Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG26

Rusc1, RUN and SH3 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rusc1Q8BG26 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31,66■■■□□ 2,66
Rusc1Q8BG26 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31,65■■■□□ 2,66
Rusc1Q8BG26 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,63■■■□□ 2,65
Rusc1Q8BG26 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,6■■■□□ 2,65
Rusc1Q8BG26 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31,57■■■□□ 2,64
Rusc1Q8BG26 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31,55■■■□□ 2,64
Rusc1Q8BG26 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,51■■■□□ 2,63
Rusc1Q8BG26 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31,49■■■□□ 2,63
Rusc1Q8BG26 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC31,43■■■□□ 2,62
Rusc1Q8BG26 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,43■■■□□ 2,62
Rusc1Q8BG26 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,42■■■□□ 2,62
Rusc1Q8BG26 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC31,31■■■□□ 2,6
Rusc1Q8BG26 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,3■■■□□ 2,6
Rusc1Q8BG26 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31,29■■■□□ 2,6
Rusc1Q8BG26 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
Rusc1Q8BG26 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,26■■■□□ 2,59
Rusc1Q8BG26 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,25■■■□□ 2,59
Rusc1Q8BG26 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,22■■■□□ 2,59
Rusc1Q8BG26 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC31,21■■■□□ 2,59
Rusc1Q8BG26 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,18■■■□□ 2,58
Rusc1Q8BG26 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC31,18■■■□□ 2,58
Rusc1Q8BG26 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31,16■■■□□ 2,58
Rusc1Q8BG26 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,14■■■□□ 2,58
Rusc1Q8BG26 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,1■■■□□ 2,57
Rusc1Q8BG26 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,08■■■□□ 2,57
Rusc1Q8BG26 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
Rusc1Q8BG26 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,56
Rusc1Q8BG26 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Rusc1Q8BG26 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Rusc1Q8BG26 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,98■■■□□ 2,55
Rusc1Q8BG26 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Rusc1Q8BG26 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30,85■■■□□ 2,53
Rusc1Q8BG26 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30,85■■■□□ 2,53
Rusc1Q8BG26 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC30,84■■■□□ 2,53
Rusc1Q8BG26 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30,83■■■□□ 2,53
Rusc1Q8BG26 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
Rusc1Q8BG26 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30,77■■■□□ 2,52
Rusc1Q8BG26 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,77■■■□□ 2,52
Rusc1Q8BG26 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
Rusc1Q8BG26 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,74■■■□□ 2,51
Rusc1Q8BG26 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
Rusc1Q8BG26 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
Rusc1Q8BG26 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30,68■■■□□ 2,5
Rusc1Q8BG26 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Rusc1Q8BG26 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30,65■■■□□ 2,5
Rusc1Q8BG26 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
Rusc1Q8BG26 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,63■■■□□ 2,49
Rusc1Q8BG26 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC30,61■■■□□ 2,49
Rusc1Q8BG26 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
Rusc1Q8BG26 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Rusc1Q8BG26 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30,58■■■□□ 2,49
Rusc1Q8BG26 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30,55■■■□□ 2,48
Rusc1Q8BG26 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
Rusc1Q8BG26 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30,53■■■□□ 2,48
Rusc1Q8BG26 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
Rusc1Q8BG26 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30,47■■■□□ 2,47
Rusc1Q8BG26 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
Rusc1Q8BG26 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
Rusc1Q8BG26 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Rusc1Q8BG26 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Rusc1Q8BG26 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
Rusc1Q8BG26 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
Rusc1Q8BG26 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30,33■■■□□ 2,45
Rusc1Q8BG26 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Rusc1Q8BG26 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Rusc1Q8BG26 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC30,29■■■□□ 2,44
Rusc1Q8BG26 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,43
Rusc1Q8BG26 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,43
Rusc1Q8BG26 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Rusc1Q8BG26 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Rusc1Q8BG26 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Rusc1Q8BG26 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Rusc1Q8BG26 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,21■■■□□ 2,43
Rusc1Q8BG26 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Rusc1Q8BG26 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Rusc1Q8BG26 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,06■■■□□ 2,4
Rusc1Q8BG26 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,04■■■□□ 2,4
Rusc1Q8BG26 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Rusc1Q8BG26 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC30,02■■■□□ 2,4
Rusc1Q8BG26 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Rusc1Q8BG26 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Rusc1Q8BG26 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30■■■□□ 2,39
Rusc1Q8BG26 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,94■■■□□ 2,38
Rusc1Q8BG26 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Rusc1Q8BG26 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Rusc1Q8BG26 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Rusc1Q8BG26 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Rusc1Q8BG26 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29,91■■■□□ 2,38
Rusc1Q8BG26 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Rusc1Q8BG26 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29,89■■■□□ 2,38
Rusc1Q8BG26 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,87■■■□□ 2,37
Rusc1Q8BG26 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Rusc1Q8BG26 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Rusc1Q8BG26 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Rusc1Q8BG26 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Rusc1Q8BG26 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Rusc1Q8BG26 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Rusc1Q8BG26 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Rusc1Q8BG26 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Rusc1Q8BG26 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29,82■■■□□ 2,37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,7 ms