Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30,87■■■□□ 2,53
Usp38Q8BW70 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
Usp38Q8BW70 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30,82■■■□□ 2,52
Usp38Q8BW70 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Usp38Q8BW70 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,51
Usp38Q8BW70 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30,76■■■□□ 2,51
Usp38Q8BW70 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
Usp38Q8BW70 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30,72■■■□□ 2,51
Usp38Q8BW70 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,66■■■□□ 2,5
Usp38Q8BW70 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30,65■■■□□ 2,5
Usp38Q8BW70 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,49
Usp38Q8BW70 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30,62■■■□□ 2,49
Usp38Q8BW70 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Usp38Q8BW70 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30,58■■■□□ 2,49
Usp38Q8BW70 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,48
Usp38Q8BW70 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,47
Usp38Q8BW70 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30,51■■■□□ 2,47
Usp38Q8BW70 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,47
Usp38Q8BW70 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC30,42■■■□□ 2,46
Usp38Q8BW70 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Usp38Q8BW70 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,39■■■□□ 2,46
Usp38Q8BW70 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30,39■■■□□ 2,46
Usp38Q8BW70 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Usp38Q8BW70 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30,36■■■□□ 2,45
Usp38Q8BW70 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30,35■■■□□ 2,45
Usp38Q8BW70 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Usp38Q8BW70 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,31■■■□□ 2,44
Usp38Q8BW70 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC30,31■■■□□ 2,44
Usp38Q8BW70 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,3■■■□□ 2,44
Usp38Q8BW70 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Usp38Q8BW70 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC30,29■■■□□ 2,44
Usp38Q8BW70 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,25■■■□□ 2,43
Usp38Q8BW70 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
Usp38Q8BW70 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
Usp38Q8BW70 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
Usp38Q8BW70 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,43
Usp38Q8BW70 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Usp38Q8BW70 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Usp38Q8BW70 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Usp38Q8BW70 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Usp38Q8BW70 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Usp38Q8BW70 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Usp38Q8BW70 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC30,12■■■□□ 2,41
Usp38Q8BW70 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Usp38Q8BW70 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Usp38Q8BW70 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Usp38Q8BW70 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30,02■■■□□ 2,4
Usp38Q8BW70 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Usp38Q8BW70 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Usp38Q8BW70 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,97■■■□□ 2,39
Usp38Q8BW70 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29,96■■■□□ 2,39
Usp38Q8BW70 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29,95■■■□□ 2,39
Usp38Q8BW70 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,38
Usp38Q8BW70 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29,9■■■□□ 2,38
Usp38Q8BW70 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Usp38Q8BW70 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Usp38Q8BW70 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Usp38Q8BW70 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Usp38Q8BW70 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Usp38Q8BW70 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29,81■■■□□ 2,36
Usp38Q8BW70 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Usp38Q8BW70 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Usp38Q8BW70 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29,79■■■□□ 2,36
Usp38Q8BW70 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Usp38Q8BW70 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Usp38Q8BW70 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Usp38Q8BW70 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29,73■■■□□ 2,35
Usp38Q8BW70 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29,68■■■□□ 2,34
Usp38Q8BW70 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Usp38Q8BW70 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Usp38Q8BW70 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,64■■■□□ 2,34
Usp38Q8BW70 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,33
Usp38Q8BW70 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Usp38Q8BW70 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Usp38Q8BW70 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Usp38Q8BW70 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Usp38Q8BW70 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Usp38Q8BW70 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29,53■■■□□ 2,32
Usp38Q8BW70 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Usp38Q8BW70 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Usp38Q8BW70 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Usp38Q8BW70 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,45■■■□□ 2,31
Usp38Q8BW70 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Usp38Q8BW70 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Usp38Q8BW70 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Usp38Q8BW70 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Usp38Q8BW70 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Usp38Q8BW70 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Usp38Q8BW70 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29,36■■■□□ 2,29
Usp38Q8BW70 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Usp38Q8BW70 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29,35■■■□□ 2,29
Usp38Q8BW70 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Usp38Q8BW70 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Usp38Q8BW70 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29,31■■■□□ 2,28
Usp38Q8BW70 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Usp38Q8BW70 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Usp38Q8BW70 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Usp38Q8BW70 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Usp38Q8BW70 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Usp38Q8BW70 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,21■■■□□ 2,27
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