Protein–RNA interactions for Protein: Q80U93

Nup214, Nuclear pore complex protein Nup214, mousemouse

Predictions only

Length 2,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup214Q80U93 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nup214Q80U93 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nup214Q80U93 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nup214Q80U93 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nup214Q80U93 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Nup214Q80U93 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nup214Q80U93 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nup214Q80U93 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup214Q80U93 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nup214Q80U93 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Nup214Q80U93 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nup214Q80U93 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nup214Q80U93 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nup214Q80U93 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nup214Q80U93 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup214Q80U93 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup214Q80U93 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nup214Q80U93 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nup214Q80U93 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup214Q80U93 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup214Q80U93 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup214Q80U93 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup214Q80U93 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nup214Q80U93 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nup214Q80U93 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nup214Q80U93 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup214Q80U93 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup214Q80U93 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Nup214Q80U93 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Nup214Q80U93 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nup214Q80U93 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nup214Q80U93 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nup214Q80U93 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nup214Q80U93 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Nup214Q80U93 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nup214Q80U93 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Nup214Q80U93 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nup214Q80U93 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nup214Q80U93 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nup214Q80U93 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nup214Q80U93 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nup214Q80U93 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nup214Q80U93 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nup214Q80U93 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nup214Q80U93 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nup214Q80U93 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nup214Q80U93 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nup214Q80U93 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nup214Q80U93 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nup214Q80U93 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nup214Q80U93 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nup214Q80U93 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nup214Q80U93 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nup214Q80U93 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nup214Q80U93 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nup214Q80U93 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nup214Q80U93 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nup214Q80U93 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nup214Q80U93 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nup214Q80U93 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nup214Q80U93 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nup214Q80U93 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nup214Q80U93 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nup214Q80U93 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nup214Q80U93 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nup214Q80U93 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nup214Q80U93 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nup214Q80U93 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nup214Q80U93 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nup214Q80U93 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Nup214Q80U93 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nup214Q80U93 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Nup214Q80U93 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nup214Q80U93 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nup214Q80U93 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Nup214Q80U93 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nup214Q80U93 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nup214Q80U93 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nup214Q80U93 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nup214Q80U93 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nup214Q80U93 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nup214Q80U93 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nup214Q80U93 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nup214Q80U93 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nup214Q80U93 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nup214Q80U93 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nup214Q80U93 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Nup214Q80U93 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nup214Q80U93 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nup214Q80U93 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nup214Q80U93 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup214Q80U93 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nup214Q80U93 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nup214Q80U93 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nup214Q80U93 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nup214Q80U93 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nup214Q80U93 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup214Q80U93 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup214Q80U93 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup214Q80U93 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms