Protein–RNA interactions for Protein: Q80XI4

Pip4k2b, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pip4k2bQ80XI4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC40,95■■■■■ 4,15
Pip4k2bQ80XI4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40,94■■■■■ 4,14
Pip4k2bQ80XI4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,84■■■■■ 4,13
Pip4k2bQ80XI4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC40,84■■■■■ 4,13
Pip4k2bQ80XI4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC40,82■■■■■ 4,13
Pip4k2bQ80XI4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,7■■■■■ 4,11
Pip4k2bQ80XI4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC40,64■■■■■ 4,1
Pip4k2bQ80XI4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC40,62■■■■■ 4,09
Pip4k2bQ80XI4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC40,55■■■■■ 4,08
Pip4k2bQ80XI4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40,51■■■■■ 4,08
Pip4k2bQ80XI4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC40,47■■■■■ 4,07
Pip4k2bQ80XI4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,44■■■■■ 4,06
Pip4k2bQ80XI4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC40,43■■■■■ 4,06
Pip4k2bQ80XI4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,41■■■■■ 4,06
Pip4k2bQ80XI4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,4■■■■■ 4,06
Pip4k2bQ80XI4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC40,4■■■■■ 4,06
Pip4k2bQ80XI4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC40,35■■■■■ 4,05
Pip4k2bQ80XI4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC40,29■■■■■ 4,04
Pip4k2bQ80XI4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC40,29■■■■■ 4,04
Pip4k2bQ80XI4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC40,26■■■■■ 4,04
Pip4k2bQ80XI4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC40,26■■■■■ 4,04
Pip4k2bQ80XI4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC40,25■■■■■ 4,03
Pip4k2bQ80XI4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,17■■■■■ 4,02
Pip4k2bQ80XI4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,14■■■■■ 4,02
Pip4k2bQ80XI4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC40,12■■■■■ 4,01
Pip4k2bQ80XI4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40,08■■■■■ 4,01
Pip4k2bQ80XI4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC40,07■■■■■ 4,01
Pip4k2bQ80XI4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,03■■■■■ 4
Pip4k2bQ80XI4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC39,98■■■■□ 3,99
Pip4k2bQ80XI4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC39,97■■■■□ 3,99
Pip4k2bQ80XI4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC39,95■■■■□ 3,99
Pip4k2bQ80XI4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,93■■■■□ 3,98
Pip4k2bQ80XI4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC39,91■■■■□ 3,98
Pip4k2bQ80XI4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,89■■■■□ 3,98
Pip4k2bQ80XI4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC39,89■■■■□ 3,98
Pip4k2bQ80XI4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC39,86■■■■□ 3,97
Pip4k2bQ80XI4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC39,81■■■■□ 3,96
Pip4k2bQ80XI4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC39,77■■■■□ 3,96
Pip4k2bQ80XI4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC39,77■■■■□ 3,96
Pip4k2bQ80XI4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC39,76■■■■□ 3,96
Pip4k2bQ80XI4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39,76■■■■□ 3,96
Pip4k2bQ80XI4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,73■■■■□ 3,95
Pip4k2bQ80XI4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,64■■■■□ 3,94
Pip4k2bQ80XI4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC39,62■■■■□ 3,93
Pip4k2bQ80XI4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,61■■■■□ 3,93
Pip4k2bQ80XI4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39,59■■■■□ 3,93
Pip4k2bQ80XI4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,59■■■■□ 3,93
Pip4k2bQ80XI4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC39,58■■■■□ 3,93
Pip4k2bQ80XI4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC39,55■■■■□ 3,92
Pip4k2bQ80XI4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC39,54■■■■□ 3,92
Pip4k2bQ80XI4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39,54■■■■□ 3,92
Pip4k2bQ80XI4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,52■■■■□ 3,92
Pip4k2bQ80XI4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC39,5■■■■□ 3,91
Pip4k2bQ80XI4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC39,49■■■■□ 3,91
Pip4k2bQ80XI4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC39,48■■■■□ 3,91
Pip4k2bQ80XI4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC39,46■■■■□ 3,91
Pip4k2bQ80XI4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC39,46■■■■□ 3,91
Pip4k2bQ80XI4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39,46■■■■□ 3,91
Pip4k2bQ80XI4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,46■■■■□ 3,91
Pip4k2bQ80XI4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,44■■■■□ 3,9
Pip4k2bQ80XI4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,43■■■■□ 3,9
Pip4k2bQ80XI4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC39,42■■■■□ 3,9
Pip4k2bQ80XI4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,4■■■■□ 3,9
Pip4k2bQ80XI4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC39,37■■■■□ 3,89
Pip4k2bQ80XI4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,36■■■■□ 3,89
Pip4k2bQ80XI4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,32■■■■□ 3,89
Pip4k2bQ80XI4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC39,3■■■■□ 3,88
Pip4k2bQ80XI4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC39,29■■■■□ 3,88
Pip4k2bQ80XI4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,26■■■■□ 3,88
Pip4k2bQ80XI4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,23■■■■□ 3,87
Pip4k2bQ80XI4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39,2■■■■□ 3,87
Pip4k2bQ80XI4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,2■■■■□ 3,87
Pip4k2bQ80XI4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC39,19■■■■□ 3,86
Pip4k2bQ80XI4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC39,19■■■■□ 3,86
Pip4k2bQ80XI4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC39,18■■■■□ 3,86
Pip4k2bQ80XI4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,16■■■■□ 3,86
Pip4k2bQ80XI4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,14■■■■□ 3,86
Pip4k2bQ80XI4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC39,11■■■■□ 3,85
Pip4k2bQ80XI4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,03■■■■□ 3,84
Pip4k2bQ80XI4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,01■■■■□ 3,84
Pip4k2bQ80XI4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC39,01■■■■□ 3,84
Pip4k2bQ80XI4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC38,98■■■■□ 3,83
Pip4k2bQ80XI4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC38,96■■■■□ 3,83
Pip4k2bQ80XI4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC38,96■■■■□ 3,83
Pip4k2bQ80XI4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,95■■■■□ 3,83
Pip4k2bQ80XI4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,94■■■■□ 3,82
Pip4k2bQ80XI4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,93■■■■□ 3,82
Pip4k2bQ80XI4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,92■■■■□ 3,82
Pip4k2bQ80XI4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,91■■■■□ 3,82
Pip4k2bQ80XI4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,89■■■■□ 3,82
Pip4k2bQ80XI4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,89■■■■□ 3,82
Pip4k2bQ80XI4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,86■■■■□ 3,81
Pip4k2bQ80XI4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC38,86■■■■□ 3,81
Pip4k2bQ80XI4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC38,86■■■■□ 3,81
Pip4k2bQ80XI4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,84■■■■□ 3,81
Pip4k2bQ80XI4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC38,81■■■■□ 3,8
Pip4k2bQ80XI4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38,81■■■■□ 3,8
Pip4k2bQ80XI4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38,8■■■■□ 3,8
Pip4k2bQ80XI4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC38,8■■■■□ 3,8
Pip4k2bQ80XI4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC38,78■■■■□ 3,8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,5 ms