Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUP8

Fam43a, Protein FAM43A, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43aQ8BUP8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Fam43aQ8BUP8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Fam43aQ8BUP8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29,88■■■□□ 2,37
Fam43aQ8BUP8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29,85■■■□□ 2,37
Fam43aQ8BUP8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Fam43aQ8BUP8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC29,83■■■□□ 2,37
Fam43aQ8BUP8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,8■■■□□ 2,36
Fam43aQ8BUP8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Fam43aQ8BUP8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Fam43aQ8BUP8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,34
Fam43aQ8BUP8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29,69■■■□□ 2,34
Fam43aQ8BUP8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,33
Fam43aQ8BUP8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,63■■■□□ 2,33
Fam43aQ8BUP8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Fam43aQ8BUP8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29,59■■■□□ 2,33
Fam43aQ8BUP8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Fam43aQ8BUP8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,53■■■□□ 2,32
Fam43aQ8BUP8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Fam43aQ8BUP8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Fam43aQ8BUP8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Fam43aQ8BUP8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Fam43aQ8BUP8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,49■■■□□ 2,31
Fam43aQ8BUP8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Fam43aQ8BUP8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Fam43aQ8BUP8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29,45■■■□□ 2,31
Fam43aQ8BUP8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,3
Fam43aQ8BUP8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Fam43aQ8BUP8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,43■■■□□ 2,3
Fam43aQ8BUP8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Fam43aQ8BUP8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Fam43aQ8BUP8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29,39■■■□□ 2,3
Fam43aQ8BUP8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Fam43aQ8BUP8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29,35■■■□□ 2,29
Fam43aQ8BUP8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Fam43aQ8BUP8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29,32■■■□□ 2,28
Fam43aQ8BUP8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29,31■■■□□ 2,28
Fam43aQ8BUP8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29,29■■■□□ 2,28
Fam43aQ8BUP8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Fam43aQ8BUP8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Fam43aQ8BUP8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,28
Fam43aQ8BUP8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Fam43aQ8BUP8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Fam43aQ8BUP8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Fam43aQ8BUP8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Fam43aQ8BUP8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29,19■■■□□ 2,26
Fam43aQ8BUP8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Fam43aQ8BUP8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Fam43aQ8BUP8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Fam43aQ8BUP8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Fam43aQ8BUP8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Fam43aQ8BUP8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,12■■■□□ 2,25
Fam43aQ8BUP8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Fam43aQ8BUP8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Fam43aQ8BUP8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Fam43aQ8BUP8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29,08■■■□□ 2,25
Fam43aQ8BUP8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29,01■■■□□ 2,23
Fam43aQ8BUP8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Fam43aQ8BUP8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Fam43aQ8BUP8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Fam43aQ8BUP8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Fam43aQ8BUP8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28,98■■■□□ 2,23
Fam43aQ8BUP8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,97■■■□□ 2,23
Fam43aQ8BUP8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Fam43aQ8BUP8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Fam43aQ8BUP8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Fam43aQ8BUP8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28,93■■■□□ 2,22
Fam43aQ8BUP8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Fam43aQ8BUP8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Fam43aQ8BUP8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Fam43aQ8BUP8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Fam43aQ8BUP8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,87■■■□□ 2,21
Fam43aQ8BUP8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Fam43aQ8BUP8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Fam43aQ8BUP8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Fam43aQ8BUP8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Fam43aQ8BUP8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Fam43aQ8BUP8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Fam43aQ8BUP8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Fam43aQ8BUP8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Fam43aQ8BUP8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,72■■■□□ 2,19
Fam43aQ8BUP8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28,71■■■□□ 2,19
Fam43aQ8BUP8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28,7■■■□□ 2,18
Fam43aQ8BUP8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Fam43aQ8BUP8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Fam43aQ8BUP8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Fam43aQ8BUP8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28,63■■■□□ 2,17
Fam43aQ8BUP8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28,63■■■□□ 2,17
Fam43aQ8BUP8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28,63■■■□□ 2,17
Fam43aQ8BUP8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28,6■■■□□ 2,17
Fam43aQ8BUP8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Fam43aQ8BUP8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Fam43aQ8BUP8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Fam43aQ8BUP8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Fam43aQ8BUP8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Fam43aQ8BUP8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Fam43aQ8BUP8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Fam43aQ8BUP8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28,5■■■□□ 2,15
Fam43aQ8BUP8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Fam43aQ8BUP8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Fam43aQ8BUP8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,8 ms