Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ30

Ppp1r18, Phostensin, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r18Q8BQ30 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC44.4■■■■■ 4.7
Ppp1r18Q8BQ30 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
Ppp1r18Q8BQ30 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC44.36■■■■■ 4.69
Ppp1r18Q8BQ30 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC44.35■■■■■ 4.69
Ppp1r18Q8BQ30 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC44.34■■■■■ 4.69
Ppp1r18Q8BQ30 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
Ppp1r18Q8BQ30 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
Ppp1r18Q8BQ30 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.06■■■■■ 4.64
Ppp1r18Q8BQ30 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC43.99■■■■■ 4.63
Ppp1r18Q8BQ30 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
Ppp1r18Q8BQ30 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
Ppp1r18Q8BQ30 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
Ppp1r18Q8BQ30 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC43.91■■■■■ 4.62
Ppp1r18Q8BQ30 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
Ppp1r18Q8BQ30 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC43.83■■■■■ 4.61
Ppp1r18Q8BQ30 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
Ppp1r18Q8BQ30 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
Ppp1r18Q8BQ30 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC43.74■■■■■ 4.59
Ppp1r18Q8BQ30 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC43.74■■■■■ 4.59
Ppp1r18Q8BQ30 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
Ppp1r18Q8BQ30 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC43.69■■■■■ 4.58
Ppp1r18Q8BQ30 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
Ppp1r18Q8BQ30 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC43.58■■■■■ 4.57
Ppp1r18Q8BQ30 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
Ppp1r18Q8BQ30 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.44■■■■■ 4.54
Ppp1r18Q8BQ30 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
Ppp1r18Q8BQ30 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC43.37■■■■■ 4.53
Ppp1r18Q8BQ30 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC43.34■■■■■ 4.53
Ppp1r18Q8BQ30 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
Ppp1r18Q8BQ30 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
Ppp1r18Q8BQ30 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.3■■■■■ 4.52
Ppp1r18Q8BQ30 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
Ppp1r18Q8BQ30 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
Ppp1r18Q8BQ30 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC43.24■■■■■ 4.51
Ppp1r18Q8BQ30 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC43.18■■■■■ 4.5
Ppp1r18Q8BQ30 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC43.18■■■■■ 4.5
Ppp1r18Q8BQ30 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC43.13■■■■■ 4.49
Ppp1r18Q8BQ30 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
Ppp1r18Q8BQ30 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC43.11■■■■■ 4.49
Ppp1r18Q8BQ30 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.1■■■■■ 4.49
Ppp1r18Q8BQ30 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
Ppp1r18Q8BQ30 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
Ppp1r18Q8BQ30 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
Ppp1r18Q8BQ30 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
Ppp1r18Q8BQ30 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC42.98■■■■■ 4.47
Ppp1r18Q8BQ30 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC42.97■■■■■ 4.47
Ppp1r18Q8BQ30 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
Ppp1r18Q8BQ30 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
Ppp1r18Q8BQ30 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC42.94■■■■■ 4.46
Ppp1r18Q8BQ30 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.92■■■■■ 4.46
Ppp1r18Q8BQ30 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
Ppp1r18Q8BQ30 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC42.89■■■■■ 4.46
Ppp1r18Q8BQ30 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.88■■■■■ 4.46
Ppp1r18Q8BQ30 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC42.85■■■■■ 4.45
Ppp1r18Q8BQ30 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
Ppp1r18Q8BQ30 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
Ppp1r18Q8BQ30 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
Ppp1r18Q8BQ30 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC42.8■■■■■ 4.44
Ppp1r18Q8BQ30 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC42.79■■■■■ 4.44
Ppp1r18Q8BQ30 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC42.77■■■■■ 4.44
Ppp1r18Q8BQ30 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
Ppp1r18Q8BQ30 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
Ppp1r18Q8BQ30 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC42.69■■■■■ 4.42
Ppp1r18Q8BQ30 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
Ppp1r18Q8BQ30 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
Ppp1r18Q8BQ30 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
Ppp1r18Q8BQ30 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
Ppp1r18Q8BQ30 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC42.58■■■■■ 4.41
Ppp1r18Q8BQ30 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
Ppp1r18Q8BQ30 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
Ppp1r18Q8BQ30 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC42.55■■■■■ 4.4
Ppp1r18Q8BQ30 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
Ppp1r18Q8BQ30 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
Ppp1r18Q8BQ30 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
Ppp1r18Q8BQ30 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC42.41■■■■■ 4.38
Ppp1r18Q8BQ30 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.41■■■■■ 4.38
Ppp1r18Q8BQ30 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
Ppp1r18Q8BQ30 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
Ppp1r18Q8BQ30 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
Ppp1r18Q8BQ30 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
Ppp1r18Q8BQ30 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
Ppp1r18Q8BQ30 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
Ppp1r18Q8BQ30 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
Ppp1r18Q8BQ30 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC42.23■■■■■ 4.35
Ppp1r18Q8BQ30 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
Ppp1r18Q8BQ30 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
Ppp1r18Q8BQ30 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC42.2■■■■■ 4.35
Ppp1r18Q8BQ30 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
Ppp1r18Q8BQ30 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC42.19■■■■■ 4.34
Ppp1r18Q8BQ30 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.18■■■■■ 4.34
Ppp1r18Q8BQ30 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
Ppp1r18Q8BQ30 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
Ppp1r18Q8BQ30 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
Ppp1r18Q8BQ30 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
Ppp1r18Q8BQ30 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
Ppp1r18Q8BQ30 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
Ppp1r18Q8BQ30 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
Ppp1r18Q8BQ30 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
Ppp1r18Q8BQ30 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
Ppp1r18Q8BQ30 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms