Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWM3

Stfa2l1, MCG130173, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa2l1Q8BWM3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Stfa2l1Q8BWM3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stfa2l1Q8BWM3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stfa2l1Q8BWM3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stfa2l1Q8BWM3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stfa2l1Q8BWM3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Stfa2l1Q8BWM3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stfa2l1Q8BWM3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stfa2l1Q8BWM3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Stfa2l1Q8BWM3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stfa2l1Q8BWM3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Stfa2l1Q8BWM3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stfa2l1Q8BWM3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stfa2l1Q8BWM3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stfa2l1Q8BWM3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stfa2l1Q8BWM3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stfa2l1Q8BWM3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stfa2l1Q8BWM3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stfa2l1Q8BWM3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Stfa2l1Q8BWM3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Stfa2l1Q8BWM3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stfa2l1Q8BWM3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stfa2l1Q8BWM3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stfa2l1Q8BWM3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stfa2l1Q8BWM3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stfa2l1Q8BWM3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stfa2l1Q8BWM3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stfa2l1Q8BWM3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stfa2l1Q8BWM3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Stfa2l1Q8BWM3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stfa2l1Q8BWM3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stfa2l1Q8BWM3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stfa2l1Q8BWM3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stfa2l1Q8BWM3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stfa2l1Q8BWM3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stfa2l1Q8BWM3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stfa2l1Q8BWM3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Stfa2l1Q8BWM3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stfa2l1Q8BWM3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stfa2l1Q8BWM3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stfa2l1Q8BWM3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stfa2l1Q8BWM3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stfa2l1Q8BWM3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stfa2l1Q8BWM3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stfa2l1Q8BWM3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stfa2l1Q8BWM3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stfa2l1Q8BWM3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stfa2l1Q8BWM3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Stfa2l1Q8BWM3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stfa2l1Q8BWM3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stfa2l1Q8BWM3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stfa2l1Q8BWM3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stfa2l1Q8BWM3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stfa2l1Q8BWM3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Stfa2l1Q8BWM3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stfa2l1Q8BWM3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stfa2l1Q8BWM3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Stfa2l1Q8BWM3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stfa2l1Q8BWM3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stfa2l1Q8BWM3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stfa2l1Q8BWM3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stfa2l1Q8BWM3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stfa2l1Q8BWM3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stfa2l1Q8BWM3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stfa2l1Q8BWM3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stfa2l1Q8BWM3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stfa2l1Q8BWM3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stfa2l1Q8BWM3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stfa2l1Q8BWM3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stfa2l1Q8BWM3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stfa2l1Q8BWM3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Stfa2l1Q8BWM3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stfa2l1Q8BWM3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stfa2l1Q8BWM3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Stfa2l1Q8BWM3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stfa2l1Q8BWM3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stfa2l1Q8BWM3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stfa2l1Q8BWM3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stfa2l1Q8BWM3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Stfa2l1Q8BWM3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stfa2l1Q8BWM3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stfa2l1Q8BWM3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stfa2l1Q8BWM3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stfa2l1Q8BWM3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stfa2l1Q8BWM3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stfa2l1Q8BWM3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stfa2l1Q8BWM3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stfa2l1Q8BWM3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stfa2l1Q8BWM3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Stfa2l1Q8BWM3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stfa2l1Q8BWM3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stfa2l1Q8BWM3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stfa2l1Q8BWM3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stfa2l1Q8BWM3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stfa2l1Q8BWM3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stfa2l1Q8BWM3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stfa2l1Q8BWM3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stfa2l1Q8BWM3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Stfa2l1Q8BWM3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Stfa2l1Q8BWM3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms