Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVW0

Ganc, Neutral alpha-glucosidase C, mousemouse

Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GancQ8BVW0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
GancQ8BVW0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GancQ8BVW0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GancQ8BVW0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GancQ8BVW0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GancQ8BVW0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
GancQ8BVW0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GancQ8BVW0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GancQ8BVW0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GancQ8BVW0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
GancQ8BVW0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GancQ8BVW0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GancQ8BVW0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GancQ8BVW0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GancQ8BVW0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GancQ8BVW0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GancQ8BVW0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
GancQ8BVW0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GancQ8BVW0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GancQ8BVW0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GancQ8BVW0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GancQ8BVW0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GancQ8BVW0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GancQ8BVW0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GancQ8BVW0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
GancQ8BVW0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GancQ8BVW0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GancQ8BVW0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GancQ8BVW0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GancQ8BVW0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GancQ8BVW0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GancQ8BVW0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GancQ8BVW0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GancQ8BVW0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GancQ8BVW0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GancQ8BVW0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GancQ8BVW0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GancQ8BVW0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GancQ8BVW0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
GancQ8BVW0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GancQ8BVW0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GancQ8BVW0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GancQ8BVW0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
GancQ8BVW0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GancQ8BVW0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GancQ8BVW0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GancQ8BVW0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GancQ8BVW0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GancQ8BVW0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GancQ8BVW0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GancQ8BVW0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GancQ8BVW0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GancQ8BVW0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GancQ8BVW0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GancQ8BVW0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GancQ8BVW0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GancQ8BVW0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GancQ8BVW0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GancQ8BVW0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GancQ8BVW0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
GancQ8BVW0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GancQ8BVW0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GancQ8BVW0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GancQ8BVW0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GancQ8BVW0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GancQ8BVW0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
GancQ8BVW0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GancQ8BVW0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GancQ8BVW0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GancQ8BVW0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GancQ8BVW0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GancQ8BVW0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GancQ8BVW0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GancQ8BVW0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
GancQ8BVW0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GancQ8BVW0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GancQ8BVW0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
GancQ8BVW0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
GancQ8BVW0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GancQ8BVW0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
GancQ8BVW0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GancQ8BVW0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GancQ8BVW0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
GancQ8BVW0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GancQ8BVW0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
GancQ8BVW0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GancQ8BVW0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
GancQ8BVW0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GancQ8BVW0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GancQ8BVW0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GancQ8BVW0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GancQ8BVW0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GancQ8BVW0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GancQ8BVW0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
GancQ8BVW0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GancQ8BVW0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GancQ8BVW0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GancQ8BVW0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GancQ8BVW0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GancQ8BVW0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms