Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Cracr2bQ80ZJ8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Cracr2bQ80ZJ8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Cracr2bQ80ZJ8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Cracr2bQ80ZJ8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
Cracr2bQ80ZJ8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Cracr2bQ80ZJ8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Cracr2bQ80ZJ8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
Cracr2bQ80ZJ8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Cracr2bQ80ZJ8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Cracr2bQ80ZJ8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Cracr2bQ80ZJ8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Cracr2bQ80ZJ8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Cracr2bQ80ZJ8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Cracr2bQ80ZJ8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
Cracr2bQ80ZJ8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Cracr2bQ80ZJ8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Cracr2bQ80ZJ8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Cracr2bQ80ZJ8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
Cracr2bQ80ZJ8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Cracr2bQ80ZJ8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Cracr2bQ80ZJ8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Cracr2bQ80ZJ8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Cracr2bQ80ZJ8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Cracr2bQ80ZJ8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.26■■■□□ 2.6
Cracr2bQ80ZJ8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Cracr2bQ80ZJ8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Cracr2bQ80ZJ8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Cracr2bQ80ZJ8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Cracr2bQ80ZJ8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Cracr2bQ80ZJ8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Cracr2bQ80ZJ8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Cracr2bQ80ZJ8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Cracr2bQ80ZJ8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Cracr2bQ80ZJ8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Cracr2bQ80ZJ8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Cracr2bQ80ZJ8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Cracr2bQ80ZJ8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Cracr2bQ80ZJ8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Cracr2bQ80ZJ8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Cracr2bQ80ZJ8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Cracr2bQ80ZJ8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Cracr2bQ80ZJ8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Cracr2bQ80ZJ8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
Cracr2bQ80ZJ8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Cracr2bQ80ZJ8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Cracr2bQ80ZJ8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Cracr2bQ80ZJ8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Cracr2bQ80ZJ8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Cracr2bQ80ZJ8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Cracr2bQ80ZJ8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Cracr2bQ80ZJ8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Cracr2bQ80ZJ8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Cracr2bQ80ZJ8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Cracr2bQ80ZJ8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Cracr2bQ80ZJ8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Cracr2bQ80ZJ8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Cracr2bQ80ZJ8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Cracr2bQ80ZJ8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Cracr2bQ80ZJ8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Cracr2bQ80ZJ8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Cracr2bQ80ZJ8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Cracr2bQ80ZJ8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Cracr2bQ80ZJ8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Cracr2bQ80ZJ8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Cracr2bQ80ZJ8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Cracr2bQ80ZJ8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Cracr2bQ80ZJ8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Cracr2bQ80ZJ8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Cracr2bQ80ZJ8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Cracr2bQ80ZJ8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Cracr2bQ80ZJ8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Cracr2bQ80ZJ8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Cracr2bQ80ZJ8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Cracr2bQ80ZJ8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Cracr2bQ80ZJ8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Cracr2bQ80ZJ8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cracr2bQ80ZJ8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Cracr2bQ80ZJ8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Cracr2bQ80ZJ8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Cracr2bQ80ZJ8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Cracr2bQ80ZJ8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Cracr2bQ80ZJ8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Cracr2bQ80ZJ8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Cracr2bQ80ZJ8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Cracr2bQ80ZJ8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Cracr2bQ80ZJ8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Cracr2bQ80ZJ8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cracr2bQ80ZJ8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Cracr2bQ80ZJ8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Cracr2bQ80ZJ8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cracr2bQ80ZJ8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Cracr2bQ80ZJ8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Cracr2bQ80ZJ8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Cracr2bQ80ZJ8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Cracr2bQ80ZJ8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cracr2bQ80ZJ8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms