Protein–RNA interactions for Protein: Q80TE0

Rpap1, RNA polymerase II-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap1Q80TE0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC45,06■■■■■ 4,8
Rpap1Q80TE0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,05■■■■■ 4,8
Rpap1Q80TE0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC45,04■■■■■ 4,8
Rpap1Q80TE0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC44,98■■■■■ 4,79
Rpap1Q80TE0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44,98■■■■■ 4,79
Rpap1Q80TE0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,96■■■■■ 4,79
Rpap1Q80TE0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,94■■■■■ 4,78
Rpap1Q80TE0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,89■■■■■ 4,78
Rpap1Q80TE0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,87■■■■■ 4,77
Rpap1Q80TE0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,83■■■■■ 4,77
Rpap1Q80TE0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC44,82■■■■■ 4,76
Rpap1Q80TE0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,78■■■■■ 4,76
Rpap1Q80TE0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,77■■■■■ 4,76
Rpap1Q80TE0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,73■■■■■ 4,75
Rpap1Q80TE0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,64■■■■■ 4,74
Rpap1Q80TE0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC44,64■■■■■ 4,74
Rpap1Q80TE0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC44,56■■■■■ 4,72
Rpap1Q80TE0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC44,54■■■■■ 4,72
Rpap1Q80TE0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,51■■■■■ 4,72
Rpap1Q80TE0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44,49■■■■■ 4,71
Rpap1Q80TE0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,42■■■■■ 4,7
Rpap1Q80TE0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,38■■■■■ 4,7
Rpap1Q80TE0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC44,34■■■■■ 4,69
Rpap1Q80TE0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44,32■■■■■ 4,69
Rpap1Q80TE0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC44,31■■■■■ 4,68
Rpap1Q80TE0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC44,28■■■■■ 4,68
Rpap1Q80TE0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,25■■■■■ 4,67
Rpap1Q80TE0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44,18■■■■■ 4,66
Rpap1Q80TE0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC44,16■■■■■ 4,66
Rpap1Q80TE0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,15■■■■■ 4,66
Rpap1Q80TE0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,13■■■■■ 4,66
Rpap1Q80TE0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,11■■■■■ 4,65
Rpap1Q80TE0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC44,1■■■■■ 4,65
Rpap1Q80TE0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC44,09■■■■■ 4,65
Rpap1Q80TE0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44,09■■■■■ 4,65
Rpap1Q80TE0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC44,08■■■■■ 4,65
Rpap1Q80TE0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC44,07■■■■■ 4,64
Rpap1Q80TE0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC43,99■■■■■ 4,63
Rpap1Q80TE0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC43,99■■■■■ 4,63
Rpap1Q80TE0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,95■■■■■ 4,63
Rpap1Q80TE0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC43,94■■■■■ 4,62
Rpap1Q80TE0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC43,9■■■■■ 4,62
Rpap1Q80TE0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,89■■■■■ 4,62
Rpap1Q80TE0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC43,81■■■■■ 4,6
Rpap1Q80TE0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC43,79■■■■■ 4,6
Rpap1Q80TE0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC43,76■■■■■ 4,6
Rpap1Q80TE0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC43,73■■■■■ 4,59
Rpap1Q80TE0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC43,71■■■■■ 4,59
Rpap1Q80TE0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43,69■■■■■ 4,58
Rpap1Q80TE0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43,65■■■■■ 4,58
Rpap1Q80TE0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC43,63■■■■■ 4,57
Rpap1Q80TE0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,62■■■■■ 4,57
Rpap1Q80TE0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,61■■■■■ 4,57
Rpap1Q80TE0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,61■■■■■ 4,57
Rpap1Q80TE0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC43,6■■■■■ 4,57
Rpap1Q80TE0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC43,59■■■■■ 4,57
Rpap1Q80TE0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC43,58■■■■■ 4,57
Rpap1Q80TE0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC43,54■■■■■ 4,56
Rpap1Q80TE0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,53■■■■■ 4,56
Rpap1Q80TE0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,5■■■■■ 4,55
Rpap1Q80TE0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,46■■■■■ 4,55
Rpap1Q80TE0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43,43■■■■■ 4,54
Rpap1Q80TE0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC43,39■■■■■ 4,54
Rpap1Q80TE0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43,37■■■■■ 4,53
Rpap1Q80TE0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43,31■■■■■ 4,52
Rpap1Q80TE0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,26■■■■■ 4,52
Rpap1Q80TE0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,25■■■■■ 4,51
Rpap1Q80TE0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,24■■■■■ 4,51
Rpap1Q80TE0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC43,21■■■■■ 4,51
Rpap1Q80TE0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43,21■■■■■ 4,51
Rpap1Q80TE0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,21■■■■■ 4,51
Rpap1Q80TE0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC43,17■■■■■ 4,5
Rpap1Q80TE0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43,14■■■■■ 4,5
Rpap1Q80TE0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,13■■■■■ 4,49
Rpap1Q80TE0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,11■■■■■ 4,49
Rpap1Q80TE0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC43,05■■■■■ 4,48
Rpap1Q80TE0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC43,02■■■■■ 4,48
Rpap1Q80TE0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43,01■■■■■ 4,48
Rpap1Q80TE0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,01■■■■■ 4,48
Rpap1Q80TE0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4,47
Rpap1Q80TE0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC42,98■■■■■ 4,47
Rpap1Q80TE0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC42,97■■■■■ 4,47
Rpap1Q80TE0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC42,96■■■■■ 4,47
Rpap1Q80TE0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC42,94■■■■■ 4,46
Rpap1Q80TE0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC42,92■■■■■ 4,46
Rpap1Q80TE0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,92■■■■■ 4,46
Rpap1Q80TE0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC42,89■■■■■ 4,46
Rpap1Q80TE0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC42,87■■■■■ 4,45
Rpap1Q80TE0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC42,84■■■■■ 4,45
Rpap1Q80TE0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC42,81■■■■■ 4,44
Rpap1Q80TE0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,8■■■■■ 4,44
Rpap1Q80TE0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC42,79■■■■■ 4,44
Rpap1Q80TE0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC42,79■■■■■ 4,44
Rpap1Q80TE0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC42,74■■■■■ 4,43
Rpap1Q80TE0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC42,72■■■■■ 4,43
Rpap1Q80TE0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC42,71■■■■■ 4,43
Rpap1Q80TE0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42,71■■■■■ 4,43
Rpap1Q80TE0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,71■■■■■ 4,43
Rpap1Q80TE0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC42,7■■■■■ 4,43
Rpap1Q80TE0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,69■■■■■ 4,42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,4 ms