Protein–RNA interactions for Protein: Q80TH2

Erbin, Erbin, mousemouse

Predictions only

Length 1,402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ErbinQ80TH2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC40,5■■■■■ 4,07
ErbinQ80TH2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC40,49■■■■■ 4,07
ErbinQ80TH2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,48■■■■■ 4,07
ErbinQ80TH2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC40,45■■■■■ 4,07
ErbinQ80TH2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,44■■■■■ 4,06
ErbinQ80TH2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,41■■■■■ 4,06
ErbinQ80TH2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC40,39■■■■■ 4,06
ErbinQ80TH2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,35■■■■■ 4,05
ErbinQ80TH2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,35■■■■■ 4,05
ErbinQ80TH2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40,32■■■■■ 4,04
ErbinQ80TH2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,28■■■■■ 4,04
ErbinQ80TH2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC40,24■■■■■ 4,03
ErbinQ80TH2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,21■■■■■ 4,03
ErbinQ80TH2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,2■■■■■ 4,03
ErbinQ80TH2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC40,18■■■■■ 4,02
ErbinQ80TH2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC40,04■■■■■ 4
ErbinQ80TH2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40,04■■■■■ 4
ErbinQ80TH2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC39,92■■■■□ 3,98
ErbinQ80TH2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,91■■■■□ 3,98
ErbinQ80TH2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,89■■■■□ 3,98
ErbinQ80TH2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC39,88■■■■□ 3,97
ErbinQ80TH2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,86■■■■□ 3,97
ErbinQ80TH2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,84■■■■□ 3,97
ErbinQ80TH2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,81■■■■□ 3,96
ErbinQ80TH2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,76■■■■□ 3,95
ErbinQ80TH2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC39,75■■■■□ 3,95
ErbinQ80TH2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC39,73■■■■□ 3,95
ErbinQ80TH2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC39,65■■■■□ 3,94
ErbinQ80TH2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,53■■■■□ 3,92
ErbinQ80TH2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39,51■■■■□ 3,92
ErbinQ80TH2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC39,5■■■■□ 3,91
ErbinQ80TH2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,48■■■■□ 3,91
ErbinQ80TH2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC39,47■■■■□ 3,91
ErbinQ80TH2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC39,45■■■■□ 3,91
ErbinQ80TH2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,42■■■■□ 3,9
ErbinQ80TH2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC39,41■■■■□ 3,9
ErbinQ80TH2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,38■■■■□ 3,9
ErbinQ80TH2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC39,38■■■■□ 3,89
ErbinQ80TH2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,35■■■■□ 3,89
ErbinQ80TH2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC39,34■■■■□ 3,89
ErbinQ80TH2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,34■■■■□ 3,89
ErbinQ80TH2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,33■■■■□ 3,89
ErbinQ80TH2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC39,33■■■■□ 3,89
ErbinQ80TH2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,33■■■■□ 3,89
ErbinQ80TH2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,32■■■■□ 3,89
ErbinQ80TH2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC39,31■■■■□ 3,88
ErbinQ80TH2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC39,31■■■■□ 3,88
ErbinQ80TH2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,28■■■■□ 3,88
ErbinQ80TH2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC39,21■■■■□ 3,87
ErbinQ80TH2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC39,19■■■■□ 3,86
ErbinQ80TH2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC39,14■■■■□ 3,86
ErbinQ80TH2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,11■■■■□ 3,85
ErbinQ80TH2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,11■■■■□ 3,85
ErbinQ80TH2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,1■■■■□ 3,85
ErbinQ80TH2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,09■■■■□ 3,85
ErbinQ80TH2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,06■■■■□ 3,84
ErbinQ80TH2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,01■■■■□ 3,83
ErbinQ80TH2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38,97■■■■□ 3,83
ErbinQ80TH2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC38,97■■■■□ 3,83
ErbinQ80TH2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC38,96■■■■□ 3,83
ErbinQ80TH2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC38,95■■■■□ 3,83
ErbinQ80TH2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC38,92■■■■□ 3,82
ErbinQ80TH2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,88■■■■□ 3,82
ErbinQ80TH2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC38,87■■■■□ 3,81
ErbinQ80TH2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,84■■■■□ 3,81
ErbinQ80TH2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,81■■■■□ 3,8
ErbinQ80TH2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38,8■■■■□ 3,8
ErbinQ80TH2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,76■■■■□ 3,8
ErbinQ80TH2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,76■■■■□ 3,8
ErbinQ80TH2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC38,72■■■■□ 3,79
ErbinQ80TH2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC38,7■■■■□ 3,79
ErbinQ80TH2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC38,69■■■■□ 3,78
ErbinQ80TH2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC38,65■■■■□ 3,78
ErbinQ80TH2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC38,59■■■■□ 3,77
ErbinQ80TH2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC38,58■■■■□ 3,77
ErbinQ80TH2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC38,58■■■■□ 3,77
ErbinQ80TH2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC38,56■■■■□ 3,76
ErbinQ80TH2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC38,55■■■■□ 3,76
ErbinQ80TH2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38,54■■■■□ 3,76
ErbinQ80TH2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,52■■■■□ 3,76
ErbinQ80TH2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,52■■■■□ 3,76
ErbinQ80TH2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC38,51■■■■□ 3,76
ErbinQ80TH2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC38,48■■■■□ 3,75
ErbinQ80TH2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,46■■■■□ 3,75
ErbinQ80TH2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC38,46■■■■□ 3,75
ErbinQ80TH2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC38,44■■■■□ 3,74
ErbinQ80TH2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC38,44■■■■□ 3,74
ErbinQ80TH2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC38,38■■■■□ 3,74
ErbinQ80TH2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC38,38■■■■□ 3,73
ErbinQ80TH2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC38,35■■■■□ 3,73
ErbinQ80TH2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC38,35■■■■□ 3,73
ErbinQ80TH2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38,34■■■■□ 3,73
ErbinQ80TH2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38,33■■■■□ 3,73
ErbinQ80TH2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,32■■■■□ 3,72
ErbinQ80TH2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,31■■■■□ 3,72
ErbinQ80TH2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC38,31■■■■□ 3,72
ErbinQ80TH2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,3■■■■□ 3,72
ErbinQ80TH2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC38,28■■■■□ 3,72
ErbinQ80TH2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,25■■■■□ 3,71
ErbinQ80TH2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC38,23■■■■□ 3,71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7,7 ms