Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z71

Tnn, Tenascin-N, mousemouse

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnnQ80Z71 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47,85■■■■■ 5,25
TnnQ80Z71 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,83■■■■■ 5,25
TnnQ80Z71 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47,82■■■■■ 5,25
TnnQ80Z71 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC47,79■■■■■ 5,24
TnnQ80Z71 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,74■■■■■ 5,23
TnnQ80Z71 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,68■■■■■ 5,22
TnnQ80Z71 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC47,64■■■■■ 5,22
TnnQ80Z71 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,61■■■■■ 5,21
TnnQ80Z71 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,6■■■■■ 5,21
TnnQ80Z71 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,6■■■■■ 5,21
TnnQ80Z71 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,58■■■■■ 5,21
TnnQ80Z71 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,57■■■■■ 5,21
TnnQ80Z71 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,55■■■■■ 5,2
TnnQ80Z71 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,49■■■■■ 5,19
TnnQ80Z71 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC47,46■■■■■ 5,19
TnnQ80Z71 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC47,29■■■■■ 5,16
TnnQ80Z71 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,23■■■■■ 5,15
TnnQ80Z71 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC47,15■■■■■ 5,14
TnnQ80Z71 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC47,14■■■■■ 5,14
TnnQ80Z71 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47,14■■■■■ 5,14
TnnQ80Z71 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,13■■■■■ 5,14
TnnQ80Z71 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC47,08■■■■■ 5,13
TnnQ80Z71 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,06■■■■■ 5,12
TnnQ80Z71 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC47,03■■■■■ 5,12
TnnQ80Z71 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC47,03■■■■■ 5,12
TnnQ80Z71 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,96■■■■■ 5,11
TnnQ80Z71 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46,94■■■■■ 5,11
TnnQ80Z71 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC46,94■■■■■ 5,1
TnnQ80Z71 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,93■■■■■ 5,1
TnnQ80Z71 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46,9■■■■■ 5,1
TnnQ80Z71 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,88■■■■■ 5,09
TnnQ80Z71 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC46,84■■■■■ 5,09
TnnQ80Z71 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,83■■■■■ 5,09
TnnQ80Z71 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC46,82■■■■■ 5,09
TnnQ80Z71 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,81■■■■■ 5,08
TnnQ80Z71 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,79■■■■■ 5,08
TnnQ80Z71 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC46,78■■■■■ 5,08
TnnQ80Z71 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC46,74■■■■■ 5,07
TnnQ80Z71 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46,72■■■■■ 5,07
TnnQ80Z71 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC46,72■■■■■ 5,07
TnnQ80Z71 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC46,71■■■■■ 5,07
TnnQ80Z71 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC46,63■■■■■ 5,06
TnnQ80Z71 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC46,61■■■■■ 5,05
TnnQ80Z71 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC46,61■■■■■ 5,05
TnnQ80Z71 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC46,59■■■■■ 5,05
TnnQ80Z71 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC46,52■■■■■ 5,04
TnnQ80Z71 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46,47■■■■■ 5,03
TnnQ80Z71 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46,46■■■■■ 5,03
TnnQ80Z71 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC46,44■■■■■ 5,03
TnnQ80Z71 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,43■■■■■ 5,02
TnnQ80Z71 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC46,31■■■■■ 5
TnnQ80Z71 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC46,29■■■■■ 5
TnnQ80Z71 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC46,29■■■■■ 5
TnnQ80Z71 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,26■■■■■ 5
TnnQ80Z71 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC46,24■■■■■ 4,99
TnnQ80Z71 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46,22■■■■■ 4,99
TnnQ80Z71 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46,21■■■■■ 4,99
TnnQ80Z71 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC46,17■■■■■ 4,98
TnnQ80Z71 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC46,14■■■■■ 4,98
TnnQ80Z71 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,11■■■■■ 4,97
TnnQ80Z71 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46,04■■■■■ 4,96
TnnQ80Z71 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46,02■■■■■ 4,96
TnnQ80Z71 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,02■■■■■ 4,96
TnnQ80Z71 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,98■■■■■ 4,95
TnnQ80Z71 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC45,98■■■■■ 4,95
TnnQ80Z71 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC45,96■■■■■ 4,95
TnnQ80Z71 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,95■■■■■ 4,95
TnnQ80Z71 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,86■■■■■ 4,93
TnnQ80Z71 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC45,84■■■■■ 4,93
TnnQ80Z71 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,84■■■■■ 4,93
TnnQ80Z71 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,84■■■■■ 4,93
TnnQ80Z71 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,81■■■■■ 4,92
TnnQ80Z71 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45,78■■■■■ 4,92
TnnQ80Z71 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45,74■■■■■ 4,91
TnnQ80Z71 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC45,74■■■■■ 4,91
TnnQ80Z71 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45,73■■■■■ 4,91
TnnQ80Z71 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,7■■■■■ 4,91
TnnQ80Z71 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,69■■■■■ 4,9
TnnQ80Z71 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC45,67■■■■■ 4,9
TnnQ80Z71 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC45,64■■■■■ 4,9
TnnQ80Z71 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC45,64■■■■■ 4,9
TnnQ80Z71 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC45,62■■■■■ 4,89
TnnQ80Z71 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC45,61■■■■■ 4,89
TnnQ80Z71 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC45,61■■■■■ 4,89
TnnQ80Z71 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC45,6■■■■■ 4,89
TnnQ80Z71 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC45,54■■■■■ 4,88
TnnQ80Z71 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC45,54■■■■■ 4,88
TnnQ80Z71 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC45,52■■■■■ 4,88
TnnQ80Z71 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,44■■■■■ 4,87
TnnQ80Z71 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,43■■■■■ 4,86
TnnQ80Z71 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC45,42■■■■■ 4,86
TnnQ80Z71 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC45,4■■■■■ 4,86
TnnQ80Z71 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC45,37■■■■■ 4,85
TnnQ80Z71 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,37■■■■■ 4,85
TnnQ80Z71 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC45,36■■■■■ 4,85
TnnQ80Z71 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC45,34■■■■■ 4,85
TnnQ80Z71 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC45,34■■■■■ 4,85
TnnQ80Z71 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45,26■■■■■ 4,84
TnnQ80Z71 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC45,26■■■■■ 4,84
TnnQ80Z71 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45,25■■■■■ 4,83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9,5 ms