Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMG1

Atrip, ATR-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtripQ8BMG1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,06■■■□□ 2,4
AtripQ8BMG1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30,06■■■□□ 2,4
AtripQ8BMG1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,03■■■□□ 2,4
AtripQ8BMG1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
AtripQ8BMG1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
AtripQ8BMG1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29,94■■■□□ 2,38
AtripQ8BMG1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
AtripQ8BMG1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29,87■■■□□ 2,37
AtripQ8BMG1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,85■■■□□ 2,37
AtripQ8BMG1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29,84■■■□□ 2,37
AtripQ8BMG1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29,84■■■□□ 2,37
AtripQ8BMG1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,82■■■□□ 2,36
AtripQ8BMG1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29,77■■■□□ 2,36
AtripQ8BMG1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,76■■■□□ 2,35
AtripQ8BMG1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29,75■■■□□ 2,35
AtripQ8BMG1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29,73■■■□□ 2,35
AtripQ8BMG1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
AtripQ8BMG1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
AtripQ8BMG1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,7■■■□□ 2,35
AtripQ8BMG1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
AtripQ8BMG1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29,62■■■□□ 2,33
AtripQ8BMG1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
AtripQ8BMG1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29,59■■■□□ 2,33
AtripQ8BMG1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
AtripQ8BMG1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
AtripQ8BMG1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
AtripQ8BMG1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
AtripQ8BMG1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29,48■■■□□ 2,31
AtripQ8BMG1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
AtripQ8BMG1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
AtripQ8BMG1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
AtripQ8BMG1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
AtripQ8BMG1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29,39■■■□□ 2,3
AtripQ8BMG1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
AtripQ8BMG1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
AtripQ8BMG1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,35■■■□□ 2,29
AtripQ8BMG1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
AtripQ8BMG1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
AtripQ8BMG1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
AtripQ8BMG1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,29■■■□□ 2,28
AtripQ8BMG1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29,28■■■□□ 2,28
AtripQ8BMG1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
AtripQ8BMG1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29,27■■■□□ 2,28
AtripQ8BMG1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
AtripQ8BMG1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
AtripQ8BMG1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
AtripQ8BMG1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
AtripQ8BMG1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29,18■■■□□ 2,26
AtripQ8BMG1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
AtripQ8BMG1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
AtripQ8BMG1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
AtripQ8BMG1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
AtripQ8BMG1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29,13■■■□□ 2,25
AtripQ8BMG1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
AtripQ8BMG1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
AtripQ8BMG1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
AtripQ8BMG1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
AtripQ8BMG1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29,05■■■□□ 2,24
AtripQ8BMG1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
AtripQ8BMG1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29,04■■■□□ 2,24
AtripQ8BMG1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
AtripQ8BMG1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2,23
AtripQ8BMG1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29■■■□□ 2,23
AtripQ8BMG1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28,99■■■□□ 2,23
AtripQ8BMG1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28,97■■■□□ 2,23
AtripQ8BMG1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28,96■■■□□ 2,23
AtripQ8BMG1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
AtripQ8BMG1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,95■■■□□ 2,22
AtripQ8BMG1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
AtripQ8BMG1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
AtripQ8BMG1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
AtripQ8BMG1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28,88■■■□□ 2,21
AtripQ8BMG1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,87■■■□□ 2,21
AtripQ8BMG1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28,86■■■□□ 2,21
AtripQ8BMG1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28,86■■■□□ 2,21
AtripQ8BMG1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
AtripQ8BMG1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
AtripQ8BMG1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28,84■■■□□ 2,21
AtripQ8BMG1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
AtripQ8BMG1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
AtripQ8BMG1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
AtripQ8BMG1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
AtripQ8BMG1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
AtripQ8BMG1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
AtripQ8BMG1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28,71■■■□□ 2,19
AtripQ8BMG1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
AtripQ8BMG1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,7■■■□□ 2,18
AtripQ8BMG1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
AtripQ8BMG1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
AtripQ8BMG1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
AtripQ8BMG1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
AtripQ8BMG1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
AtripQ8BMG1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,17
AtripQ8BMG1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
AtripQ8BMG1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
AtripQ8BMG1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28,61■■■□□ 2,17
AtripQ8BMG1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28,61■■■□□ 2,17
AtripQ8BMG1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
AtripQ8BMG1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
AtripQ8BMG1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28,57■■■□□ 2,16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,5 ms