Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z37

Topors, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, mousemouse

Predictions only

Length 1,033 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ToporsQ80Z37 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ToporsQ80Z37 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
ToporsQ80Z37 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
ToporsQ80Z37 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ToporsQ80Z37 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ToporsQ80Z37 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ToporsQ80Z37 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ToporsQ80Z37 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ToporsQ80Z37 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ToporsQ80Z37 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ToporsQ80Z37 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
ToporsQ80Z37 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ToporsQ80Z37 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ToporsQ80Z37 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ToporsQ80Z37 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ToporsQ80Z37 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ToporsQ80Z37 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ToporsQ80Z37 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ToporsQ80Z37 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ToporsQ80Z37 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ToporsQ80Z37 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ToporsQ80Z37 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
ToporsQ80Z37 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ToporsQ80Z37 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ToporsQ80Z37 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ToporsQ80Z37 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ToporsQ80Z37 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ToporsQ80Z37 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ToporsQ80Z37 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ToporsQ80Z37 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ToporsQ80Z37 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ToporsQ80Z37 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ToporsQ80Z37 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ToporsQ80Z37 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ToporsQ80Z37 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ToporsQ80Z37 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ToporsQ80Z37 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ToporsQ80Z37 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ToporsQ80Z37 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ToporsQ80Z37 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ToporsQ80Z37 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ToporsQ80Z37 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ToporsQ80Z37 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ToporsQ80Z37 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ToporsQ80Z37 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ToporsQ80Z37 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ToporsQ80Z37 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ToporsQ80Z37 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ToporsQ80Z37 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ToporsQ80Z37 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ToporsQ80Z37 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ToporsQ80Z37 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ToporsQ80Z37 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ToporsQ80Z37 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ToporsQ80Z37 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ToporsQ80Z37 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ToporsQ80Z37 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ToporsQ80Z37 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ToporsQ80Z37 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ToporsQ80Z37 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ToporsQ80Z37 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ToporsQ80Z37 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ToporsQ80Z37 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ToporsQ80Z37 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ToporsQ80Z37 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ToporsQ80Z37 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ToporsQ80Z37 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ToporsQ80Z37 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ToporsQ80Z37 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ToporsQ80Z37 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ToporsQ80Z37 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ToporsQ80Z37 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ToporsQ80Z37 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ToporsQ80Z37 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ToporsQ80Z37 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ToporsQ80Z37 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ToporsQ80Z37 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ToporsQ80Z37 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ToporsQ80Z37 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ToporsQ80Z37 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ToporsQ80Z37 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ToporsQ80Z37 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ToporsQ80Z37 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ToporsQ80Z37 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ToporsQ80Z37 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ToporsQ80Z37 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ToporsQ80Z37 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ToporsQ80Z37 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ToporsQ80Z37 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ToporsQ80Z37 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ToporsQ80Z37 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ToporsQ80Z37 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ToporsQ80Z37 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ToporsQ80Z37 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ToporsQ80Z37 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ToporsQ80Z37 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ToporsQ80Z37 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ToporsQ80Z37 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ToporsQ80Z37 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ToporsQ80Z37 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms