Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYK6

Ythdf3, YTH domain-containing family protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdf3Q8BYK6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ythdf3Q8BYK6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ythdf3Q8BYK6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ythdf3Q8BYK6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ythdf3Q8BYK6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Ythdf3Q8BYK6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ythdf3Q8BYK6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ythdf3Q8BYK6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ythdf3Q8BYK6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Ythdf3Q8BYK6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ythdf3Q8BYK6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ythdf3Q8BYK6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ythdf3Q8BYK6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ythdf3Q8BYK6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ythdf3Q8BYK6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ythdf3Q8BYK6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ythdf3Q8BYK6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ythdf3Q8BYK6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Ythdf3Q8BYK6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ythdf3Q8BYK6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ythdf3Q8BYK6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ythdf3Q8BYK6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ythdf3Q8BYK6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ythdf3Q8BYK6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ythdf3Q8BYK6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ythdf3Q8BYK6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ythdf3Q8BYK6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ythdf3Q8BYK6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ythdf3Q8BYK6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ythdf3Q8BYK6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ythdf3Q8BYK6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ythdf3Q8BYK6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ythdf3Q8BYK6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Ythdf3Q8BYK6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ythdf3Q8BYK6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ythdf3Q8BYK6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ythdf3Q8BYK6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ythdf3Q8BYK6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ythdf3Q8BYK6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ythdf3Q8BYK6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ythdf3Q8BYK6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ythdf3Q8BYK6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ythdf3Q8BYK6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ythdf3Q8BYK6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ythdf3Q8BYK6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ythdf3Q8BYK6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ythdf3Q8BYK6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Ythdf3Q8BYK6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ythdf3Q8BYK6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ythdf3Q8BYK6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ythdf3Q8BYK6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ythdf3Q8BYK6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ythdf3Q8BYK6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ythdf3Q8BYK6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ythdf3Q8BYK6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ythdf3Q8BYK6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ythdf3Q8BYK6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ythdf3Q8BYK6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ythdf3Q8BYK6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Ythdf3Q8BYK6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ythdf3Q8BYK6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ythdf3Q8BYK6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ythdf3Q8BYK6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ythdf3Q8BYK6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ythdf3Q8BYK6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ythdf3Q8BYK6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ythdf3Q8BYK6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ythdf3Q8BYK6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ythdf3Q8BYK6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ythdf3Q8BYK6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ythdf3Q8BYK6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ythdf3Q8BYK6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ythdf3Q8BYK6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ythdf3Q8BYK6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ythdf3Q8BYK6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ythdf3Q8BYK6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ythdf3Q8BYK6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ythdf3Q8BYK6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ythdf3Q8BYK6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ythdf3Q8BYK6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ythdf3Q8BYK6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ythdf3Q8BYK6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ythdf3Q8BYK6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ythdf3Q8BYK6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ythdf3Q8BYK6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ythdf3Q8BYK6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ythdf3Q8BYK6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ythdf3Q8BYK6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ythdf3Q8BYK6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ythdf3Q8BYK6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ythdf3Q8BYK6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ythdf3Q8BYK6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ythdf3Q8BYK6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ythdf3Q8BYK6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ythdf3Q8BYK6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ythdf3Q8BYK6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ythdf3Q8BYK6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ythdf3Q8BYK6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Ythdf3Q8BYK6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ythdf3Q8BYK6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 178.2 ms