Protein–RNA interactions for Protein: Q80UB0

Testin-2, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q80UB0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Q80UB0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Q80UB0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Q80UB0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Q80UB0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Q80UB0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Q80UB0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Q80UB0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Q80UB0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Q80UB0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Q80UB0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Q80UB0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Q80UB0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Q80UB0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Q80UB0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Q80UB0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Q80UB0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Q80UB0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Q80UB0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Q80UB0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Q80UB0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Q80UB0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Q80UB0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Q80UB0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Q80UB0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q80UB0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Q80UB0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q80UB0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q80UB0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q80UB0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q80UB0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q80UB0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q80UB0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q80UB0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q80UB0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q80UB0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q80UB0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q80UB0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q80UB0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Q80UB0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q80UB0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q80UB0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Q80UB0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q80UB0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q80UB0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q80UB0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q80UB0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Q80UB0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Q80UB0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q80UB0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q80UB0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Q80UB0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Q80UB0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q80UB0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q80UB0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q80UB0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q80UB0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q80UB0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q80UB0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q80UB0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q80UB0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q80UB0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q80UB0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q80UB0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q80UB0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Q80UB0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Q80UB0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q80UB0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Q80UB0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q80UB0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Q80UB0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Q80UB0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Q80UB0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Q80UB0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Q80UB0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Q80UB0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Q80UB0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q80UB0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q80UB0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q80UB0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q80UB0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q80UB0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q80UB0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q80UB0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q80UB0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q80UB0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q80UB0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Q80UB0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Q80UB0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q80UB0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q80UB0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q80UB0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q80UB0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q80UB0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q80UB0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q80UB0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q80UB0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Q80UB0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q80UB0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Q80UB0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms