Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWU1

Sprn, Shadow of prion protein, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SprnQ8BWU1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SprnQ8BWU1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SprnQ8BWU1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SprnQ8BWU1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SprnQ8BWU1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SprnQ8BWU1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SprnQ8BWU1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SprnQ8BWU1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SprnQ8BWU1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SprnQ8BWU1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SprnQ8BWU1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SprnQ8BWU1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SprnQ8BWU1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SprnQ8BWU1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SprnQ8BWU1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SprnQ8BWU1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SprnQ8BWU1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SprnQ8BWU1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SprnQ8BWU1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SprnQ8BWU1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SprnQ8BWU1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SprnQ8BWU1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SprnQ8BWU1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SprnQ8BWU1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SprnQ8BWU1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SprnQ8BWU1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SprnQ8BWU1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SprnQ8BWU1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SprnQ8BWU1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SprnQ8BWU1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SprnQ8BWU1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SprnQ8BWU1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SprnQ8BWU1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SprnQ8BWU1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SprnQ8BWU1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SprnQ8BWU1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SprnQ8BWU1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SprnQ8BWU1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SprnQ8BWU1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SprnQ8BWU1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SprnQ8BWU1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SprnQ8BWU1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SprnQ8BWU1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SprnQ8BWU1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SprnQ8BWU1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SprnQ8BWU1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SprnQ8BWU1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SprnQ8BWU1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SprnQ8BWU1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SprnQ8BWU1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SprnQ8BWU1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SprnQ8BWU1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SprnQ8BWU1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SprnQ8BWU1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SprnQ8BWU1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SprnQ8BWU1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SprnQ8BWU1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SprnQ8BWU1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SprnQ8BWU1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SprnQ8BWU1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SprnQ8BWU1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SprnQ8BWU1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SprnQ8BWU1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SprnQ8BWU1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SprnQ8BWU1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SprnQ8BWU1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SprnQ8BWU1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SprnQ8BWU1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SprnQ8BWU1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SprnQ8BWU1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SprnQ8BWU1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SprnQ8BWU1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SprnQ8BWU1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SprnQ8BWU1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SprnQ8BWU1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SprnQ8BWU1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SprnQ8BWU1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SprnQ8BWU1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SprnQ8BWU1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SprnQ8BWU1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SprnQ8BWU1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SprnQ8BWU1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SprnQ8BWU1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SprnQ8BWU1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SprnQ8BWU1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SprnQ8BWU1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SprnQ8BWU1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SprnQ8BWU1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SprnQ8BWU1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SprnQ8BWU1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SprnQ8BWU1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SprnQ8BWU1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SprnQ8BWU1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SprnQ8BWU1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SprnQ8BWU1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SprnQ8BWU1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SprnQ8BWU1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SprnQ8BWU1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SprnQ8BWU1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SprnQ8BWU1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms