Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH60

Gopc, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GopcQ8BH60 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GopcQ8BH60 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GopcQ8BH60 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GopcQ8BH60 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GopcQ8BH60 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GopcQ8BH60 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GopcQ8BH60 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
GopcQ8BH60 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GopcQ8BH60 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
GopcQ8BH60 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
GopcQ8BH60 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GopcQ8BH60 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GopcQ8BH60 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
GopcQ8BH60 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GopcQ8BH60 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GopcQ8BH60 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GopcQ8BH60 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
GopcQ8BH60 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GopcQ8BH60 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GopcQ8BH60 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GopcQ8BH60 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GopcQ8BH60 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GopcQ8BH60 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GopcQ8BH60 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
GopcQ8BH60 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GopcQ8BH60 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GopcQ8BH60 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GopcQ8BH60 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
GopcQ8BH60 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GopcQ8BH60 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GopcQ8BH60 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GopcQ8BH60 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GopcQ8BH60 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GopcQ8BH60 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GopcQ8BH60 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GopcQ8BH60 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GopcQ8BH60 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
GopcQ8BH60 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GopcQ8BH60 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GopcQ8BH60 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GopcQ8BH60 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GopcQ8BH60 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GopcQ8BH60 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GopcQ8BH60 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GopcQ8BH60 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GopcQ8BH60 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GopcQ8BH60 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GopcQ8BH60 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GopcQ8BH60 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GopcQ8BH60 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GopcQ8BH60 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GopcQ8BH60 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GopcQ8BH60 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
GopcQ8BH60 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GopcQ8BH60 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GopcQ8BH60 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GopcQ8BH60 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GopcQ8BH60 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GopcQ8BH60 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
GopcQ8BH60 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GopcQ8BH60 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GopcQ8BH60 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GopcQ8BH60 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29■■■□□ 2.23
GopcQ8BH60 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GopcQ8BH60 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GopcQ8BH60 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GopcQ8BH60 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GopcQ8BH60 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GopcQ8BH60 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GopcQ8BH60 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
GopcQ8BH60 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GopcQ8BH60 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
GopcQ8BH60 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GopcQ8BH60 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GopcQ8BH60 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GopcQ8BH60 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GopcQ8BH60 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GopcQ8BH60 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GopcQ8BH60 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GopcQ8BH60 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GopcQ8BH60 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GopcQ8BH60 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GopcQ8BH60 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GopcQ8BH60 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GopcQ8BH60 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GopcQ8BH60 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GopcQ8BH60 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GopcQ8BH60 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GopcQ8BH60 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GopcQ8BH60 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GopcQ8BH60 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GopcQ8BH60 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
GopcQ8BH60 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GopcQ8BH60 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GopcQ8BH60 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GopcQ8BH60 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GopcQ8BH60 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GopcQ8BH60 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GopcQ8BH60 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GopcQ8BH60 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms