Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rufy1Q8BIJ7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rufy1Q8BIJ7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rufy1Q8BIJ7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rufy1Q8BIJ7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rufy1Q8BIJ7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Rufy1Q8BIJ7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rufy1Q8BIJ7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rufy1Q8BIJ7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rufy1Q8BIJ7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rufy1Q8BIJ7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rufy1Q8BIJ7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rufy1Q8BIJ7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rufy1Q8BIJ7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rufy1Q8BIJ7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rufy1Q8BIJ7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rufy1Q8BIJ7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rufy1Q8BIJ7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rufy1Q8BIJ7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Rufy1Q8BIJ7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rufy1Q8BIJ7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rufy1Q8BIJ7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rufy1Q8BIJ7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rufy1Q8BIJ7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rufy1Q8BIJ7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rufy1Q8BIJ7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rufy1Q8BIJ7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rufy1Q8BIJ7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rufy1Q8BIJ7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rufy1Q8BIJ7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rufy1Q8BIJ7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rufy1Q8BIJ7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rufy1Q8BIJ7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rufy1Q8BIJ7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rufy1Q8BIJ7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Rufy1Q8BIJ7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rufy1Q8BIJ7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rufy1Q8BIJ7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rufy1Q8BIJ7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rufy1Q8BIJ7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Rufy1Q8BIJ7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rufy1Q8BIJ7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rufy1Q8BIJ7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rufy1Q8BIJ7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rufy1Q8BIJ7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rufy1Q8BIJ7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rufy1Q8BIJ7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rufy1Q8BIJ7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rufy1Q8BIJ7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Rufy1Q8BIJ7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rufy1Q8BIJ7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rufy1Q8BIJ7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rufy1Q8BIJ7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rufy1Q8BIJ7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rufy1Q8BIJ7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rufy1Q8BIJ7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Rufy1Q8BIJ7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rufy1Q8BIJ7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rufy1Q8BIJ7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rufy1Q8BIJ7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rufy1Q8BIJ7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rufy1Q8BIJ7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rufy1Q8BIJ7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rufy1Q8BIJ7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rufy1Q8BIJ7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rufy1Q8BIJ7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rufy1Q8BIJ7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rufy1Q8BIJ7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rufy1Q8BIJ7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rufy1Q8BIJ7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Rufy1Q8BIJ7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rufy1Q8BIJ7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rufy1Q8BIJ7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rufy1Q8BIJ7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rufy1Q8BIJ7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Rufy1Q8BIJ7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rufy1Q8BIJ7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Rufy1Q8BIJ7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rufy1Q8BIJ7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Rufy1Q8BIJ7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rufy1Q8BIJ7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rufy1Q8BIJ7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Rufy1Q8BIJ7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rufy1Q8BIJ7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rufy1Q8BIJ7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rufy1Q8BIJ7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rufy1Q8BIJ7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rufy1Q8BIJ7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Rufy1Q8BIJ7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rufy1Q8BIJ7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Rufy1Q8BIJ7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rufy1Q8BIJ7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rufy1Q8BIJ7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rufy1Q8BIJ7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rufy1Q8BIJ7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rufy1Q8BIJ7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rufy1Q8BIJ7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rufy1Q8BIJ7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rufy1Q8BIJ7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.7 ms