Protein–RNA interactions for Protein: Q80TT8

Cul9, Cullin-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul9Q80TT8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
Cul9Q80TT8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
Cul9Q80TT8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
Cul9Q80TT8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC42.36■■■■■ 4.37
Cul9Q80TT8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC42.34■■■■■ 4.37
Cul9Q80TT8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.34
Cul9Q80TT8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
Cul9Q80TT8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
Cul9Q80TT8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC42.04■■■■■ 4.32
Cul9Q80TT8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
Cul9Q80TT8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC42.01■■■■■ 4.32
Cul9Q80TT8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
Cul9Q80TT8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
Cul9Q80TT8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.31
Cul9Q80TT8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
Cul9Q80TT8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
Cul9Q80TT8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
Cul9Q80TT8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC41.86■■■■■ 4.29
Cul9Q80TT8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
Cul9Q80TT8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
Cul9Q80TT8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
Cul9Q80TT8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
Cul9Q80TT8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
Cul9Q80TT8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
Cul9Q80TT8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
Cul9Q80TT8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
Cul9Q80TT8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
Cul9Q80TT8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC41.58■■■■■ 4.25
Cul9Q80TT8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC41.53■■■■■ 4.24
Cul9Q80TT8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
Cul9Q80TT8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
Cul9Q80TT8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
Cul9Q80TT8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC41.48■■■■■ 4.23
Cul9Q80TT8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.47■■■■■ 4.23
Cul9Q80TT8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
Cul9Q80TT8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC41.46■■■■■ 4.23
Cul9Q80TT8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
Cul9Q80TT8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
Cul9Q80TT8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC41.39■■■■■ 4.22
Cul9Q80TT8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
Cul9Q80TT8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
Cul9Q80TT8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC41.33■■■■■ 4.21
Cul9Q80TT8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
Cul9Q80TT8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
Cul9Q80TT8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Cul9Q80TT8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC41.21■■■■■ 4.19
Cul9Q80TT8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
Cul9Q80TT8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
Cul9Q80TT8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
Cul9Q80TT8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC41.07■■■■■ 4.16
Cul9Q80TT8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
Cul9Q80TT8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
Cul9Q80TT8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
Cul9Q80TT8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
Cul9Q80TT8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC41■■■■■ 4.15
Cul9Q80TT8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC40.96■■■■■ 4.15
Cul9Q80TT8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
Cul9Q80TT8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
Cul9Q80TT8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
Cul9Q80TT8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC40.91■■■■■ 4.14
Cul9Q80TT8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC40.9■■■■■ 4.14
Cul9Q80TT8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
Cul9Q80TT8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC40.82■■■■■ 4.13
Cul9Q80TT8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
Cul9Q80TT8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC40.77■■■■■ 4.12
Cul9Q80TT8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
Cul9Q80TT8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC40.75■■■■■ 4.11
Cul9Q80TT8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.74■■■■■ 4.11
Cul9Q80TT8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.74■■■■■ 4.11
Cul9Q80TT8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
Cul9Q80TT8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
Cul9Q80TT8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
Cul9Q80TT8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
Cul9Q80TT8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
Cul9Q80TT8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
Cul9Q80TT8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC40.66■■■■■ 4.1
Cul9Q80TT8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.65■■■■■ 4.1
Cul9Q80TT8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
Cul9Q80TT8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC40.58■■■■■ 4.09
Cul9Q80TT8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
Cul9Q80TT8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Cul9Q80TT8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC40.51■■■■■ 4.08
Cul9Q80TT8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
Cul9Q80TT8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC40.49■■■■■ 4.07
Cul9Q80TT8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
Cul9Q80TT8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
Cul9Q80TT8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
Cul9Q80TT8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
Cul9Q80TT8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Cul9Q80TT8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
Cul9Q80TT8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC40.41■■■■■ 4.06
Cul9Q80TT8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Cul9Q80TT8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
Cul9Q80TT8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC40.32■■■■■ 4.05
Cul9Q80TT8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
Cul9Q80TT8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
Cul9Q80TT8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
Cul9Q80TT8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC40.27■■■■■ 4.04
Cul9Q80TT8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Cul9Q80TT8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms