Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJU2

Tspan9, Tetraspanin-9, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan9Q8BJU2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23,92■■□□□ 1,42
Tspan9Q8BJU2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23,9■■□□□ 1,42
Tspan9Q8BJU2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,86■■□□□ 1,41
Tspan9Q8BJU2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23,86■■□□□ 1,41
Tspan9Q8BJU2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23,85■■□□□ 1,41
Tspan9Q8BJU2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,4
Tspan9Q8BJU2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
Tspan9Q8BJU2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
Tspan9Q8BJU2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
Tspan9Q8BJU2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23,76■■□□□ 1,39
Tspan9Q8BJU2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
Tspan9Q8BJU2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23,74■■□□□ 1,39
Tspan9Q8BJU2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23,73■■□□□ 1,39
Tspan9Q8BJU2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
Tspan9Q8BJU2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
Tspan9Q8BJU2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,67■■□□□ 1,38
Tspan9Q8BJU2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,38
Tspan9Q8BJU2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Tspan9Q8BJU2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,61■■□□□ 1,37
Tspan9Q8BJU2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Tspan9Q8BJU2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,37
Tspan9Q8BJU2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Tspan9Q8BJU2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Tspan9Q8BJU2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Tspan9Q8BJU2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
Tspan9Q8BJU2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
Tspan9Q8BJU2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Tspan9Q8BJU2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Tspan9Q8BJU2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23,46■■□□□ 1,35
Tspan9Q8BJU2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23,44■■□□□ 1,34
Tspan9Q8BJU2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23,43■■□□□ 1,34
Tspan9Q8BJU2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,42■■□□□ 1,34
Tspan9Q8BJU2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23,41■■□□□ 1,34
Tspan9Q8BJU2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,34
Tspan9Q8BJU2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
Tspan9Q8BJU2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23,37■■□□□ 1,33
Tspan9Q8BJU2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Tspan9Q8BJU2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Tspan9Q8BJU2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
Tspan9Q8BJU2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
Tspan9Q8BJU2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,3■■□□□ 1,32
Tspan9Q8BJU2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Tspan9Q8BJU2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
Tspan9Q8BJU2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23,27■■□□□ 1,32
Tspan9Q8BJU2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,26■■□□□ 1,31
Tspan9Q8BJU2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23,26■■□□□ 1,31
Tspan9Q8BJU2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Tspan9Q8BJU2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Tspan9Q8BJU2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Tspan9Q8BJU2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Tspan9Q8BJU2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,22■■□□□ 1,31
Tspan9Q8BJU2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
Tspan9Q8BJU2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23,21■■□□□ 1,31
Tspan9Q8BJU2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Tspan9Q8BJU2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Tspan9Q8BJU2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23,15■■□□□ 1,3
Tspan9Q8BJU2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,3
Tspan9Q8BJU2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,29
Tspan9Q8BJU2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23,12■■□□□ 1,29
Tspan9Q8BJU2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23,12■■□□□ 1,29
Tspan9Q8BJU2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
Tspan9Q8BJU2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,11■■□□□ 1,29
Tspan9Q8BJU2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
Tspan9Q8BJU2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Tspan9Q8BJU2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Tspan9Q8BJU2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Tspan9Q8BJU2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23,06■■□□□ 1,28
Tspan9Q8BJU2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Tspan9Q8BJU2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Tspan9Q8BJU2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Tspan9Q8BJU2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23,04■■□□□ 1,28
Tspan9Q8BJU2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
Tspan9Q8BJU2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,02■■□□□ 1,28
Tspan9Q8BJU2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Tspan9Q8BJU2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Tspan9Q8BJU2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Tspan9Q8BJU2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Tspan9Q8BJU2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23■■□□□ 1,27
Tspan9Q8BJU2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22,98■■□□□ 1,27
Tspan9Q8BJU2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Tspan9Q8BJU2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,92■■□□□ 1,26
Tspan9Q8BJU2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22,92■■□□□ 1,26
Tspan9Q8BJU2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Tspan9Q8BJU2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
Tspan9Q8BJU2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
Tspan9Q8BJU2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22,88■■□□□ 1,25
Tspan9Q8BJU2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
Tspan9Q8BJU2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Tspan9Q8BJU2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22,85■■□□□ 1,25
Tspan9Q8BJU2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
Tspan9Q8BJU2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,25
Tspan9Q8BJU2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,24
Tspan9Q8BJU2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
Tspan9Q8BJU2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,8■■□□□ 1,24
Tspan9Q8BJU2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
Tspan9Q8BJU2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
Tspan9Q8BJU2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,76■■□□□ 1,23
Tspan9Q8BJU2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22,76■■□□□ 1,23
Tspan9Q8BJU2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
Tspan9Q8BJU2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22,74■■□□□ 1,23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,8 ms