQ8CC62 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Teddm1bQ8CC62 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Teddm1bQ8CC62 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Teddm1bQ8CC62 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Teddm1bQ8CC62 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Teddm1bQ8CC62 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Teddm1bQ8CC62 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Teddm1bQ8CC62 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Teddm1bQ8CC62 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Teddm1bQ8CC62 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Teddm1bQ8CC62 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Teddm1bQ8CC62 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Teddm1bQ8CC62 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Teddm1bQ8CC62 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Teddm1bQ8CC62 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Teddm1bQ8CC62 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Teddm1bQ8CC62 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Teddm1bQ8CC62 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Teddm1bQ8CC62 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Teddm1bQ8CC62 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Teddm1bQ8CC62 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Teddm1bQ8CC62 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Teddm1bQ8CC62 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Teddm1bQ8CC62 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Teddm1bQ8CC62 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Teddm1bQ8CC62 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Teddm1bQ8CC62 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Teddm1bQ8CC62 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Teddm1bQ8CC62 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Teddm1bQ8CC62 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Teddm1bQ8CC62 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Teddm1bQ8CC62 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Teddm1bQ8CC62 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Teddm1bQ8CC62 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Teddm1bQ8CC62 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Teddm1bQ8CC62 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Teddm1bQ8CC62 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Teddm1bQ8CC62 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Teddm1bQ8CC62 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Teddm1bQ8CC62 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Teddm1bQ8CC62 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Teddm1bQ8CC62 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms