Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Lrrc1Q80VQ1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lrrc1Q80VQ1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lrrc1Q80VQ1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lrrc1Q80VQ1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lrrc1Q80VQ1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Lrrc1Q80VQ1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Lrrc1Q80VQ1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Lrrc1Q80VQ1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Lrrc1Q80VQ1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lrrc1Q80VQ1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lrrc1Q80VQ1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lrrc1Q80VQ1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lrrc1Q80VQ1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lrrc1Q80VQ1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lrrc1Q80VQ1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lrrc1Q80VQ1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lrrc1Q80VQ1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lrrc1Q80VQ1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lrrc1Q80VQ1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lrrc1Q80VQ1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lrrc1Q80VQ1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Lrrc1Q80VQ1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lrrc1Q80VQ1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lrrc1Q80VQ1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lrrc1Q80VQ1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lrrc1Q80VQ1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Lrrc1Q80VQ1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lrrc1Q80VQ1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Lrrc1Q80VQ1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lrrc1Q80VQ1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lrrc1Q80VQ1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lrrc1Q80VQ1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Lrrc1Q80VQ1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lrrc1Q80VQ1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lrrc1Q80VQ1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lrrc1Q80VQ1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lrrc1Q80VQ1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lrrc1Q80VQ1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lrrc1Q80VQ1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lrrc1Q80VQ1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Lrrc1Q80VQ1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lrrc1Q80VQ1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lrrc1Q80VQ1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lrrc1Q80VQ1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lrrc1Q80VQ1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lrrc1Q80VQ1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lrrc1Q80VQ1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lrrc1Q80VQ1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lrrc1Q80VQ1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Lrrc1Q80VQ1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lrrc1Q80VQ1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lrrc1Q80VQ1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lrrc1Q80VQ1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Lrrc1Q80VQ1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lrrc1Q80VQ1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lrrc1Q80VQ1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lrrc1Q80VQ1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Lrrc1Q80VQ1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lrrc1Q80VQ1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lrrc1Q80VQ1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lrrc1Q80VQ1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lrrc1Q80VQ1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lrrc1Q80VQ1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Lrrc1Q80VQ1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lrrc1Q80VQ1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lrrc1Q80VQ1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lrrc1Q80VQ1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Lrrc1Q80VQ1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lrrc1Q80VQ1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Lrrc1Q80VQ1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lrrc1Q80VQ1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lrrc1Q80VQ1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lrrc1Q80VQ1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lrrc1Q80VQ1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lrrc1Q80VQ1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lrrc1Q80VQ1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lrrc1Q80VQ1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lrrc1Q80VQ1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lrrc1Q80VQ1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lrrc1Q80VQ1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lrrc1Q80VQ1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lrrc1Q80VQ1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lrrc1Q80VQ1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lrrc1Q80VQ1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lrrc1Q80VQ1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lrrc1Q80VQ1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Lrrc1Q80VQ1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lrrc1Q80VQ1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lrrc1Q80VQ1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lrrc1Q80VQ1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lrrc1Q80VQ1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lrrc1Q80VQ1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lrrc1Q80VQ1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lrrc1Q80VQ1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lrrc1Q80VQ1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lrrc1Q80VQ1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lrrc1Q80VQ1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lrrc1Q80VQ1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lrrc1Q80VQ1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
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