Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28,83■■■□□ 2,21
Lrrc1Q80VQ1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Lrrc1Q80VQ1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Lrrc1Q80VQ1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,71■■■□□ 2,19
Lrrc1Q80VQ1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28,71■■■□□ 2,19
Lrrc1Q80VQ1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,19
Lrrc1Q80VQ1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Lrrc1Q80VQ1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Lrrc1Q80VQ1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28,53■■■□□ 2,16
Lrrc1Q80VQ1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Lrrc1Q80VQ1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Lrrc1Q80VQ1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Lrrc1Q80VQ1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Lrrc1Q80VQ1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,41■■■□□ 2,14
Lrrc1Q80VQ1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Lrrc1Q80VQ1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Lrrc1Q80VQ1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Lrrc1Q80VQ1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Lrrc1Q80VQ1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Lrrc1Q80VQ1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28,3■■■□□ 2,12
Lrrc1Q80VQ1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Lrrc1Q80VQ1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28,28■■■□□ 2,12
Lrrc1Q80VQ1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28,25■■■□□ 2,11
Lrrc1Q80VQ1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Lrrc1Q80VQ1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Lrrc1Q80VQ1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Lrrc1Q80VQ1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28,17■■■□□ 2,1
Lrrc1Q80VQ1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Lrrc1Q80VQ1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28,13■■■□□ 2,09
Lrrc1Q80VQ1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Lrrc1Q80VQ1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Lrrc1Q80VQ1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Lrrc1Q80VQ1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,08
Lrrc1Q80VQ1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,06■■■□□ 2,08
Lrrc1Q80VQ1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Lrrc1Q80VQ1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28,06■■■□□ 2,08
Lrrc1Q80VQ1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28,02■■■□□ 2,08
Lrrc1Q80VQ1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Lrrc1Q80VQ1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Lrrc1Q80VQ1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Lrrc1Q80VQ1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27,95■■■□□ 2,07
Lrrc1Q80VQ1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Lrrc1Q80VQ1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Lrrc1Q80VQ1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Lrrc1Q80VQ1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Lrrc1Q80VQ1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Lrrc1Q80VQ1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Lrrc1Q80VQ1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Lrrc1Q80VQ1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Lrrc1Q80VQ1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27,86■■■□□ 2,05
Lrrc1Q80VQ1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Lrrc1Q80VQ1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Lrrc1Q80VQ1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Lrrc1Q80VQ1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27,77■■■□□ 2,04
Lrrc1Q80VQ1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Lrrc1Q80VQ1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Lrrc1Q80VQ1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Lrrc1Q80VQ1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27,72■■■□□ 2,03
Lrrc1Q80VQ1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Lrrc1Q80VQ1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Lrrc1Q80VQ1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Lrrc1Q80VQ1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Lrrc1Q80VQ1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Lrrc1Q80VQ1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,03
Lrrc1Q80VQ1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Lrrc1Q80VQ1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Lrrc1Q80VQ1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Lrrc1Q80VQ1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27,65■■■□□ 2,02
Lrrc1Q80VQ1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Lrrc1Q80VQ1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27,62■■■□□ 2,01
Lrrc1Q80VQ1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Lrrc1Q80VQ1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Lrrc1Q80VQ1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Lrrc1Q80VQ1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Lrrc1Q80VQ1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Lrrc1Q80VQ1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Lrrc1Q80VQ1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Lrrc1Q80VQ1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Lrrc1Q80VQ1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Lrrc1Q80VQ1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Lrrc1Q80VQ1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Lrrc1Q80VQ1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Lrrc1Q80VQ1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Lrrc1Q80VQ1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Lrrc1Q80VQ1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Lrrc1Q80VQ1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Lrrc1Q80VQ1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,99
Lrrc1Q80VQ1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27,44■■□□□ 1,98
Lrrc1Q80VQ1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,42■■□□□ 1,98
Lrrc1Q80VQ1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Lrrc1Q80VQ1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Lrrc1Q80VQ1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Lrrc1Q80VQ1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Lrrc1Q80VQ1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,4■■□□□ 1,98
Lrrc1Q80VQ1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Lrrc1Q80VQ1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27,38■■□□□ 1,97
Lrrc1Q80VQ1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,37■■□□□ 1,97
Lrrc1Q80VQ1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Lrrc1Q80VQ1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27,34■■□□□ 1,97
Lrrc1Q80VQ1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26,1 ms