Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBW7

Chic1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chic1Q8CBW7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC46.99■■■■■ 5.11
Chic1Q8CBW7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.97■■■■■ 5.11
Chic1Q8CBW7 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC46.96■■■■■ 5.11
Chic1Q8CBW7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC46.92■■■■■ 5.1
Chic1Q8CBW7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.78■■■■■ 5.08
Chic1Q8CBW7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC46.77■■■■■ 5.08
Chic1Q8CBW7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC46.72■■■■■ 5.07
Chic1Q8CBW7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC46.69■■■■■ 5.06
Chic1Q8CBW7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.67■■■■■ 5.06
Chic1Q8CBW7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC46.63■■■■■ 5.06
Chic1Q8CBW7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC46.6■■■■■ 5.05
Chic1Q8CBW7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.58■■■■■ 5.05
Chic1Q8CBW7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.5■■■■■ 5.03
Chic1Q8CBW7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC46.42■■■■■ 5.02
Chic1Q8CBW7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC46.39■■■■■ 5.02
Chic1Q8CBW7 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC46.37■■■■■ 5.01
Chic1Q8CBW7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.35■■■■■ 5.01
Chic1Q8CBW7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.34■■■■■ 5.01
Chic1Q8CBW7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC46.3■■■■■ 5
Chic1Q8CBW7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
Chic1Q8CBW7 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC46.26■■■■■ 5
Chic1Q8CBW7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.25■■■■■ 4.99
Chic1Q8CBW7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.17■■■■■ 4.98
Chic1Q8CBW7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.16■■■■■ 4.98
Chic1Q8CBW7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
Chic1Q8CBW7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC46.08■■■■■ 4.97
Chic1Q8CBW7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.08■■■■■ 4.97
Chic1Q8CBW7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.02■■■■■ 4.96
Chic1Q8CBW7 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC46.01■■■■■ 4.96
Chic1Q8CBW7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.99■■■■■ 4.95
Chic1Q8CBW7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
Chic1Q8CBW7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC45.97■■■■■ 4.95
Chic1Q8CBW7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.95■■■■■ 4.95
Chic1Q8CBW7 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.93■■■■■ 4.94
Chic1Q8CBW7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.91■■■■■ 4.94
Chic1Q8CBW7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC45.9■■■■■ 4.94
Chic1Q8CBW7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.87■■■■■ 4.93
Chic1Q8CBW7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC45.74■■■■■ 4.91
Chic1Q8CBW7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC45.72■■■■■ 4.91
Chic1Q8CBW7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC45.69■■■■■ 4.9
Chic1Q8CBW7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
Chic1Q8CBW7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.63■■■■■ 4.9
Chic1Q8CBW7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC45.61■■■■■ 4.89
Chic1Q8CBW7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
Chic1Q8CBW7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC45.59■■■■■ 4.89
Chic1Q8CBW7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.58■■■■■ 4.89
Chic1Q8CBW7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
Chic1Q8CBW7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
Chic1Q8CBW7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
Chic1Q8CBW7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
Chic1Q8CBW7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
Chic1Q8CBW7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC45.46■■■■■ 4.87
Chic1Q8CBW7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.46■■■■■ 4.87
Chic1Q8CBW7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC45.43■■■■■ 4.86
Chic1Q8CBW7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.4■■■■■ 4.86
Chic1Q8CBW7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
Chic1Q8CBW7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC45.33■■■■■ 4.85
Chic1Q8CBW7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC45.33■■■■■ 4.85
Chic1Q8CBW7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC45.29■■■■■ 4.84
Chic1Q8CBW7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
Chic1Q8CBW7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
Chic1Q8CBW7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC45.25■■■■■ 4.83
Chic1Q8CBW7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
Chic1Q8CBW7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
Chic1Q8CBW7 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC44.99■■■■■ 4.79
Chic1Q8CBW7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC44.99■■■■■ 4.79
Chic1Q8CBW7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC44.98■■■■■ 4.79
Chic1Q8CBW7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
Chic1Q8CBW7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
Chic1Q8CBW7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
Chic1Q8CBW7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
Chic1Q8CBW7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
Chic1Q8CBW7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
Chic1Q8CBW7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
Chic1Q8CBW7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
Chic1Q8CBW7 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC44.85■■■■■ 4.77
Chic1Q8CBW7 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
Chic1Q8CBW7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
Chic1Q8CBW7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
Chic1Q8CBW7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
Chic1Q8CBW7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
Chic1Q8CBW7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.7■■■■■ 4.75
Chic1Q8CBW7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.66■■■■■ 4.74
Chic1Q8CBW7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
Chic1Q8CBW7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.73
Chic1Q8CBW7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
Chic1Q8CBW7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.61■■■■■ 4.73
Chic1Q8CBW7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC44.45■■■■■ 4.71
Chic1Q8CBW7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC44.44■■■■■ 4.7
Chic1Q8CBW7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
Chic1Q8CBW7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
Chic1Q8CBW7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
Chic1Q8CBW7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
Chic1Q8CBW7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
Chic1Q8CBW7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.31■■■■■ 4.68
Chic1Q8CBW7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
Chic1Q8CBW7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC44.3■■■■■ 4.68
Chic1Q8CBW7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC44.3■■■■■ 4.68
Chic1Q8CBW7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
Chic1Q8CBW7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms