Protein–RNA interactions for Protein: Q80U22

Rusc2, Iporin, mousemouse

Predictions only

Length 1,514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rusc2Q80U22 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC46.77■■■■■ 5.08
Rusc2Q80U22 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC46.71■■■■■ 5.07
Rusc2Q80U22 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.66■■■■■ 5.06
Rusc2Q80U22 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC46.6■■■■■ 5.05
Rusc2Q80U22 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.05
Rusc2Q80U22 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.5■■■■■ 5.03
Rusc2Q80U22 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC46.47■■■■■ 5.03
Rusc2Q80U22 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.43■■■■■ 5.02
Rusc2Q80U22 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC46.4■■■■■ 5.02
Rusc2Q80U22 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC46.34■■■■■ 5.01
Rusc2Q80U22 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC46.29■■■■■ 5
Rusc2Q80U22 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.2■■■■■ 4.99
Rusc2Q80U22 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.17■■■■■ 4.98
Rusc2Q80U22 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.08■■■■■ 4.97
Rusc2Q80U22 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.08■■■■■ 4.97
Rusc2Q80U22 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC46.06■■■■■ 4.96
Rusc2Q80U22 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
Rusc2Q80U22 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC46.04■■■■■ 4.96
Rusc2Q80U22 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC46.04■■■■■ 4.96
Rusc2Q80U22 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.01■■■■■ 4.96
Rusc2Q80U22 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC46.01■■■■■ 4.96
Rusc2Q80U22 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC46■■■■■ 4.95
Rusc2Q80U22 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC45.89■■■■■ 4.94
Rusc2Q80U22 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC45.85■■■■■ 4.93
Rusc2Q80U22 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC45.84■■■■■ 4.93
Rusc2Q80U22 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
Rusc2Q80U22 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
Rusc2Q80U22 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
Rusc2Q80U22 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC45.74■■■■■ 4.91
Rusc2Q80U22 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC45.72■■■■■ 4.91
Rusc2Q80U22 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
Rusc2Q80U22 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.71■■■■■ 4.91
Rusc2Q80U22 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.9
Rusc2Q80U22 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.57■■■■■ 4.88
Rusc2Q80U22 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.56■■■■■ 4.88
Rusc2Q80U22 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC45.52■■■■■ 4.88
Rusc2Q80U22 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC45.5■■■■■ 4.87
Rusc2Q80U22 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.47■■■■■ 4.87
Rusc2Q80U22 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
Rusc2Q80U22 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC45.38■■■■■ 4.86
Rusc2Q80U22 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.86
Rusc2Q80U22 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
Rusc2Q80U22 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
Rusc2Q80U22 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
Rusc2Q80U22 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
Rusc2Q80U22 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
Rusc2Q80U22 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC45.2■■■■■ 4.83
Rusc2Q80U22 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC45.19■■■■■ 4.82
Rusc2Q80U22 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.18■■■■■ 4.82
Rusc2Q80U22 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
Rusc2Q80U22 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.16■■■■■ 4.82
Rusc2Q80U22 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC45.16■■■■■ 4.82
Rusc2Q80U22 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
Rusc2Q80U22 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.82
Rusc2Q80U22 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC45.11■■■■■ 4.81
Rusc2Q80U22 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC45.05■■■■■ 4.8
Rusc2Q80U22 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC45.05■■■■■ 4.8
Rusc2Q80U22 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.02■■■■■ 4.8
Rusc2Q80U22 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
Rusc2Q80U22 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
Rusc2Q80U22 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
Rusc2Q80U22 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC44.87■■■■■ 4.77
Rusc2Q80U22 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
Rusc2Q80U22 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
Rusc2Q80U22 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
Rusc2Q80U22 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC44.78■■■■■ 4.76
Rusc2Q80U22 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC44.77■■■■■ 4.76
Rusc2Q80U22 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
Rusc2Q80U22 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
Rusc2Q80U22 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
Rusc2Q80U22 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
Rusc2Q80U22 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
Rusc2Q80U22 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC44.63■■■■■ 4.73
Rusc2Q80U22 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC44.63■■■■■ 4.73
Rusc2Q80U22 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC44.62■■■■■ 4.73
Rusc2Q80U22 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
Rusc2Q80U22 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
Rusc2Q80U22 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC44.59■■■■■ 4.73
Rusc2Q80U22 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
Rusc2Q80U22 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC44.57■■■■■ 4.72
Rusc2Q80U22 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC44.56■■■■■ 4.72
Rusc2Q80U22 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC44.56■■■■■ 4.72
Rusc2Q80U22 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
Rusc2Q80U22 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
Rusc2Q80U22 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC44.55■■■■■ 4.72
Rusc2Q80U22 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
Rusc2Q80U22 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
Rusc2Q80U22 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC44.49■■■■■ 4.71
Rusc2Q80U22 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
Rusc2Q80U22 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.71
Rusc2Q80U22 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
Rusc2Q80U22 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
Rusc2Q80U22 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
Rusc2Q80U22 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.4■■■■■ 4.7
Rusc2Q80U22 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC44.39■■■■■ 4.7
Rusc2Q80U22 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC44.36■■■■■ 4.69
Rusc2Q80U22 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
Rusc2Q80U22 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
Rusc2Q80U22 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
Rusc2Q80U22 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms