Protein–RNA interactions for Protein: Q8C050

Rps6ka5, Ribosomal protein S6 kinase alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka5Q8C050 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rps6ka5Q8C050 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rps6ka5Q8C050 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rps6ka5Q8C050 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rps6ka5Q8C050 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rps6ka5Q8C050 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rps6ka5Q8C050 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Rps6ka5Q8C050 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rps6ka5Q8C050 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rps6ka5Q8C050 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rps6ka5Q8C050 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rps6ka5Q8C050 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rps6ka5Q8C050 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rps6ka5Q8C050 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rps6ka5Q8C050 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rps6ka5Q8C050 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rps6ka5Q8C050 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rps6ka5Q8C050 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Rps6ka5Q8C050 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rps6ka5Q8C050 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rps6ka5Q8C050 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rps6ka5Q8C050 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Rps6ka5Q8C050 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rps6ka5Q8C050 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rps6ka5Q8C050 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rps6ka5Q8C050 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rps6ka5Q8C050 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rps6ka5Q8C050 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rps6ka5Q8C050 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rps6ka5Q8C050 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rps6ka5Q8C050 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Rps6ka5Q8C050 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rps6ka5Q8C050 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rps6ka5Q8C050 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rps6ka5Q8C050 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Rps6ka5Q8C050 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rps6ka5Q8C050 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Rps6ka5Q8C050 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rps6ka5Q8C050 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rps6ka5Q8C050 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rps6ka5Q8C050 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Rps6ka5Q8C050 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rps6ka5Q8C050 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rps6ka5Q8C050 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rps6ka5Q8C050 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rps6ka5Q8C050 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rps6ka5Q8C050 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rps6ka5Q8C050 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Rps6ka5Q8C050 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rps6ka5Q8C050 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rps6ka5Q8C050 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rps6ka5Q8C050 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rps6ka5Q8C050 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rps6ka5Q8C050 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Rps6ka5Q8C050 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rps6ka5Q8C050 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rps6ka5Q8C050 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rps6ka5Q8C050 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Rps6ka5Q8C050 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rps6ka5Q8C050 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rps6ka5Q8C050 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rps6ka5Q8C050 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rps6ka5Q8C050 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rps6ka5Q8C050 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rps6ka5Q8C050 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rps6ka5Q8C050 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rps6ka5Q8C050 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rps6ka5Q8C050 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rps6ka5Q8C050 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rps6ka5Q8C050 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rps6ka5Q8C050 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Rps6ka5Q8C050 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rps6ka5Q8C050 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rps6ka5Q8C050 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rps6ka5Q8C050 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rps6ka5Q8C050 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rps6ka5Q8C050 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rps6ka5Q8C050 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rps6ka5Q8C050 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Rps6ka5Q8C050 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rps6ka5Q8C050 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rps6ka5Q8C050 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rps6ka5Q8C050 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rps6ka5Q8C050 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rps6ka5Q8C050 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rps6ka5Q8C050 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rps6ka5Q8C050 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rps6ka5Q8C050 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rps6ka5Q8C050 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Rps6ka5Q8C050 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rps6ka5Q8C050 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rps6ka5Q8C050 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rps6ka5Q8C050 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rps6ka5Q8C050 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rps6ka5Q8C050 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rps6ka5Q8C050 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rps6ka5Q8C050 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rps6ka5Q8C050 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rps6ka5Q8C050 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Rps6ka5Q8C050 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms