Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC61.33■■■■■ 7.41
NischQ80TM9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC61.3■■■■■ 7.4
NischQ80TM9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC61.22■■■■■ 7.39
NischQ80TM9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.19■■■■■ 7.39
NischQ80TM9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.11■■■■■ 7.37
NischQ80TM9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.1■■■■■ 7.37
NischQ80TM9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.07■■■■■ 7.37
NischQ80TM9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.04■■■■■ 7.36
NischQ80TM9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.03■■■■■ 7.36
NischQ80TM9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.92■■■■■ 7.34
NischQ80TM9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.77■■■■■ 7.32
NischQ80TM9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.76■■■■■ 7.32
NischQ80TM9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.75■■■■■ 7.32
NischQ80TM9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC60.62■■■■■ 7.29
NischQ80TM9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC60.55■■■■■ 7.28
NischQ80TM9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC60.54■■■■■ 7.28
NischQ80TM9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.49■■■■■ 7.27
NischQ80TM9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC60.44■■■■■ 7.27
NischQ80TM9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC60.41■■■■■ 7.26
NischQ80TM9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC60.38■■■■■ 7.26
NischQ80TM9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.34■■■■■ 7.25
NischQ80TM9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC60.33■■■■■ 7.25
NischQ80TM9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC60.28■■■■■ 7.24
NischQ80TM9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC60.27■■■■■ 7.24
NischQ80TM9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.25■■■■■ 7.24
NischQ80TM9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.24■■■■■ 7.23
NischQ80TM9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.22■■■■■ 7.23
NischQ80TM9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.21■■■■■ 7.23
NischQ80TM9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.09■■■■■ 7.21
NischQ80TM9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC60.07■■■■■ 7.21
NischQ80TM9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC60.06■■■■■ 7.2
NischQ80TM9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC60.03■■■■■ 7.2
NischQ80TM9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC59.98■■■■■ 7.19
NischQ80TM9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC59.97■■■■■ 7.19
NischQ80TM9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC59.97■■■■■ 7.19
NischQ80TM9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.96■■■■■ 7.19
NischQ80TM9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC59.95■■■■■ 7.19
NischQ80TM9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC59.87■■■■■ 7.17
NischQ80TM9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC59.72■■■■■ 7.15
NischQ80TM9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC59.7■■■■■ 7.15
NischQ80TM9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.7■■■■■ 7.15
NischQ80TM9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.7■■■■■ 7.15
NischQ80TM9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC59.67■■■■■ 7.14
NischQ80TM9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC59.63■■■■■ 7.14
NischQ80TM9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC59.61■■■■■ 7.13
NischQ80TM9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC59.59■■■■■ 7.13
NischQ80TM9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC59.56■■■■■ 7.13
NischQ80TM9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC59.54■■■■■ 7.12
NischQ80TM9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.54■■■■■ 7.12
NischQ80TM9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC59.52■■■■■ 7.12
NischQ80TM9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC59.49■■■■■ 7.11
NischQ80TM9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC59.47■■■■■ 7.11
NischQ80TM9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC59.43■■■■■ 7.1
NischQ80TM9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC59.35■■■■■ 7.09
NischQ80TM9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.32■■■■■ 7.09
NischQ80TM9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC59.31■■■■■ 7.09
NischQ80TM9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC59.25■■■■■ 7.08
NischQ80TM9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC59.25■■■■■ 7.08
NischQ80TM9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC59.21■■■■■ 7.07
NischQ80TM9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC59.19■■■■■ 7.07
NischQ80TM9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.17■■■■■ 7.06
NischQ80TM9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.15■■■■■ 7.06
NischQ80TM9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC58.96■■■■■ 7.03
NischQ80TM9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC58.82■■■■■ 7.01
NischQ80TM9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.8■■■■■ 7
NischQ80TM9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.78■■■■■ 7
NischQ80TM9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC58.75■■■■■ 7
NischQ80TM9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC58.75■■■■■ 7
NischQ80TM9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC58.74■■■■■ 6.99
NischQ80TM9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.73■■■■■ 6.99
NischQ80TM9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.64■■■■■ 6.98
NischQ80TM9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC58.63■■■■■ 6.98
NischQ80TM9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.63■■■■■ 6.98
NischQ80TM9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC58.62■■■■■ 6.97
NischQ80TM9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.57■■■■■ 6.97
NischQ80TM9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.57■■■■■ 6.97
NischQ80TM9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC58.54■■■■■ 6.96
NischQ80TM9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC58.53■■■■■ 6.96
NischQ80TM9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.52■■■■■ 6.96
NischQ80TM9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC58.5■■■■■ 6.96
NischQ80TM9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC58.5■■■■■ 6.95
NischQ80TM9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC58.46■■■■■ 6.95
NischQ80TM9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC58.45■■■■■ 6.95
NischQ80TM9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC58.45■■■■■ 6.95
NischQ80TM9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC58.45■■■■■ 6.95
NischQ80TM9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC58.44■■■■■ 6.95
NischQ80TM9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC58.35■■■■■ 6.93
NischQ80TM9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC58.33■■■■■ 6.93
NischQ80TM9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC58.32■■■■■ 6.93
NischQ80TM9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.3■■■■■ 6.92
NischQ80TM9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC58.25■■■■■ 6.92
NischQ80TM9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC58.23■■■■■ 6.91
NischQ80TM9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC58.19■■■■■ 6.91
NischQ80TM9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC58.17■■■■■ 6.9
NischQ80TM9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.13■■■■■ 6.9
NischQ80TM9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC58.12■■■■■ 6.9
NischQ80TM9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC58.12■■■■■ 6.9
NischQ80TM9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC58.09■■■■■ 6.89
NischQ80TM9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC58.07■■■■■ 6.89
NischQ80TM9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC58.03■■■■■ 6.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms