Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ttc29Q80VM3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ttc29Q80VM3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ttc29Q80VM3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ttc29Q80VM3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ttc29Q80VM3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ttc29Q80VM3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ttc29Q80VM3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ttc29Q80VM3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Ttc29Q80VM3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ttc29Q80VM3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ttc29Q80VM3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ttc29Q80VM3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ttc29Q80VM3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ttc29Q80VM3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ttc29Q80VM3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ttc29Q80VM3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ttc29Q80VM3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ttc29Q80VM3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Ttc29Q80VM3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ttc29Q80VM3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ttc29Q80VM3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ttc29Q80VM3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ttc29Q80VM3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ttc29Q80VM3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ttc29Q80VM3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ttc29Q80VM3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ttc29Q80VM3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Ttc29Q80VM3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ttc29Q80VM3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ttc29Q80VM3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ttc29Q80VM3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ttc29Q80VM3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ttc29Q80VM3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ttc29Q80VM3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ttc29Q80VM3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ttc29Q80VM3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ttc29Q80VM3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Ttc29Q80VM3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ttc29Q80VM3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ttc29Q80VM3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ttc29Q80VM3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ttc29Q80VM3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ttc29Q80VM3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ttc29Q80VM3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ttc29Q80VM3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ttc29Q80VM3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Ttc29Q80VM3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ttc29Q80VM3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ttc29Q80VM3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ttc29Q80VM3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ttc29Q80VM3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ttc29Q80VM3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ttc29Q80VM3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ttc29Q80VM3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ttc29Q80VM3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ttc29Q80VM3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ttc29Q80VM3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ttc29Q80VM3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ttc29Q80VM3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttc29Q80VM3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttc29Q80VM3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttc29Q80VM3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ttc29Q80VM3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ttc29Q80VM3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ttc29Q80VM3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ttc29Q80VM3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ttc29Q80VM3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ttc29Q80VM3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ttc29Q80VM3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttc29Q80VM3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc29Q80VM3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ttc29Q80VM3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ttc29Q80VM3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ttc29Q80VM3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ttc29Q80VM3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ttc29Q80VM3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ttc29Q80VM3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ttc29Q80VM3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttc29Q80VM3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ttc29Q80VM3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ttc29Q80VM3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ttc29Q80VM3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttc29Q80VM3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttc29Q80VM3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttc29Q80VM3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttc29Q80VM3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ttc29Q80VM3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttc29Q80VM3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttc29Q80VM3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttc29Q80VM3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc29Q80VM3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttc29Q80VM3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc29Q80VM3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc29Q80VM3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttc29Q80VM3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttc29Q80VM3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ttc29Q80VM3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc29Q80VM3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttc29Q80VM3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms